Thread by @influenzer3

●英政府の緊急時科学助言グループ(SAGE)の将来予測
→ワクチン無効の変異株出現は｢ほぼ確実｣だと。
大して驚くべき予想でもありません。

ワクチン接種率が高い国々で感染が持続がして起こっており、ブレイクスルー感染も起こっている以上、ワクチン逃避変異株が出現しないと想定するほうが無理があるでしょう。
感染と増殖が変異の直接原因ですので、感染阻止を目的とする粘膜ワクチンの開発も今後の課題です。

現状の感染拡大の状況では変異株出現が避けられないので、世界中で感染を抑制する必要もあります。
ウィズコロナは、その意味では危険かつ目指すべき戦略でないのは自明だと思いますが、イギリスはその点においてやっている事がやや矛盾している印象です。

ワクチン効かない変異株の出現は「ほぼ確実」、英科学者が予測
cnn.co.jp/world/35174670…

→原文は以下です。
今後に関して、大きく4つの予想シナリオが提示されています。
長いので前半の4つのシナリオ部分だけ、かなりの意訳でまとめました。

重要なのは以下かと思います。
・変異によるワクチン無効 and /or 強毒化等を防ぐために、感染者数を減らすべき。
・上記の目的を達成するために、有効な粘膜免疫誘導ワクチンの開発が必要。
・耐性出現を避けるため、薬物治療は単剤ではなく併用が好ましい。

・ワクチン無効化などの最悪の事態に備え、抗ウイルス薬を温存しておくべき。
・自然界の動物がリザーバーになった場合はかなり最悪。
シナリオ2(5)に出てくる｢抗原原罪｣は抗インフルエンザ免疫で良く知られています。

理屈上は、免疫システムの根本に関連して起こる現象なので、コロナウイルスでも同様の現象が起こるはずだと個人的には思うのですが・・・
Can we predict the limits of SARS-CoV-2 variants and their phenotypic consequences?
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl…

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・SARS-CoV-2の根絶は恐らく不可能だろう。今後も複数の変異株が存在し続けるだろうと、我々は高い確信をもって述べる事ができる。

・変異株の数は感染対策の在り方によって変わるだろう。ここでは、ウイルスがさらに変異する事によって病原性がどう変化しうるのか、その可能性とともに考えられるシナリオを提示する。

(シナリオ1)　これまでの変異株よりもより多くの重症者を出す変異株

(1) 点変異もしくは宿主あるいはウイルスとの遺伝子組み換え
・ポリメラーゼやアクセサリータンパクなど、SARS-CoV-2の内部遺伝子の変化による。これにより、細胞がウイルス感染を感知できなかったり、増殖速度や免疫への抵抗性に影響を与える。

コロナウイルスは宿主やコロナウイルス間、または他のウイルスから遺伝子を獲得できる事が分かっている(There is precedent)。

(2) 2つのVOCあるいはVUIの間での遺伝子組み換え
・ベータ株とアルファ株、あるいはデルタ株間での遺伝子組み換え等により、spike proteinに現在のワクチンとは全く異なる急激な変化が起きたり、内部遺伝子の変化により増殖力や感染力が増強する。

自然免疫を回避するための異なる戦略を持つ変異株間で遺伝子組み換えが起こると、相加相乗的にウイルスの増殖力が高まり、罹患率や死亡率を上昇させる可能性がある。

(可能性)
・内部遺伝子変化の可能性は、SARS-CoV-2が感染持続している間は高い。病原性が増悪する可能性は現実的に高い(Realistic possibility)。
・spike ptoteinに大きな変異がない限り、ワクチンの効果は重症化予防効果を持つと考えられる。

(対策)
・boosterワクチン接種
・変異や組み換えの確率を減らすために、英国内の感染者数を減らす
・他の地域からの変異株の流入を抑える
・動物の監視：必要に応じてワクチン接種、屠殺、隔離
・変異株の病原性が変化しないかモニタリング継続
・予防薬あるいは治療薬の開発

(シナリオ2) ワクチンを回避する変異株
(3) 他のコロナウイルス由来のspike geneの配列の一部が自然組み換えによりspike geneに挿入される(Antigenic ‘shift’)
・これにより現行ワクチンは無効になる。

(可能性)
・可能性は高い(Realistic possibility)。ただし従来のコロナウイルスから遺伝子が挿入された場合には、一部免疫を保有している可能性がある。
(対策)
・変異株に対する新しいワクチンの迅速な開発。

(4) 自然動物がウイルスのリザーバーになり、人獣共通感染症となる
・SARS-CoV-2が動物に感染すると別の選択圧が働き、異なる進化をたどる。そのため動物から感染する場合には、ヒト用のワクチンは無効になる。
(可能性)
・可能性は高い(Realistic possibility)。

(対策)
・ワクチン製造能力の維持と、多彩なコロナウイルスを中和可能なワクチンの開発。
・spike protein以外の抗原をターゲットとした交叉反応性の高いワクチンの開発。

(5) 変異が徐々に蓄積し最終的にワクチン耐性となる(Antigenic drift)
・ゆっくりと変異が蓄積し、最終的にワクチンが無効になる場合。

・最悪のシナリオはこの変異が｢抗原原罪(antigenic sin)｣と組み合わさる場合である。
→抗原原罪は、新規ワクチン接種にも拘わらず、過去の感染に対応する抗体が主として誘導されてしまう現象である。

(可能性)
・Antigenic driftはほぼ避けられない(almost inevitable)。
・SARS-CoV-2における抗原原罪の現象はまだ報告されていないので、可能性は低いと考える。
(対策)
・抗原変異をモニターし、ワクチンを更新する。
・変異の確率を減らすために、英国内の感染者数を減らす。

(シナリオ3) 薬剤耐性ウイルスの出現
(6) 抗ウイルス薬投与後に新しい変異株が出現する
・抗ウイルス薬が使用されるようになれば、耐性ウイルスが出現する可能性が高い。プロテアーゼやポリメラーゼをターゲットにした薬剤や、モノクローナル抗体など。（続く）