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Feb 15 20 tweets 10 min read
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💉✅Atualizando aqui a distribuição geográfica de cobertura vacinal de 2ª e 3ª dose no Brasil e o mapa de homogeneidade por estado. Dados do RNDS até o dia 13/02 (Domingo). Detalhes e comentários no fio abaixo👇 Image
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Esse mapa acima é a cobertura de 2ª dose nas regiões de saúde do Brasil. Mas há 2 comentários que precisam ser feitos.

⚠️O primeiro é que algumas regiões de saúde tiveram problemas na sincronização dos dados municipais com os que baixei do RNDS (São as regiões pretas em MG)
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Por isso, as regiões pretas representam locais sem estimativa de cobertura vacinal. Para ainda poder fornecer uma boa estimativa da cobertura nacional, eu mantive o mapa das coberturas usando a divisão por mesorregiões também👇 Image
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Pretendo consertar essa sincronização até a próxima semana.

⚠️O segundo aviso é que há um problema nos dados do Ceará. Há uma discrepância muito grande entre as doses notificadas no site do governo do Ceará (saude.ce.gov.br/vacinometro/) e o indicado no LocalizaSUS usando o RNDS
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Provavelmente houve um erro de digitação nos dados do RNDS. Porque digo isso? No dia 30/01, há cobertura nacional era a seguinte: Image
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Notem que comparando esse mapa com o recente, parece que a cobertura no Ceará caiu?? O que significa que a atualização do RNDS mais recente consta menos doses para o Ceará, do que constava duas semanas atrás. Por isso suspeito que houve um erro.
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Sendo assim, desconsiderem o Ceará nos mapas desta semana. Espero que os dados se normalizem em breve.
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Lembrando que para as coberturas de 2ª dose, eu considero apenas a população acima de 9 anos (10+) nos municípios.

Abaixo, vem o mapa da cobertura de 3ª dose, considerando como população elegível, todos com idade igual ou superior a 25 anos Image
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Abaixo, o mesmo mapa com a separação por mesorregiões para cobrir a falha de sincronização com as regiões de saúde Image
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Também desconsiderem o Ceará neste mapa, uma vez que os dados de terceira dose também vieram do RNDS (infoms.saude.gov.br/extensions/DEM…)
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Por último, vem o mapa de homogeneidade na cobertura vacinal de 2ª dose. Ele trás outra informação que as coberturas brutas não trazem, que é a diferença entre os municípios de um estado.

Independente de a cobertura total estar alta ou baixa
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Pode ser que haja municípios + ou - avançados. O ideal é que a diferença entre os mais avançados e os menos avançados não seja alta, isso quer dizer uma cobertura mais homogênea (+ azulado). Já quando as diferenças são altas, a cobertura é pouco homogênea (+ avermelhado) Image
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Para ilustrar a ideia, observem as distribuições de coberturas vacinais de 2ª dose de São Paulo (Esquerda) e Bahia (Direita). Notem como a distribuição da Bahia é mais larga, ou seja, a dispersão das coberturas é maior. ImageImage
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Isso significa que as diferenças entre os municípios mais vacinados e menos vacinados lá são maiores, portanto o índice de homogeneidade diminui. Novamente, ignorem o resultado para o Ceará. Image
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Por último, o comentário de sempre. Notem que alguns municípios indicam 100% ou mais da população elegível (10+) com esquema primário completo (2 doses ou dose única). 100% de cobertura é fruto de discrepâncias entre a estimativa populacional e a população real
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Portanto, apesar da cobertura ser de fato bem alta, ela não é 100% nestes locais.
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Os dados, mapas com os municípios de cada estado e distribuições de coberturas podem ser baixados no meu github. Os mapas ficam na pasta "Maps" e as distribuições na pasta "Distributions" github.com/PedroHPCintra/…
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Tentei deixar o github mais organizado, se tiverem sugestões de organização podem mandar.
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O resumo da situação dessa semana não muda muito da última atualização, apenas mudo o 2 de para:

A cobertura de 3ª dose precisa avançar pelo resto do país como tem avançado no sudeste/sul"

