Thread by @rafaelsirera

En este hilo te presento la guía definitiva para entender que es la variante omicron del coronavirus, su transmisibilidad y que impacto puede tener en las eficacia de las vacunas o la severidad de la enfermedad.

Este hilo complementa lo que nos contó tan magníficamente @emulenews en @pcoffeebreak research.iac.es/proyecto/coffe…

Voy a empezar por el final, para dar dos mensajes a los que quieran ahorrarse leer todo el hilo. Primero: Omicron es una variante de preocupación pero no debe cundir el pánico. Tenemos ejemplos de variantes que eran “peligrosas y las vacunas y la inmunidad las controlan muy bien.

Segundo: PROTECCIÓN CONTRA INFECCIÓN: ANTICUERPOS (lo medimos en el laboratorio)
PROTECCIÓN FRENTE A LA ENFERMEDAD: LINFOCITOS T (difícil de medir).
LAS VACUNAS INDUCEN AMBAS RESPUESTAS POR IGUAL, DE ANTICUERPOS Y DE LINFOCITOS T.

Bueno, vamos al lío. PRIMER TEMA¿Qué es omicron y como surge?
Es una variante de preocupación del SARS-CoV-2. Y lo es porque cumple dos criterios: 1) Se extiende de forma masiva entre la población;

2) Al analizar la secuencia se estudia el número de mutaciones que le separan de las variantes conocidas y alarmantemente omicron es la que porta más número de mutaciones en la proteína spike. Las variantes beta y delta portaban 8 ó 10 cambios y esta porta 32 mutaciones.

Pero no sólo nos importa el número sino donde se localizan las mutaciones y su impacto en el reconocimiento potencial por anticuerpos. Omicron tiene mutaciones en estos denominados hotspots lo que le puede conferir esta ventaja de escape de los anticuerpos contra spike.

En SARS-CoV-2 estamos observando lo que denominamos evolución convergente. Por ejemplo la mutación está en muchas variantes descubiertas en el mundo. Por ejemplo la mutación E484K apareció de forma independiente en las variantes beta y gamma.

En el caso de omicron, esta porta D614G (todas las variantes), N501Y (alfa, beta, gamma) and K417N (beta, gamma). Además hemos de añadir que omicron surge en un mundo con inmunidad natural y artificial contra el virus. Y para que pueda surgir, alguna forma de escapar tendrá, no?

Muchas de estas variantes surgen como respuesta de escape a la presión del sistema inmunitario en individuos inmunocomprometidos. Sencillamente estos sujetos la infección persiste más tiempo y esto permite que el virus pueda evolucionar mejor ante estas necesidades de adaptación.

SEGUNDO TEMA, será la variante dominante próximamente?
Por el momento la variable dominante en el mundo es delta y aún está por ver si omicrón la desbancará. Por ejemplo la variante gamma detectada en Latinoamérica no se ha hecho en absoluto dominante.

TERCER TEMA, ¿Tenemos inmunidad frente a omicron?
Para responder a esta cuestión, los estudios in vitro de neutralización contra estas variantes nuevas son vitales para poder determinar el papel protector de la inmunidad. Se pueden hacer de dos formas complementarias.

Enfrentado a anticuerpos virus de la variante o haciendo expresar de forma artificial en células diana la nueva proteína spike de la variante. Cientos de laboratorios en el mundo están en esa carrera por conocer mejor el impacto de la variante omicron.

Las simulaciones por ordenador (in silico) ya predicen una caída de efectividad los anticuerpos.

Los estudios in vitro recién publicados confirma ese fatídico vaticinio. Omicron es bastante resistente a los anticuerpos neutralizantes. Una caída de 40 veces el poder neutralizantes. medrxiv.org/content/10.110…

Esa disminución no significa en absoluto que se haya perdido totalmente esta capacidad de matar virus in vitro, es solo una reducción. Aún más, esta disminución no significa, ni mucho menos, que la capacidad protectora de los anticuerpos de una persona haya disminuido 40 veces.

En realidad no sabemos lo que significa y hasta que no ya paso tiempo y tengamos resultados de la vida real no sabremos lo que significa. Sin duda se reducirá la inmunidad pero seguro que menos que lo que vaticinan los resultados in vitro.

En cierta medida son resultados especulativos. SOLO TENEMOS ESTUDIOS IN-VITRO Y LA RESPUESTA IN VIVO ES MUCHO MÁS COMPLEJA Y SEGURO QUE MÁS PROTECTORA FRENTE AL VIRUS.

QUE NO PODAMOS OBJETIVAR ANTICUERPOS, ESO NO QUIERE DECIR QUE HAYAN DESAPARECIDO TAMBIÉN LOS LINFOCITOS T. DE HECHO LOS LINFOCITO SON MÁS DURADEROS Y RESISTENTES.

Si de partida tenemos un buen título de anticuerpos, la protección será mayor. Si hemos pasado la infección, estamos protegidos mucho más frente a las variantes.

Si nos revacunamos seguramente potenciaremos en título de anticuerpos y con ello la capacidad de neutralizar al virus. Luego más que nunca el título de anticuerpo puede ser relevante.

CUARTO TEMA, será más grave la enfermedad?
Por el momento nada apunta a que vaya a ser así. A lo mejor lo único que observamos son más casos ligeramente sintomáticos pero sin que lleguen a ser graves.

Un aspecto importante a tener en cuenta es que con la variante delta ya nos enfrentamos a un escenario similar de resistencia a los anticuerpos. Y qué está sucediendo con delta? Que la tasa de transmisión no se frena mucho con las vacunas y tenemos esta ola de final de año.

Pero, importante, que los casos graces no han aumentado en paralelo luego la inmunidad en su conjunto nos está protegiendo. Igual con omicron el escenario será parecido.

Una nota final a favor de las vacunas: A lo largo de la historia de la vacunación lo que hemos constatado es una disminución de la morbi-mortalidad de las enfermedades infecciosas. Algo que se objetiva absolutamente con las vacunas actuales contra la covid.