これは日本にも参考になる朗報。
南アの状況はいろいろ違うことが多すぎて参考にしきれなかった。
12歳以上の子供のワクさえ50%超えの英国でデルタ株からオミクロン株への置き換えが進めば進むほど入院者が増えている!この先の死者数はデルタ株を超えるの必至。
不謹慎ですが、以下のTweetを参考にさせて頂きました。
科学分からないHopiumは黙れ
さて、海外のニュースは英国とNCIDの初期解析から入院率は80%低い!を全面に出したりしてますが、日本のニュースはインペリアルカレッジの40%低いを引用する慎重さ。
N数多いインペリアルカレッジの方が確度は高いでしょう。

見ていきましょう
imperial.ac.uk/media/imperial…
使われたデータは12/1-14の2週間の英国のデータで、pillar2がサーベイシステムの登録数。これが殆どを占めますが、pillar1がそれ以外も足した数っぽいです(相変わらず斜め読み)
まだ、12/1とかはδ主流ですね。
さて、Table2が入院率のハザード比です。
Pillar2+一晩以上の入院に限るとο株の入院率はδの59%。41%ダウンしています。

一方制限付けず全症例の入院率にすると、80%。20%のダウン。
日帰り入院(で正しい?)入れると数が近くなるのでο株の方が軽そうです。

それよりその下の段でしょうか。
どちらも再感染者になると、実はHRがδに近くなります。
これはWHOが以前言っていた(そして結局出さなかった)再感染すると入院又は重症化しやすくなるという予備的なデータの証明になるのでしょうか。
なお、入院率はデンマークか英国国家統計局かは、陽性になる1日前〜陽性後14日までの入院を数えていたのですが、この解析では陽性後のみとなっています。
(入院してからPCR判定された人が除かれている)
入院してから判定されることがまま多い(まだまだ海外に比べて検査不足・検査へのアクセスハードル高い)日本では除外される新コロ入院者の方が多そうなやり方ですね。

英国ではこれでいいんでしょうかね。

最後にこの話には必ずこれを付けなければなりません。

グレーがδ死亡者の時
2倍感染しやすく10倍致死率低い感染症の死者数は緑だからな。
と。

これだけは何度繰り返してもいい話です。
弱毒化をHappy scenarioというのは、(頭が)ハッピーに過ぎる。という話です。感染症の前では。
なお、これはオミクロンではなく新コロ全体の話ですが、いや持続的な後遺症*Long-Covid*にも関わる話でしょう。
その患者の症状進行の遍歴によっても差が出そうではありますが、いやしかしまあ。
けっこう全身性に、それもけっこう長期にウイルスいるやん。と。

researchsquare.com/article/rs-113…
今日はやる気なくてあまり論文読んでないのでこんくらいで。

と思ったけどこれは。

迅速抗原検査はオミクロンに対して分析感度が低下してるよ。と7つの抗原検査キット使って。

medrxiv.org/content/10.110…
ハハハハ。だから言ったじゃないか。WHOも警告してたし。

オミクロンに対する解析感度の試験もせずに空港検疫を利権にし続けたこと、後々禍根を残すだろうな。

特に3、6あたりの抗原検査キットは最悪。

臨床的にウイルス量ベタ上がりしてればまだ大丈夫かもしれんけど。
日本は空港検疫を「アレ」のままでままオミクロン発見して防いだ気になってますが、一体実際のところ何%捉えられているのでしょうね。

オミクロン相手に。

使う前に臨床試験しましたか?
解析感度が同等維持できてるか調べましたか?

やってない?どうして?
蛋白変異してるのに。
素直にPCRしなさいよ。
さて、次行くか

デンマークの国立血清研究所です。

僕に、「ワクチン効果マイナスになる訳ないだろバーカw」と言った方。

もう一度出てきて貰ってもいいですか?
medrxiv.org/content/10.110…
はい、デンマークの公的期間がマイナスを出しました。

2ヶ月目からVE0付近に。3ヶ月以後、大きくマイナスです。
中途半端な抗体価が徒になるADEの懸念について、科学者はもう少し真剣に取り組んだ方がいいでしょう。

いや、しかし。
1ヶ月しか持たないのキツイなおい。

まだまだ時間を稼ぎ、他の国のデータ待ちましょうよ。日本。

できれば変異株対応ワクチンまで時間を稼いで。ホント。
【日本の皆さんへ、北の国から】

ちなみに接種から3ヶ月超えると
ファイザーが-76.5%
モデルナが−39.3%

日本の皆さんはどうですか?
該当しますか?

ADEの可能性もある以上、これ日本人年末年始捨てて引きこもる方が勝ちかもね。

マジか
いや、俺の想定−23%より大きかったね。

たぶん、ワクチン打ってから効果出るまでに2週間見なきゃいけないのに、中間地点の12/5の接種率で計算したから、より少なくなったワクチン未接種者のリスク比が高めに計算されたことによるものかな。
逆に昨日報告した英国のデータの計算結果、マイナス71%とは近い。
国違うけど。

武漢株用ワクチン2回接種者が、むしろオミクロンにより感染しやすいことは確定じゃないか?

