Gestern vergessen, kurz zu mir:
Schulzeit 100% mit Zeichnen und Malen verbracht, dann lieber Molekularbiologie statt Design studiert;

Erstes Ziel am human Genomprojekt mitarbeiten, Praktikum am @MPI_MolGen. I ♥️Laborbuch schreiben Seite aus einem Laborbuch m...Foto eines LaborbuchsZeichung Menschen
Mein PhD @embl zur Regulierung von Genexpression: viele Bilder gemacht.
Als Wissenschaftlerin @mpicbg: >55.000 Bilder gemacht (genomweiter Screen).

💥mein Design-Hintergrund ist doch ganz praktisch, für die Visualisierung von solch großen Datensätzen!
Seitdem kombiniere ich Design und Wissenschaft --> wissenschaftliche Datenvisualisierung!
🎨+ 🧪+ 💻

Jetzt: Expertin für wissenschaftliche DataViz, z.Zt. Uniklinik @tudresden_de, Workshops überall, Dozentin Bioinformatik @BeuthHS.
Claim: ich visualisiere alles, was nicht bei drei auf dem Baum ist;
Übersichten zu Forschungsartikeln (sog. Graphical Abstracts) - die geben visuell die Hauptergebnisse wieder. CAR T-Zellen Therapie Ablaufjames Saenz, 2020, Artikel ...
🛠️Alert: die kommerzielle Plattform biorender.com erlaubt auch Laien da was gutes hinzukriegen für die Biologie,

Gemeinfrei (CC0) sind Icons der Biologie hier zu haben:
bioicons.com
Ich erstelle Abbildungen zu großen Datensätzen, zB wie sich Lipide in Membranen an veränderter Umgebung anpassen (Bakterien).
Wenn das nicht passiert, würden die Zellen platzen/schrumpfen weil Stoffaustausch eingeschränkt ist - bis heute unklar wie es reguliert wird. Image
Wir nutzen Visualisierunge um Phänomene, die wir selber gerade erst entdecken, begreifbar zu machen:

Klonale Hämatopoese = Ansammlung somatischer Mutationen, v.a. beim Altern. Haematopose und Effekt von ...
Wenn man das biologische Alter von Zellen weiss, kann man besser entscheiden ob diese geeignet sind für eine Zelltherapien z.B. bei Leukämie AML ALL etc.

[Artikel mit @NCT_UCC_DD, rdcu.be/cnClj ]
Wir visualisieren auch klinischen Studien - beteiligte Ärzt*innen verstehen dann schneller wie und was getestet wird.

Jetzt untersuchen wir, ob solche Diagramme auch die Patientenkommunikation verbessern kann, vor allem bei langen (>2 Jahre) Therapieplänen z.B. Leukämien. Image
Statt solchen Dingern (oder GAR KEINEN VISUALISIERUNGEN, kommt auch vor) Image
Lieber so was:
Farbe systematisch einsetzen, Piktogramme zur schnellen Orientierung, Zeit auf die x-Achse wie üblich, und Text konsoliedieren.
-> weniger Platz braucht es ausserdem Clinical Trial Schemata

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22 Jul
Bei den vielen Beispielen zu Decluttering haben wir prima gesehen, dass ALLE Aspekte einer Darstellung mal unter die Lupe müssen:

- Chart-typ (Display type) ok?
- Text genug/klar?
- passt Layout?
- sind Farben ok?

Ich geb meinen Studenten immer die Figure-Checklist: Image
Chart type haben wir gestern schon abgefrühstückt, dann kommen wir jetzt also zum Text.
das hier ist problematisch, hatten wir gestern schon.
Ein minumaler Text muss sein... Image
Read 8 tweets
22 Jul
Ein paar Beispiele zum Arufrämen von Charts - "Decluttering".
(c) DarkHorseAnalystics

Decluttering Beispiel: Balkendiagramm.

PS Ich würd die Achsenbeschriftung noch da lassen...
Vorher und Nacher ImageImage
Decluttering Beispiel: TABELLE

(c) DarkHorseAnalystics
Read 17 tweets
22 Jul
Gestern haben wir für unsere Daten einen passenden Charttyp rausgesucht - für alle nochmal hier zur Erinnerung der Spickzettel dazu:

(ps ich abe keine offene Version, da wäre eine DE Übersetzung vielleicht auch gut!) Image
PS EINEN passenden Charttyp, nicht DEN passenden Charttyp, es gibt immer mehrere richtige Lösungen

Das muss je nach: Kernaussage, nach Zielpublikum, nach Interaktionsformat: Papier, interaktiv Java, in einem Forschungsartikel oder 15-sek TikTok, angepasst werden!
Abstrakte Kunst und wissenenschaflichen Abbildungen sind gar nicht so unähnlich...

Was ist hier was? Zwei abstrakte Bilder
Read 21 tweets
21 Jul
Zur Krönung des Tages meine Top10-Charts der Chart-krisen..

Also, was sind die TOP10 Fehler die ich immer wieder sehe und immer wieder verbessere und mir immer wieder den Mund fusselig rede?
#Platz 10: Falsche Charttyp für die Daten.
...da seid ihr ja schon alte Hasen nach heute.

Vielleicht als letztes Beispiel noch das hier aus der Zeit: Image
#Platz9: keine (unvollständige) Beschriftung.

Merke: nicht nur Achsen brauchen eine Beschriftung sondern auch Farbcodes müssen erklärt werden!

Unten: eine der #worstchartsever und ein Abbildung ohne Farbcode, publiziert in nature... 🙄 Image
Read 32 tweets
21 Jul
Wir macht man gute Charts?

1. eigenen Datentyp kennen (Trend? Kategorie? Verteilung? Uni-, Bi, Multivariat?)
2. verschiendes ausprobieren, z.B. mit dem Chart-Selektor unten
3. dann Feedback einholen! --> loop to 1 Image
Eigentlich ist es ganz leicht.

Für Einzelbeobachtungen in Kategorien kann man die Größe in
- Länge (Balkendiagramm, stacked bar)
- Fläche (Tree map, bubble, area char)
- Tortenstücke (Pie chart, lieber nicht Donuts!)
kodieren. Image
Bei der Visualisierung von Trends kann man
- Liniendiagramm (paar Beobachtungen, mehrere Zeitpunkte)
- Slopechart (nur 2 Zeitpunkte)
- Radar Chart (zyklische Daten)
- Sankey Diagram (viele Verläufe, Verteilungen)
nutzen.

(merke, Time ist immer irgendwie 'ne Line!) Image
Read 14 tweets
21 Jul
Wir sind uns hier jetzt einig, dass Visualisierungen oft sinnvoll sind für Daten.

Aber welche Visualisierung ist die richtige? Es gibt hunderte,.... lasst uns mal ein paar angucken.

Es gibt hunderte solcher Übersichten:
(c)Anna Vital Übersicht verschiedener Charts
Eine gute Übersicht bietet Severino RIbecca mit dem @dataviz_catalog ♥️♥️♥️

Jeder Chart-Typ wird erklärt, es gibt educational videos, Hinweis auf 🛠️Tools mit denen man die Vis erstellen kann etc

datavizcatalogue.com/index.html
Ebenfalls ganz gut ist
datavizproject.com,
Read 13 tweets

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