שרשור על מה זה Molnupiravir, התרופה החדשה של Merck כנגד Covid19.
יאללה מתחילים.
הדבר הראשון שרואים היא שהתרופה (משמאל) נראית כמו נוקלאוטיד RNA שנקרא Cytidine ומצוי בכל תא של אורגניזם בטבע (מימין).

אגב, איך אני יודע שזה נוקלאוטידים של RNA ולא DNA? רואים למטה כמו שני רגלים עם OH בכל צד? אז אם הרגל הימנית היא OH, זה RNA, ואם היא פשוט H, אז זה DNA. קל!
הדימיון כמעט מושלם חוץ משני מקומות:
השינוי בכחול הוא לא כזה חשוב לענייננו. מדובר בתוספת שיורדת מהר מאד בגוף על ידי אנזים מיוחד ומחזיר אותנו למצב כמו ב Cytidine רגיל.

השינוי ה OH בחלק שסימנתי באדום הוא הקסם של המולקולה הזאת שהופכת אותה מסתם Cytidine לסוכן כאוס.
איך?
אז בוא נזכיר שבגוף יש ארבע סוגי נוקלאוטידים שמהוות את אבני הבניין של דנ״א ורנ״א: Cytidine מיודענו, יחד עם Adenosine' Thymidine*, ו Guanosine או בקיצור: C,A,G,T.
החלק הצבעוני נקרא הבסיס של הנוקלאוטיד ונותן לו את היחודיות שלו.
*ברנ״א יש שינוי קטן ולא מהותי ב Thymidine שנתעלם ממנו.
ארבעת הנוקלואטידים האלה מושכים אחד את השני כמו קטבים של מגנט. האזורים עם קבוצות החנקן-מימן (NH) הם חיובים והאזורים עם קבוצות החמצן (O) הם שלילים.
ככה יש שתי זוגות:
א C מתחבר עם G
ב A מתחבר עם T
וככה חברים אפשר ליצור סליל כפול ולשכפל מולקולות דנ״א ורנ״א!
בוא רגע נעצור ונפנים את הפרט המרגש הזה שהוא הבסיס לחיים על כדור הארץ.
חזרה ל Molnupiravir!
התוספת באדום יוצרת יכולות חדשות. כמו הנוכלים של חיים אתגר התרופה נראית כמו נוקלאוטיד נורמלי מבחינת מכונות השכפול של הוירוס והוא מכניס אותו לגנום שלו כאילו הוא C רגיל.
אבל שהוירוס ישכפל את עצמו, התוספת הקטנה גורמת שבמקום ש G יתחבר מולה, A יתחבר!
רגע. למה זה כזה חשוב?
כי גרמנו לוירוס לעשות טעות בקוד הגנטי שלו. במקום לשים G מול C הוא שם A בכל פעם שהתרופה הקטנה נכנסה לו לגנום. ושיש לוירוס המון טעויות בגנום, אין לו שום יכולת יותר לקודד את מכונות השכפול שלו ולכן הוא סתם מולקולת RNA שזרוקה בתא שתוך כמה שעות תתפרק.
🧬⬅️🗑️
אגב, הרבה תרופות אנטי-ויראליות עובדות על עיקרון דומה:
לתת נוקלאוטיד משונה לוירוס שמשתכפל באמוק כדי שיהרוס את עצמו בתהליך. רמדסיביר הוא נוקלאוטיד דומה מאד ל A רק במקרה שלו הוא ״אמור״ לתקוע את מכונת השכפול ולא להכניס מוטציות.
מסיבות לא מובנות, זה פשוט לא עובד💁‍♂️
סיכום ביניים: Molnupiravir גם מבוססת RNA. אבל בניגוד לחיסון, פה זה לא מולקולה ענקית של אלפי נוקלאוטידים שמקודדים חלבון. כאן יש רק נוקלאוטיד בודד שהוא סוס טרויאני. תרופה כזאת קל יותר לייצר. אבל ההבדל במנות הוא ענקי:
בחיסון של פייזר כמות הRNA היא 0.00003גרם/מנה וכאן היא 0.8גרם!
למה צריך כאלה מנות ענק?
כי אנו רוצים שבכל תא מטרה (ריאות, מערכת נשימה, וכו׳) יהיה מספיק מהנוקלואוטיד הזה כדי שהוירוס משתכפל הוא בסבירות גבוהה יכניס אותו לתוך הגנום שלו ויקרוס לתוך עצמו.
זה מביא אותנו לדבר על הבטיחות של Molnupiravir ויש לנו שתי בעיות:
1. גם התא האנושי עשוי להתבלבל ולהכניס את הנוקלאוטיד הזה לתוך הדנ״א שלו. נכון שזה RNA, אבל יש אנזימים בתא שיודעים להפוך אותו ל DNA. ניסוי תרבית הראו שהוא אכן עשוי להכנס לדנ״א ולגרום למוטציות.
academic.oup.com/jid/article/22…
זה דורש התייחסות. חלק לא קטן מהחולים הלא מחוסנים הקשים הם צעירים יחסית. הטיפול הזה דורש מהם לקחת גרמים של נוקלאוטיד שעשוי ליצור מוטציות בדנ״א שלהם. זה לא פוסל את הטיפול אבל יהיה מעניין לראות את ההתייחסות של ה FDA לפרופיל הבטיחות של התרופה.
בעיה 2 היא יצירת זנים עמידים. הטיפול למעשה מעלה בצורה מלאכותית את קצב המוטציות של הוירוס. באופן אירוני אם אנחנו מפחדים מזנים חדשים, פה אנחנו יוצרים הזדמנות ליצירת זן כזה. אני פחות מוטרד מאפשרות כזאת. למה?
וירוסים עברו אופטימיזציה של קצב המוטציות שלהם. ברגע שיש יותר מדי מוטציות קשה להשביח את הזן והם יותר עסוקים בלהרוס את מה שעובד.

