H τεχνική #PCR που έγινε γνωστή στο σύνολο του κόσμου λόγω της χρήσης της για την ανίχνευση του #SARSCoV2 , στηρίζεται στο γεγονός ότι το γενετικό υλικό μπορεί με κατάλληλα ένζυμα να αντιγραφεί και σε δοκιμαστικό σωλήνα όπως και στον οργανισμό μας.
H PCR μπορεί να ενισχύσει(πολλαπλασιάσει) και να ανιχνεύσει συγκεκριμένη αλληλουχία γενετικού υλικού. Αποτελεί μια εξαιρετικά ευαίσθητη τεχνική .Η #realtime#RTPCR είναι τεχνική που επιτρέπει τον ποσοτικό προσδιορισμό #mRNAsciencedirect.com/science/articl…
Στην τεχνική αυτή ακολουθούνται τρία βήματα: (i) της αντίστροφης μεταγραφής (RT) - μετατροπής του RNA σε cDNA, (ii) της ενίσχυσης του cDNA χρησιμοποιώντας την PCR και (iii) της ανίχνευσης και ποσοτικοποίησης των προϊόντων ενίσχυσης σε πραγματικό χρόνο.nature.com/articles/nprot…
Για την ποσοτικοποίηση χρησιμοποιούνται ειδικοί ανιχνευτές που παράγουν σήμα φθορισμού κατά τη διάρκεια των κύκλων PCR (π.χ ανιχνευτής TaqMan).H αύξηση του φθορισμού είναι ανάλογη της αύξησης της συγκέντρωσης του ενισχυμένου προϊόντος, που προκύπτει κατά τη διάρκεια της PCR.
Στην multiplex PCR, διαφορετικές επιθυμητές αλληλουχίες DΝΑ μπορούν να ενισχυθούν ταυτόχρονα χρησιμοποιώντας πολλαπλά ζεύγη εκκινητών μέσα σε ένα αντιδρών μείγμα . Με αυτή την τεχνική μπορεί να βελτιωθεί η διαγνωστική ευαισθησία και αξιοπιστία. .old.abmgood.com/marketing/know…
Για παράδειγμα, υπάρχει εγκεκριμένη από FDA RealTime SARS-CoV-2 Abbott PCR για την ποσοτική αναγνώριση των γονιδίων RdRp και Ν.H Rutgers Clinical Genomics Laboratory ανέπτυξε έναν προσδιορισμό RT-PCR που χρησιμοποιεί αυτο-συλλεγόμενα δείγματα σιέλου για τη διάγνωση
COVID-19 , και ανιχνεύει ταυτόχρονα γονίδια ORF1ab, N και S. Το τεστ είναι ανώδυνο, εμφανίζει γρήγορη συλλογή δειγμάτων, και χαμηλότερο κίνδυνο έκθεσης στο προσωπικό υγειονομικής περίθαλψης, αλλά υψηλότερη κλινική ευαισθησία και ειδικότητα.rutgers.edu/news/new-rutge…
Επίσης ο CDC (13/7/21)αναφέρει Multiplex δοκιμασία (RT-PCR) που ανιχνεύει ταυτόχρονα το RNA του SARS-CoV-2, ιού της γρίπης Α και της γρίπης Β σε δείγματα ανώτερου ή κατώτερου αναπνευστικού.cdc.gov/coronavirus/20…
“Οι επτά δεσμοί υδρογόνου που προστατεύουν τη ζωή ”
Στη βιοχημεία οι διαμοριακες αλληλεπιδράσεις είναι καθοριστικες για την ίδια τη ζωή !!
Αφορμή για το παρακάτω είναι μια πρόσφατη δημοσίευση για το φάρμακο κατά του HIV το Lenacapavir (LEN). To LEN είναι ένα φάρμακο
που έχει σχεδόν 100% αποτελεσματικότητα ,στις κλινικές δοκιμές, στην πρόληψη του HIV.(1) H αποτελεσματικότητα του οφείλεται σε διαμοριακές αλληλεπιδράσεις μεταξύ του δραστικού μοριου και των πρωτεϊνών του καψιδίου του ιού.
Ο ιός HIV ,έχει ένα καψιδιο (περίβλημα) που προστατεύει το γονιδίωμα του και τα ένζυμα του καθώς ο ιός μολύνει αλλά κύτταρα αλλά και καθώς μεταφέρεται στον πυρήνα του κυττάρου ξενιστή . Αυτό το περίβλημα είναι μια δομή σε σχήμα κώνου,που αποτελείται από επαναλαμβανόμενες μονάδες
Ένα ακόμα καλοκαιρινό 🧵
" Φαινόμενο ούζο "
✅Το φαινόμενο του ούζου , του γνωστού θολωματος ,εμφανίζεται σε ποτά με αλκοόλη αρωματισμένη με γλυκάνισο .
