1/La situation tend à s'éclaircir pour le variant #Omicron , qui pourrait finalement s'avérer moins virulent que le virus de la grippe. Quelques éléments pour comprendre.
2/n La différence essentielle entre le SARSCoV2 d'une part et le MERS et le SARS d'autre part, est que ces derniers ne peuvent infecter le naso-pharynx et n'infectent que les poumons, >
3/n > ce qui les rend à la fois moins transmissibles, mais rend les infections plus sévères lorsque l'on est infecté.
https://twitter.com/MartinFierro769/status/1274754906101080066
4/n Le SARSCoV2 peut s'aider d'une meilleure contagiosité via le nasopharynx pour, à partir du nasopharynx se répliquer et atteindre les poumons.
https://twitter.com/MartinFierro769/status/1316429025276030982
5/n J'ouvre une parenthèse pour rappeler que le labo de Wuhan, qui détenait les spécimens les + proches connus du SARSCoV2 originel avait réussi à infecter des cellules pulmonaires humaines chez des souris humanisées avec récpts ACE2
https://twitter.com/MartinFierro769/status/1442213852523884549
6/n et qu'ils avaient aussi demandé des financements pour introduire un site de clivage de la furine dans leurs spécimens dans le but de les rendre le plus virulents possibles (gain de fonction) afin, objectif affiché, de prévenir la prochaine pandémie.
7/n Or, il semble que cet Omicron soit moins habile ou moins enclin à disséminer vers les poumons, ce qui le rapprocherait alors des coronavirus saisonniers.
8/n On en a de plus en plus d'indices épidémiologiques. A savoir une transmissibilité accrue et une très forte et très rapide augmentation du nombre de cas, sans une augmentation parallèle des hospitalisations.
9/n Ainsi, en Afrique du Sud, le taux d'incidence semble avoir atteint un pic, alors que les hospitalisations et, en particulier, les cas critiques nécessitant une ventilation restent à un niveau très faible. 144 cas sous ventilation actuellement 
10/n S'il y a quelque chose de constant lors de cette pandémie, c'est que le pic des cas précède toujours le pic des hospitalisations. Donc nous serions proches du pic d'hospitalisations comme expliqué ici
https://twitter.com/pieterstreicher/status/1469540481147314177
11/n Est-ce vraisemblable? C'est la question que je me suis posée. Et, oui, cela me paraît vraisemblable. Car la vague delta a mis 1 mois à atteindre son pic (du 5 juin au 5 juillet) et Afrique du Sud, et que nous sommes à 15 js de la vague Omicron avec un virus 2X+ transmissbl
12/n Et c'est aussi vraisemblable car Omicron est déjà majoritaire depuis quelques temps dans les régions les plus densément peuplées de l'Afrique du Sud.
13/n J'avais déjà expliqué les différences entre les pays occidentaux et l'Afrique du Sud. L'Afrique du Sud est plus jeune (27 ans âge médian) mais le pays le plus inégalitaire au monde et celui où l'on trouve le plus de malades du SIDA au monde, plus de 7 millions.
14/n Et voici quelques données de UK qui ne sont pas de nature à entamer l'optimisme concernant le vaccin Omicron.
https://mobile.twitter.com/kallmemeg/status/1469350830864322560
15/n Si je résume (mais lisez le thread) , le variant Omicron aurait une transmissibilité et un taux d'attaque secondaire bien plus élevés que delta, X3,2 et X2,1 après ajustement respectivement, >
16/n > avec un risque de réinfection multiplié au maximum par 8 (ce qui le porterait à 5%, qui reste faible)>
https://mobile.twitter.com/kallmemeg/status/1469352376901324804
17/n Et, attention, réinfection ne veut pas dire risque de forme sévère parce que dans la quasi totalité des cas les réinfections sont plus bénignes que la primo-infection.
18/n L'efficacité vaccinale est fortement réduite, notamment pour le vaccin AZ (0% d'efficacité apparente actuellement contre les formes symptomatiques) et 30% pour 2 doses Pfizer
https://mobile.twitter.com/kallmemeg/status/1469352371738357761
19/n Les études de neutralisation in vitro semble très mal refléter ce manque d'efficacité.
20/n Mais Meaghan Kall fait aussi preuve d'une confiance touchante dans le fait que l'augmentation du taux d'anticorps avec le rappel va permettre d'améliorer l'efficacité. N'oublions pas qu'il faudrait qu'elle soit améliorée DURABLEMENT.
21/n Or, le taux d'anticorps comme repère pour tenter d'évaluer la protection se heurte au problème du seuil. Comme le vaccin est moins efficace ce seuil de non protection quel que soit le niveau de protection initial, sera atteint plus rapidement.
22/n En référence à ce qui s'est passé avec le variant delta on peut penser que si une protection existe, avec le rappel, elle n'existera que pendant quelques semaines tout au plus.
23/n Mais la question est: "est-ce vraiment un problème?". Dès lors que sur 691 cas répertoriés en UK, majoritairement vaccinés avec le vaccin AZ qui ne protège pas, on n'a aucune hospitalisation ni décès.
https://mobile.twitter.com/kallmemeg/status/1469354372870156290
24/n Ce qui tend à confirmer la bénignité de ce variant.
Plus transmissible, avec des cycles plus courts de reproduction, mais bien plus bénin, se rapprochant donc des virus saisonniers et sans effets systémiques.
Plus transmissible, avec des cycles plus courts de reproduction, mais bien plus bénin, se rapprochant donc des virus saisonniers et sans effets systémiques.
25/n Ce qui se passe lorsqu'un agent infectieux devient plus bénin c'est que le taux d'hospitalisations et de décès diminue, que le risque se déplace vers le groupe de personnes à plus haut risque, c'est à dire une plus faible part de la population>
26/26 Et que le rapport bénéfice-risque de vaccins surtout peu efficaces se détériore fortement, et donc tend à s'inverser pour les individus et les groupes à risque.
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