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Feb 16
26/55
E como essas estimativas são feitas? Como eu posso confiar nelas? Agora vou tentar destrinchar alguns detalhes de modelagem. Acredito que todos já estejam familiarizados com o conceito do numero de reprodução básico Rₜ (comenta nesse tweet se não estiver)
27/55
Acima de 1, epidemia cresce. Abaixo de 1, epidemia decresce. Em 1, ela é estável. Acontece que esse numero muda com o tempo devido a todos os fatores mencionados nos tweets acima. O valor de R depende principalmente de 3 coisas:
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1 - O valor de Rₜ no início da epidemia, sem alterações comportamentais na população ou medidas de intervenção, o chamado R0.2 - A medida de intervenção ativa no momento ou a mudança adotada pela população
Read 32 tweets
Feb 16
1/55
Lockdown funciona? E fechar comércio? Escolas? Um estudo "recente" tentou responder isso, acho bom dar uma olhada nele e fazer alguns comentários. Segue o fio (Ta longo mas o essencial só vai até o tweet 24, depois são detalhes metodológicos para quem se interessar)👇🧵 Image
2/55
Essas perguntas são difíceis de responder seriamente. Quando falamos de sociedades, as coisas nunca são preto no branco.
3/55
O artigo não saiu esses dias (doi.org/10.1038/s41467…), ele é de Outubro de 2021, mas acho bom usarmos ele para abordar esse tema. Primeiro que ele não é o primeiro estudo a avaliar muitos locais e estimar a efetividade de medidas de intervenção. Mas como os autores comentam
Read 26 tweets
Feb 14
1/20
Hoje eu venho trazer aqui os achados desse estudo muito legal que li esses dias na @ScienceMagazine. O objetivo dele foi avaliar a resposta de células B de memória contra a variante Ômicron, para quem recebeu 2 doses da Pfizer. Segue o fio🧵👇 doi.org/10.1126/sciimm…
2/20
Nesse acompanhamento, utilizaram o soro sanguíneo de 45 voluntários vacinados com 2 doses da Pfizer e mais 40 pessoas antes de se vacinarem e que não tiveram COVID (Elas são o ponto de referência para medir a resposta pré-vacinação ou pré-infecção).
3/20
As atividades imunológicas foram avaliadas em um período curto após a 2ª dose (em torno de 31 dias) e um período longo (em torno de 146 dias, ou quase 5 meses depois). Image
Read 21 tweets
Feb 6
1/25
Finalmente saiu o preprint de fase 3 da vacina CoVLP da Medicago (@medicagoinc). Só tive tempo de ler o preprint agora e como eu fui um dos participantes voluntários da fase 3, segue aqui um fio sobre os resultados.🧵👇 doi.org/10.1101/2022.0…
2/25
Quando eu entrei no estudo, eu fiz um fio sobre os resultados prévios de fase 1 e 2, caso queiram ler antes
3/25
Também fiz de outro resultado que saiu avaliando a resposte imune 6 meses após a vacinação com a CoVLP (nome da vacina)
Read 26 tweets
Jan 26
1/28
Mais de 1 ano de vacinação contra a COVID e ainda tenho que ver o argumento "Mas em tal lugar tem mais vacinado no hospital do que não vacinado". Então vou refazer um fio que fiz um tempo atrás explicando porque isso é normal e como essa não é uma comparação justa 🧵👇
2/28
Já falei disso uma vez, usando um exemplo dos EUA para ilustrar a lógica que explica o porque isso acontece naturalmente
3/28
O @rizbicki também comentou isso não faz pouco tempo
Read 29 tweets
Jan 3
1/14
Na Europa é bem clara a relação entre vacinação com 2 doses e fatalidade por caso de COVID. Aqui temos no eixo-x a % da população no país com 2 doses e no eixo-y a fração de óbitos por casos registrados em 2 semanas. Mais detalhes 👇🧵
2/14
Atenção à alguns detalhes. Há fatores de confusão aqui, como testes feitos. Escolhi a Europa por ser o continente que mais testou proporcionalmente à sua população nesse período, para minimizar as diferenças por testagem
3/14
Mas claro que isso ainda tem variações. Escolhi também um período logo antes da #omicron pois no momento atual, a prevalência dela nos países Europeus varia muito, o que poderia trazer mais confusão para a correlação
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