✅Η χαρακτηριστική γεύση αυτών των ποτών είναι αποτέλεσμα του εκχυλίσματος γλυκάνισου, τρανς- ανηθόλης .(1)
Όταν αυτά τα ποτά (περίπου 40% v/v αιθανόλη σε νερό και περίπου 1% ανηθόλη) αραιώνονται με νερό , θολώνουν.
➡️Αυτή η αδιαφάνεια οφείλεται στη μείωση της διαλυτότητας και κατά συνέπεια στην καθίζηση των σταγονιδίων της ανηθόλης , που τώρα πια είναι αδιάλυτα .
Η αραίωση ουσιαστικά με το νερό μειώνει τη διαλυτότητα του ελαίου, και οδηγεί στο σχηματισμό πολλών μικρών σταγονιδίων ελαίου (1), χωρίς την ανάγκη μηχανικής ανάδευσης ή άλλων επιφανειοδραστικών συστατικών .
Τελικά έχουμε ένα γαλάκτωμα ( Θόλωμα ) σταθερό, όπου η κατανομή
🙊Η χαρακτηριστική μυρωδιά που συχνά αποδίδεται στο χλώριο των κολυμβητικών δεξαμενών δεν σχετίζεται άμεσα με το ελεύθερο "χλώριο"(ΗΟCl, υποχλωριωδες οξύ ) , αλλά κυρίως με τα υποπροϊόντα της αντίδρασής του με οργανικούς ρύπους, όπως ιδρώτας, ούρα, σάλιο
Οι βασικές ενώσεις που προκύπτουν είναι οι χλωραμίνες — μονοχλωραμίνη (NH₂Cl), διχλωραμίνη (NHCl₂) και τριχλωραμίνη (NCl₃). Η τριχλωραμίνη είναι ιδιαίτερα πτητική και υπεύθυνη για τη χαρακτηριστική "μυρωδιά πισίνας". Σε υψηλές συγκεντρώσεις μπορεί να προκαλέσει ερεθισμό
στα μάτια, στον φάρυγγα και στους πνεύμονες . Η παρουσία της σχετίζεται με την κακή ισορροπία μεταξύ οργανικού φορτίου και χημικής απολύμανσης.
➡️ Το ντους πριν από την είσοδο στην πισίνα μπορεί να βοηθήσει στην ελαχιστοποίηση του σχηματισμού αυτών των δύο χλωραμινών.
Νέα μελέτη δείχνει ότι η λοίμωξη από SARS-CoV-2 μπορεί να αφήσει μακροχρόνιο επιγενετικό αποτύπωμα στο ανοσοποιητικό σύστημα.
Ακόμα και 7 μήνες μετά τη μόλυνση.
Οι ερευνητές ανέλυσαν τη μεθυλίωση DNA σε δείγματα αίματος και βρήκαν σημαντικές αλλαγές σε γονίδια που σχετίζονται με την ανοσολογική απόκριση.
➡️η COVID-19 αφήνει επιγενετικές τροποποιήσεις, δηλαδή αλλαγές στη ρύθμιση των γονιδίων χωρίς να αλλάζει η αλληλουχία του DNA
Η μεθυλίωση του DNA είναι σαν διακόπτης:
"Ανοίγει/κλείνει" γονίδια χωρίς να αλλάζει τη γενετική αλληλουχία.
Ουσιαστικά, αλλάζει πώς "συμπεριφέρεται" το DNA .
✅Βρέθηκαν συγκεκριμένα μοτίβα μεθυλίωσης που:
➡️σχετίζονται με τη σοβαρότητα της νόσου
➡️δείχνουν χρόνια φλεγμονή
Μελέτη αναζητά τη σχέση που έχει η σύνδεση της πρωτεΐνης ακίδας του SARS-CoV-2 με το ινωδογόνο και την αποφυγή της άνοσοαπόκριση του οργανισμού
➡️ Το ινωδογόνο, είναι μια πρωτεΐνη-κλειδί για την πήξη του αίματος.Όταν ενεργοποιείται, μετατρέπεται σε ινώδες και σχηματίζει
θρόμβους .
⚡Η πρωτεΐνη ακίδα του ιού δεσμεύεται με το ινωδογόνο.
Αυτό προκαλεί φλεγμονώδεις θρόμβους, που είναι ανθεκτικοί στη φυσιολογική διάσπαση.
🔬 Οι θρόμβοι αυτοί ➡️Προκαλούν μικροθρομβώσεις και
➡️οδηγούν σε υπερφλεγμονή
Αποτέλεσμα: βλάβη σε όργανα, κυρίως στους πνεύμονες.
⚠️Σύμφωνα με τη μελέτη το ινωδογόνο του ξενιστή αλληλεπιδρά με τον τομέα (NTD) της πρωτεΐνης ακίδας στον SARS-CoV-2. Ωστόσο, αυτό η δέσμευση φαίνεται να είναι μια στρατηγική ανοσοδιαφυγής που