Thread by @soylajefita

🔹¿Cómo vamos con ómicron? 🦠

Esta variante nos ha sorprendido por su capacidad de transmitirse. Claro, con todas esas mutaciones...era de esperarse.

Seguro han leído mil cosas nuevas, vamos a ver si puedo decirles algo nuevo/diferente... 1/42

Para poder entender a ómicron y su comportamiento hay que hablar del R0 y del Rt. 2/42

🔹¿Qué diablos es el R0 y el Rt?

El R0 es el número básico de reproducción y nos habla de la transmisibilidad de un microorganismo en donde "toda" la población es considerada susceptible a la enfermedad. 3/42

Si el R0 es 2, esperaríamos que una persona infectada pueda infectar a 2 más.

Como ustedes saben, en COVID-19 ya no podemos hablar de R0 porque las poblaciones tienen diferentes grados de inmunidad al virus. Entonces usamos el Rt, que es el número efectivo de reproducción. 4/42

Este no es perfecto, pero es más confiable pues considera el porcentaje de población que es inmune (ya sea por vacunación o por inmunidad natural, o ambos) y el porcentaje de población susceptible. 5/42

Entonces, en el Rt consideramos que hay inmunidad en la población y que algunos van a transmitir la enfermedad menos que otros. Entonces, el Rt podría ser menor que el R0.

Sin embargo, no es tan fácil. 6/42

Para calcular el Rt de ómicron tenemos que considerar otros factores que pueden jugar en el Rt:

1) La diversidad en la inmunidad. Tenemos gente sin vacunar, gente vacunada con una dosis, con dos dosis y con tres dosis. 7/42

Además, tenemos gente vacunada con vacunas de mayor eficacia/efectividad (vacunas de mRNA) y otras de menor o desconocida efectividad (CanSino, Sinovac, Sputnik). Todos esto va a influir en la capacidad de transmisión. Entre mejor inmunidad, menor el Rt. 8/42

2) La capacidad de evasión del sistema inmune. Ómicron sí puede disminuir la capacidad de unión de los anticuerpos neutralizantes y eso obligatoriamente favorecerá que, aunque haya inmunidad previa, el virus logre transmitirse. 9/42

Aquí, entre mayor capacidad de evasión haya, pues aumentará el Rt.

La cosa no es tan sencilla, hay muchas cosas que participan en la transmisión. Y, obviamente la transmisión puede no ser idéntica en todos los países. 10/42

Es posible que en un país con 85% de inmunización completa con vacunas de mRNA, la transmisión sea diferente a la de un país como México con ~52% de vacunación completa (y un coctel de vacunas de diferentes efectividades), y a la de una población con alta inmunidad… 11/42

…heteróloga (inmunidad por vacunas y por infección natural). 12/42

Para los que les guste jugar con gráficos, les pongo aquí el link de una "calculadora epidemiológica" y puedan ver algunos factores que participan (aunque en este no se considera el factor de evasión de sistema inmune ni la diversidad en la inmunidad poblacional)… 13/42

…gabgoh.github.io/COVID/index.ht…

Quienes nos han informado más ampliamente sobre la transmisión de ómicron en el mundo han sido UK y Sudáfrica. Y quien ha hecho un estupendo trabajo en calcular y reportar transmisión ha sido Trevor Bedford. 14/42

Hasta ahora, el Rt calculado en Sudáfrica es de 3-4, y en UK es de ~6.

https://twitter.com/trvrb/status/1469157795647746049?s=20

Tanto en UK como en Sudáfrica se está viendo la duplicación de casos rápidamente, siendo de 2.2 días para UK y de 3 días para Sudáfrica. 15/42

🔹¿Entonces ómicron se asocia a mayor transmisibilidad y a más reinfecciones? 16/42

Sí. Debido a la capacidad de transmitirse de ómicron y su capacidad para evadir a los anticuerpos del sistema inmune, es lógico que ómicron pueda asociarse a un mayor número de infecciones en vacunados y a reinfecciones (3X). 17/42

🔹¿Y los anticuerpos neutralizantes?

Como seguramente han leído, ómicron puede diminuir hasta ~40X la neutralización de los anticuerpos, en aquellos con dos dosis de Pfizer sin antecedente de COVID19. 18/42

En la población con inmunidad heteróloga (vacunación más infección) la capacidad de neutralización de los anticuerpos se conserva mejor (es mayor). 19/42

Pfizer ha enfatizado en la importancia del booster para elevar la cantidad de anticuerpos y mejorar la capacidad neutralizante contra ómicron. 20/42

UK ha mostrado la efectividad de dos dosis de Astra y un booster de Pfizer y de tres dosis de Pfizer. Aunque son pocos casos, vemos que el booster con vacuna de mRNA aumenta la efectividad de la vacuna tanto frente a variante delta como con ómicron.
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl… 21/42