אבל הייתי רוצה לראות ריצוף של הוירוס אצל בן אדם שלקח טיפול חלקי (בלע רק כדור אחד ולא 5ימים כפול שתי טיפולים ביום) ואם זה מדגרת זנים.
סיכום:
הכדור שב Molnupiravir הוא בהחלט התקדמות משמעותית אבל לא קסם. יש תוצאות יפות אבל צריך לראות את סך הדברים כולל היבטי הבטיחות. בכל אופן, בבחירה בין חיסון לכדור כזה, אני הייתי לוקח את החיסון.
תוספת: שאלו אותי האם Ivermectin דומה איכשהו לתרופה. אז התשובה היא לא. ככה נראה החומר הפעיל אצלה. זה לא נוקלאוטיד ולא נכנס לגנום. היא נקשרת לתעלות יוניות של חרקים ותולעים ובכלל לא אנטי ויראלית.

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with Yaniv Erlich

Yaniv Erlich Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @erlichya

3 Oct
Due to popular demand, a thread for the general audience on Molnupiravir, Merck's new treatment for Covid19.

Let's start!
The compound (left) looks like an RNA nucleotide called Cytidine (right) that is found in every cell in nature.

BTW: How do I know it is an RNA nucleotide? You see the two "legs" at the bottom with "OH OH"? If the right leg is OH it is RNA and if it's H, it is DNA. Easy.
The resemblance is nearly perfect except 2 places:
The diff in Blue (isobutylester) is bigger but less important. It's quickly cleaved by an enzyme once the drug is in our body and converted to be identical to a Cytidine.

The "OH" in Red is the magic of this molecule!
Why?
Read 19 tweets
27 Sep
covid19 in 🇮🇱.

Due to ✡️ holiday season, it is hard to get a reliable estimator of R. Previously, I showed that the avg susceptiblity of ISR population (S) is nicely correlated with R. This estimator is not affected by # test but only by # vaxxed and VE.
As a reminder, S(t), the susceptiblity of day t is 1 - Σf_i(t) •VE_i(t). Where f_i(t) is the % of the population that already took the i-th dose and VE is the efficacy of the dose in day t. Both parameters can be in calculated from MoH public dashboard on a daily basis.
So...
So here is S as a func of time (black) versus smoothed R (red). Both are coorelated.

Now, we don't have good data for R in Sep, BUT due to booster, S is in levels similar to Mar 21 (60%)! At that time, it was enough for R=0.9, so I'm cautionally encouraged that we= heading out😍
Read 4 tweets
27 Sep
לפני כשבועיים הצגתי את מדד ה susceptibles.

