Excellent analysis by @IdoIrani about the waning booster effect (for infection) stratified by age group in Israel.
The worrying part: the rate of decline is most age groups is similar to the 2nd jab.
@IdoIrani This tweet is trending. So a few comments 1/2:
1 Data: datadashboard.health.gov.il/COVID-19/gener… 2. This is a tweet not peer reviewed publication. It is a preliminary analysis with some caveats as described here.
3. The y-axis should be crude VE 4. Some Idiots...
have said that since I am a CEO of a start up and @IdoIrani is a PhD student, the analysis should be disqualified. This is my Google Scholar. Hope it passes your high bar 🤪. scholar.google.co.il/citations?user…
5-∞. It is a preliminary signal.
Check @MiloLabWIS data until end of Oct on VE of boosted vs. 2nd dose (the blue line in 60+ is mine). You can see a decline below 13x protection >45d from the booster (trigger warning: post-hoc analysis!). Does not mean a 4th jab in 3m but does suggest waning of the booster.
• • •
Missing some Tweet in this thread? You can try to
force a refresh
Due to popular demand, a thread for the general audience on Molnupiravir, Merck's new treatment for Covid19.
Let's start!
The compound (left) looks like an RNA nucleotide called Cytidine (right) that is found in every cell in nature.
BTW: How do I know it is an RNA nucleotide? You see the two "legs" at the bottom with "OH OH"? If the right leg is OH it is RNA and if it's H, it is DNA. Easy.
The resemblance is nearly perfect except 2 places:
The diff in Blue (isobutylester) is bigger but less important. It's quickly cleaved by an enzyme once the drug is in our body and converted to be identical to a Cytidine.
The "OH" in Red is the magic of this molecule!
Why?
שרשור על מה זה Molnupiravir, התרופה החדשה של Merck כנגד Covid19.
יאללה מתחילים.
הדבר הראשון שרואים היא שהתרופה (משמאל) נראית כמו נוקלאוטיד RNA שנקרא Cytidine ומצוי בכל תא של אורגניזם בטבע (מימין).
אגב, איך אני יודע שזה נוקלאוטידים של RNA ולא DNA? רואים למטה כמו שני רגלים עם OH בכל צד? אז אם הרגל הימנית היא OH, זה RNA, ואם היא פשוט H, אז זה DNA. קל!
הדימיון כמעט מושלם חוץ משני מקומות:
השינוי בכחול הוא לא כזה חשוב לענייננו. מדובר בתוספת שיורדת מהר מאד בגוף על ידי אנזים מיוחד ומחזיר אותנו למצב כמו ב Cytidine רגיל.
השינוי ה OH בחלק שסימנתי באדום הוא הקסם של המולקולה הזאת שהופכת אותה מסתם Cytidine לסוכן כאוס.
איך?
Due to ✡️ holiday season, it is hard to get a reliable estimator of R. Previously, I showed that the avg susceptiblity of ISR population (S) is nicely correlated with R. This estimator is not affected by # test but only by # vaxxed and VE.
As a reminder, S(t), the susceptiblity of day t is 1 - Σf_i(t) •VE_i(t). Where f_i(t) is the % of the population that already took the i-th dose and VE is the efficacy of the dose in day t. Both parameters can be in calculated from MoH public dashboard on a daily basis.
So...
So here is S as a func of time (black) versus smoothed R (red). Both are coorelated.
Now, we don't have good data for R in Sep, BUT due to booster, S is in levels similar to Mar 21 (60%)! At that time, it was enough for R=0.9, so I'm cautionally encouraged that we= heading out😍
המדד (קו שחור) משערך את % האנשים שחשופים להדבקה וצופה לא רע של R (קו אדום). אבל בניגוד ל R, הוא לא תלוי בכמות הבדיקות אלא רק ב% המחוסנים ויעילות כל מנה (מדד נמוך=טוב יותר).
אז המדד (קו שחור) היום באותה רמה של 3/21, כלומר צופה R<1😍
עוד פרטים: המדד אומר שאם לוקחים את אחוזי המתחסנים בכל מנה ואת היעילות של המנות בכמה ימים האחרונים, יש באוכלוסיה פחות מ 60% אחוז אנשים שחשופים להדבקה. במרץ, עם ההגבלות, זה הספיק. היום יש דלתא מצד אבל עוד 300 אלף מחלימים. בזהירות: נראה שאנו מעבר לשיא, כל זמן שיעילות החיסונים תמשיך.
עוד משהו מעניין בעבודה על המדד הוא יעילות מנה 2 נגד תחלואה. שמו לב לשיפור באוג׳. השיפור נובע ככה״נ שמי שהתחסן במנה 3, היו בדיוק אלה שהיו הכי זקוקים לכך: מבוגרים עם מנה 2 ביעילות אפסית. ברגע שהם יצאו מהמדגם, נשארנו עם צעירים ביעילות משופרת (אבל עדיין רחוקה מלהיות טובה כמו בהתחלה).
Israel 🇮🇱, booster 💉💉💉, and herd immunity 🐑.
A thread based on the Ministry of Health data with many graphs.
Let's dive!
👇👇👇
Many of you heard about the decline of vaccine effectiveness in Israel in the past few months. The MoH publishes now on a daily basis the rate of infection in unvaxxed, vaxxed (2nd dose), and boosted individuals per 100K, which is a real treasure! nature.com/articles/d4158…
With this data, we can determine the **crude** VE of each group by dividing the rate of infection in second dosed individuals to unvaxxed. From Jan 2020 to now, this is the crude VE (crude = not adjusted to sex, age, and other demographic variables)
👇👇👇
שרשור על חסינות האוכלוסיה בישראל והתפשטות התחלואה. איפה היינו ולאן אנחנו הולכים.
יהיה גרפים 📊. ויהיה מעניין!
🧵👇🧐
עם הדאטה בדאשבורד אפשר עכשיו לחשב בכל יום החל מינואר את יעילות הגולמית של מנה 2 לעומת לא מחוסנים. מה אנחנו רואים כאן בעצם? זה פשוט יחס המאומתים בין מחוסנים 2 ללא מחוסנים בכל יום לאחר נירומול לגודל האוכלוסיה. זאת יעילות גולמית כי היא לא מתקוננת למגזר או גיל (אבל לאחר החלקה).
שימו לב לעליה הקטנה ביעילות באזור תחילת מרץ. אני מניח שזה נגרם כתוצאה מהתחסנות האוכלוסיה היותר צעירה בסוף ינואר, ששם החיסון יעיל יותר מאשר באוכלוסיה המבוגרת.
סביב החצי הראשון של חודש אפריל הקסום, למתחסן הממוצע היה יעילות גבוהה מאד. ואז החלה השחיקה שהביאה לנפילה חופשית במאי-יוני.