いや、当初からADE株になってる危険性は予想してたけど、ラボデータ出る前に、現実世界データで、ワクチン効果のここまでの「マイナス」を公的機関が発表するとは。

ま、デンマークデータ公開度合い高いし計算したらマイナスだったからマイナスなのは想定してたけど。

ショックなので寝るマル

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22 Dec
イギリスのデータ

昨夜、ADEだ!と流れてきたTweetがイギリスの国家統計局のCISデータに基づいている。

何事だろうか、と見るとかなり分かりにくい統計結果だった。

この画像Table1b、一見するとワクチン打つほど感染する様に見える。
最大-345%へと
ons.gov.uk/peoplepopulati…
でもこの統計のタイトルはこう。

新コロ陽性者中のオミクロンの割合調査

11/29-12/12の2週間データで、人数も書いてある。
間違えを防ぐために強陽性(Ct30未満)だけを解析対象にしている。
なお、どうやら年齢制限はしておらず幼児の感染者も統計に含めている(Table1cから12歳未満のオミクロン感染者に占める割合は3.3%、オミクロンが若い人へ対象を移してもこの年代の子供はやっぱり強い)。

なので、英国全部のワクチン接種割合(中間地点12/5時点)から計算してみよう
Read 19 tweets
21 Dec
今日のオミクロンメモ

ちょいちょい、オミクロンはACE2への結合力強いよ!と弱いよ!の報告が入り乱れて困惑してるんやけども。

この報告ではACE2結合だけでなく、細胞膜融合能も弱い。だが、細胞間感染は圧倒的である。
TMPRSSを利用せず細胞間感染する
biorxiv.org/content/10.110…
力を強めたのでは?と筆者ら。

じゃ具体的に何よ?不明

これ、オミクロンの合胞体形成能は最弱。
つぎ、ACE2結合量も最弱。
んで、CaLu3への感染力が落ちると。
sACE2で処理するとS1放出は認める。
Read 11 tweets
20 Dec
okinawatimes.co.jp/articles/-/873…

沖縄のクラスターの前に、コロナ疑いの米兵が民間機で移動していても気付かなくないかこれ?

神奈川県座間に集まった110人のうち、10人は民間機で移動していたとのニュースもあったけど。

何がしたいのかよく分からんわ
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl…

イギリスが1万人をオミクロン感染者として新規登録。
Londonはもうほぼオミクロン。

まだ14日以内の発症者は104人、死亡は12人なのだが、それはこれから14日後にこの1万人がどうなるか見なきゃ分からない。じれったい
ニュースリンク失念

EUはオミクロン対応ショットの購入契約、Pfizerは3月までに準備できるとしている。

この速度だとその前にピーク終わってそうな気もする。
Read 14 tweets
19 Dec
デンマークのデータ3

今回は大事。
先日、大きなマイナスになったけど、その後からデンマークは12歳以下の患者を表に入れない改訂を行いました。理由は子供は殆どワクチン未接種だから。

こうなると、ワクチン効果計算するときも母集団から12歳以下の人数を除かないといけません。
というわけで、デンマーク最新版の報告からVEを算出するには
12歳以下の人口数をwikipediaから拾ってきて、その割合13.17%をワクチン未接種人口数から引いて…とやりました。
つまり、ワクチン未接種の12歳以下の感染はもともと少ないけどVEの計算から除かれVEは上がる方向ですね。
結果はこう。

ο株へワクチン効果は
1回接種で19%
2回接種で−23.5%
3回接種で42.8%

δ株へのワクチン効果は
1回接種で50%
2回接種で62.6%
3回接種で83.7%
Read 6 tweets
19 Dec
今日のオミクロン。

WHOからワクチンの誘導する細胞性免疫についてシンプルなスライド

cdn.who.int/media/docs/def…
これを皆さんはどう捉えますか?

WHOの結論は、大丈夫だよ!オミクロンにも細胞性免疫は残るよ!

の様です(笑)
「ワクチンにより誘導された細胞性免疫がオミクロンに対してどれだけ下がる?下がらない?」

これが論点の実験です

1. 16 sample用意したよ!そのうちオミクロンに反応しなかった3 sampleを解析から抜いたよ!

2. オミクロンに反応しない3を除いた13検体で減少認めたけど30%程度だったよ!
3. 次の検体では9検体しか使わなかったよ!(理由不明、おそらくCD4反応が良かったもの)

4.そしたら6検体はオミクロンに対しても反応残ってたよ!つまり2/3は残ってるよ!
(え?6/16の間違えでは…?)

以上、WHOからの報告でした。

もうこれはコメントするの辞めようか…

13×0.7=9.1
9.1/16=57%
Read 32 tweets
18 Dec
話題になってたインペリアルカレッジのデータ。

大事なのはο株の再感染率はδの5.4倍!じゃないと思うぞ(皆知ってた)
imperial.ac.uk/mrc-global-inf…
倍加時間が1.6dayとかちょっと凄い早さ(どんどん短くなってない?)

倍加時間11-14日のδに対して「もうこれ以上感染力上がる変異ないんでは?」と言ってたのがもう懐かしいよね

次の表
大事なのは赤字ではなく、差がなかった黒字だったりする。
・症状・無症状割合が変わらない
・入院率が変わらない
【思い出してくれ】

オミクロン(笑)と言ってた人達のHopiumを。
「🇿🇦ではオミクロン感染者は無症状ばっかり!🇿🇦ではオミクロン感染者は全員軽症!」

って言うてませんでした?つい、昨日くらいまで声高に。

完全にインペリアルカレッジに否定されてますやん。
δに比べて入院率0.95倍
Read 17 tweets

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