En UK usaron una cohorte para calcular los riesgos de transmisión "en casa" de Ómicron comparada con Delta (72,761 casos Delta y 121 Ómicron) y el modelo de regresión logística preliminar mostró una razón de momios ajustada aOR=3.2, 95%CI 2.0 - 5.0 (ajustando por edad,… 22/42

…sexo, etnicidad, tipo de residencia, contactos, estado de vacunación). Esto nos dice que Ómicron puede tener una ventaja de transmisión sobre Delta, y una mayor probabilidad de transmisión. 23/42

También se calculó la razón de momios para infección al tener contacto cercano con un caso de ómicron comparando con delta, teniendo un aOR=2.09 (95%CI 1.54-2.79). 24/42

🔹¿Entonces, las infecciones en vacunados qué significan?

Que las vacunas son maravillosas, pero que ninguna vacuna es perfecta. Recordemos que las vacunas que nos ponen inducen grandes cantidades de anticuerpos en suero. 25/42

Sin embargo, en mucosa respiratoria (por donde entran los virus), los niveles de IgG y de IgA monomérica son menores y no se induce IgA secretoria de manera eficiente. 26/42

Entonces cuando comienzan, con el tiempo, a bajar los anticuerpos en suero, los anticuerpos en mucosas pueden estar aún más bajos. 27/42

Esta gráfica del paper de @mlipsitch muestra hermosamente qué pasa después de un booster y cómo se pueden comportar los anticuerpos según la edad. 28/42

Vean cómo con el tiempo los anticuerpos van bajando y pueden pasar del umbral para protegernos de infección o de enfermedad severa.
nature.com/articles/s4157…

MORALEJA: ¡HAY QUE PONER BOOSTERS! 29/42

🔹¿Y las vacunas van a servir?

Estamos viendo que aunque haya evasión inmune a los anticuerpos neutralizantes, el efecto de los refuerzos es estupendo y las vacunas siguen teniendo efectividad para proteger de enfermedad severa. 30/42

Pero, también consideremos a la parte del sistema inmune que no son anticuerpos. Aunque podemos tener disminución en anticuerpos, los linfocitos están ahí para protegernos y ellos sí pueden hacer un muy buen trabajo. 31/42

Se han analizado los epítopes para linfocitos T en las variantes anteriores y se ha observado que están ampliamente conservados entre ellas. De hecho, el análisis del proteoma del virus muestra una media de 98% epítopes de CD8+ y 95% de CD4+ están totalmente conservados. 32/42

https://twitter.com/SetteLab/status/1469007632493002753?s=20

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En el caso de ómicron, el 95% de epítopes para linfocitos CD8+ y el 88% para CD4+ están totalmente conservados. Esto nos dice que, aunque bajen los anticuerpos, los linfocitos T tanto CD4+ como CD8+ estarán ahí listos para responder a una infección por ómicron. 34/42

Esto ¡es maravilloso! Es decir, las vacunas podrían no proteger a todos de una infección, pero los linfocitos que tienen que combatir al virus una vez establecida la infección....AHÍ ESTARÁN. 35/42

Esperemos noticias de cómo se desempeña la memoria celular con
ómicron. Debería de protegernos de enfermedad severa y muerte.
biorxiv.org/content/10.110… 36/42

¿Y, qué ha pasado con la patogenicidad y virulencia?

Seguimos ante la posibilidad de que sea una variante con menor virulencia...y que se asocie a casos de menor severidad. Parece que ómicron no será más virulenta que Delta. Pero, ¡todavía son pocos números! 37/42

De inicio, ómicron infectó a gente más joven y nos falta ver cómo se comporta en toda la población. Hay dos cosas a considerar: la posibilidad de que sí sea menos patogénica/virulenta, y/o que las vacunas estén haciendo lo que deben hacer. 38/42

Deseamos que no tengamos muertes por ómicron, ya que delta aún sigue azotando a varios países. Por lo pronto, los antivirales de Merck y Pfizer parece que serán efectivos. 39/42

🔹¿Y, ahora qué podemos hacer?

-Dar booster a todas las personas posibles
-Vacunar niños ≥5 años
- NADIE sin esquema completo
-Uso de cubrebocas
-Ventilar 40/42

Recordemos que ventilar espacios de trabajo y estudio es MUY importante. Un estudio en Suiza mostró hasta 6 veces más casos en escuelas con poca ventilación, comparando con las bien ventiladas.
swissinfo.ch/eng/society/st… 41/42

OJO: Si la temperatura exterior es baja, y no se pueden dejar las ventanas abiertas, se sugiere ventilar los salones de clase (abrir ventanas y puertas) TRES veces por HORA durante CINCO MINUTOS.

¡Que tengan un lindo día! ☀️ 42/42