המדד (קו שחור) משערך את % האנשים שחשופים להדבקה וצופה לא רע של R (קו אדום). אבל בניגוד ל R, הוא לא תלוי בכמות הבדיקות אלא רק ב% המחוסנים ויעילות כל מנה (מדד נמוך=טוב יותר).

אז המדד (קו שחור) היום באותה רמה של 3/21, כלומר צופה R<1😍 Image
עוד פרטים: המדד אומר שאם לוקחים את אחוזי המתחסנים בכל מנה ואת היעילות של המנות בכמה ימים האחרונים, יש באוכלוסיה פחות מ 60% אחוז אנשים שחשופים להדבקה. במרץ, עם ההגבלות, זה הספיק. היום יש דלתא מצד אבל עוד 300 אלף מחלימים. בזהירות: נראה שאנו מעבר לשיא, כל זמן שיעילות החיסונים תמשיך.
עוד משהו מעניין בעבודה על המדד הוא יעילות מנה 2 נגד תחלואה. שמו לב לשיפור באוג׳. השיפור נובע ככה״נ שמי שהתחסן במנה 3, היו בדיוק אלה שהיו הכי זקוקים לכך: מבוגרים עם מנה 2 ביעילות אפסית. ברגע שהם יצאו מהמדגם, נשארנו עם צעירים ביעילות משופרת (אבל עדיין רחוקה מלהיות טובה כמו בהתחלה). Image
Read 4 tweets
16 Sep
Israel 🇮🇱, booster 💉💉💉, and herd immunity 🐑.
A thread based on the Ministry of Health data with many graphs.
Let's dive!
👇👇👇
Many of you heard about the decline of vaccine effectiveness in Israel in the past few months. The MoH publishes now on a daily basis the rate of infection in unvaxxed, vaxxed (2nd dose), and boosted individuals per 100K, which is a real treasure!
nature.com/articles/d4158…
With this data, we can determine the **crude** VE of each group by dividing the rate of infection in second dosed individuals to unvaxxed. From Jan 2020 to now, this is the crude VE (crude = not adjusted to sex, age, and other demographic variables)
👇👇👇 Image
Read 10 tweets
15 Sep
שרשור על חסינות האוכלוסיה בישראל והתפשטות התחלואה. איפה היינו ולאן אנחנו הולכים.
יהיה גרפים 📊. ויהיה מעניין!
🧵👇🧐
עם הדאטה בדאשבורד אפשר עכשיו לחשב בכל יום החל מינואר את יעילות הגולמית של מנה 2 לעומת לא מחוסנים. מה אנחנו רואים כאן בעצם? זה פשוט יחס המאומתים בין מחוסנים 2 ללא מחוסנים בכל יום לאחר נירומול לגודל האוכלוסיה. זאת יעילות גולמית כי היא לא מתקוננת למגזר או גיל (אבל לאחר החלקה).
שימו לב לעליה הקטנה ביעילות באזור תחילת מרץ. אני מניח שזה נגרם כתוצאה מהתחסנות האוכלוסיה היותר צעירה בסוף ינואר, ששם החיסון יעיל יותר מאשר באוכלוסיה המבוגרת.
סביב החצי הראשון של חודש אפריל הקסום, למתחסן הממוצע היה יעילות גבוהה מאד. ואז החלה השחיקה שהביאה לנפילה חופשית במאי-יוני.
Read 10 tweets
7 Sep
Important data from Israel: the relative protection against contracting Covid19 at the 4th wave as a function of vax/prior reinfection status. The data is calibrated to RR=1 for people who received 2nd dose in Jan and no booster.

A few thoughts below on waning protection👇
One important take away is that a prior infection protects you but can wane without a vax. People who contracted covid during the 2nd wave (Sep-Oct 20; dark red) have 1.9x risk to get delta compared to people who contracted Covid during the 3d wave (Jan-Feb 21; light red).
Recall that Alpha (3rd wave) is not closer to Delta (4th wave) than the ancestral strain (2nd wave). So it is reasonable to assume that diff are due to waning immunity.

This means that a recovered person looses ~15% of the protection per month. After 2yrs =~ no protection.
Read 7 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!

:(