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Se cercate dati su #Covid19 in #Italia ma non conoscete ancora la repo github di @DPCgov vi invito a recuperare.

github.com/pcm-dpc/COVID-…

Sebbene non ci siano tutti i dati necessari, ce ne sono molti.
È possibile anche porre domande usando le Issues
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Se cercate i dati di @istsupsan su #Covid19 vi invito a consultare la repo github di @ondatait

github.com/ondata/covid19…

Il loro team fa uno splendido lavoro di estrazione dati dalle dashboard.
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Se cercate i #Verbali del #CTS, sono disponibili qui
github.com/pcm-dpc/COVID-…

e qui
protezionecivile.gov.it/attivita-risch…

Qui invece una semplice applicazione che li riassume in wordcloud

vienne.shinyapps.io/wordcloudCTS/
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Se cercate dati sui #posti #letto per qualsiasi area medica o motivo, quindi non colo #covid, li trovate sul sito del @MinisteroSalute

dati.salute.gov.it/dati/dettaglio…

Purtroppo al momento sono aggiornati al 31 dicembre 2018
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I #bollettini settimanali di @istsupsan sono pubblicati tipicamente il sabato su
epicentro.iss.it

Tipicamente il venerdì, invece, viene pubblicato il commento in anteprima tra le news del @MinisteroSalute
salute.gov.it/portale/news/p…
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Riguardo il calcolo di #Rt si può leggere la spiegazione di @istsupsan qui
iss.it/web/guest/prim…

Altre risorse:
- Cori et al (2013) modello originale academic.oup.com/aje/article/17…

- Riccardo et al (2020) applicato all'Italia medrxiv.org/content/10.110…
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Per quanto riguarda @ProvinciaTrento, un accuratissimo monitoraggio viene fatto da @FBKcom.
In fondo alla pagina sono scaricabili i dati in formato csv

covid19trentino.fbk.eu
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Dati #covid19 di @AUSLBologna sono pubblicati settimanalmente qui
public.tableau.com/profile/dsp.au…

come spesso segnalato da @CassandraSperi
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Dati #covid19 sul #Piemonte sono disponibili qui
github.com/to-mg/covid-19…

Vengono estratti dalla mappa regionale disponibile qui
regione.piemonte.it/web/covid-19-m…

Grazie a @Mcx83 per la segnalazione
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Dati #covid19 a livello globale sono riportati dalla @JohnsHopkins

Qui una lista delle loro fonti

github.com/CSSEGISandData…
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Dati #covid19 per il Canada🇨🇦 vengono raccolti da @JPSoucy e @ishaberry2 da fonti ufficiali.

Sono disponibili qui
art-bd.shinyapps.io/covid19canada/

e qui
github.com/ishaberry/Covi…

Thanks! Merci!

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Dati #covid19 per gli Stati Uniti d'America 🇺🇸 sono raccolti da @COVID19Tracking.

Sono disponibili qui e si possono scaricare in csv
covidtracking.com

Thanks!
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Disponibile il "Report Vaccini Anti Covid-19" con tante informazioni sulle vaccinazioni in Italia.

app.powerbi.com/view?r=eyJrIjo…

Ringrazio @tonini_stef per la segnalazione.

Peccato sia anche questo sotto forma di dashboard... Image
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Dati sulle vaccinazioni in Italia estratti da @ondatait sono disponibili qui:
github.com/ondata/covid19…

Una visualizzazione basata su questi dati disponibile qui
piersoft.it/covid19/focusv…

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Papers sui risultati delle fasi 3 dei vaccini

Pfizer/BioNTech
nejm.org/doi/full/10.10…

Moderna
nejm.org/doi/full/10.10…

Oxford/AstraZeneca
thelancet.com/journals/lance…

Qui invece il @nytimes vaccine tracker
nytimes.com/interactive/20…
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Per seguire la vaccinazione nel mondo si può consultare @OurWorldInData

In fondo alla pagina sono indicate le fonti per ogni Paese

ourworldindata.org/covid-vaccinat…
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Sulle vaccinazioni in Italia, alcuni documenti utili sono disponibili sul sito del @MinisteroSalute

salute.gov.it/portale/nuovoc…
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I dati ufficiali sulle vaccinazioni in Italia sono disponibili in questa repository GitHub
github.com/italia/covid19…

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Dati della @RegLombardia su gli stati clinici Covid-19 inviati a ISS sono disponibili qui

hub.dati.lombardia.it/Sanit-/Matrice…

Grazie a @ondatait per la segnalazione
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Nel caso qualcuno stesse ancora cercando l'algoritmo usato da @FBK_research e @istsupsan per il calcolo di Rt, qui il download diretto del codice

epicentro.iss.it/coronavirus/op…
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Alcuni link utili su Rt:

-Nota metodologica @FBK_research
epicentro.iss.it/coronavirus/op…

-App Imperial College di Londra
shiny.dide.imperial.ac.uk/epiestim/

-Demo pacchetto EpiEstim
cran.r-project.org/web/packages/E…

Articoli👇

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@CrespiDaniele segnala un dataset di @RegLombardia dei vaccinati per comune di domicilio, disponibile qui

hub.dati.lombardia.it/Sanit-/Sommini…

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26 Apr
Pubblicato verbale #CTS 163 del 9 marzo 2021
6 pagine più 51 di allegati (comprese le email di approvazione 🤷‍♂️)

Parecchio interessante: si parla dei motivi per sospendere la zona gialla e fissare una soglia a 250casi/100mila abitanti su 7 giorni

raw.githubusercontent.com/pcm-dpc/COVID-… Image
Interessante l'allegato 2, in cui si valuta il consolidamento (o mancato consolidamento) dei dati per la stima di Rt

Da approfondire! Image
Nel verbale si cita il n 143, che individuava già a gennaio dei cutoff relativi all'incidenza



Non si fa cenno pero' al 144 in cui si suggerisce di modulare la soglia dell'incidenza secondo "diverse politiche regionali di testing"

Read 4 tweets
9 Dec 20
Grazie a @istsupsan e @FBK_research per aver aggiunto tanti dati e documenti interessanti, soprattutto relativi alla stima di Rt.

Mi concentro su Rt 👇

epicentro.iss.it/coronavirus/sa…
La nota metodologica e' tecnica al punto giusto e permette di capire le differenze di calcolo fra Rt puntuale e "Rt medio 14 giorni" dei bollettini ISS.

Si parte da una stima giornaliera chiamata Gt, che può variare ampiamente da un giorno all'altro...

epicentro.iss.it/coronavirus/op…
Si calcola allora una media settimanale di questo valore chiamata appunto Rt con i suoi intervalli di credibilità al 95%: è l'Rt puntuale delle tabelle 21 indicatori.

Per capire come varia Rt puntuale medio nei 14 giorni si calcola Mt (quello dei bollettini ISS). Più complesso..
Read 7 tweets
7 Dec 20
Aggiornamento #Rischio #coronavirus #7dicembre

ATTENZIONE: queste non sono le mappe ufficiali del Governo, ma quelle ottenute come descritto nei seguenti link

Analisi completa: bit.ly/analisiCovid19
Metodologia: bit.ly/metodologiaCov…

Dati @ProvinciaTrento da @FBK_research
#Sovraccarico #7dicembre
Solo pazienti positivi al coronavirus
Posti letto totali

Soglia allerta TI 30%
Soglia allerta Aree mediche 40%

Soliti avvisi sulla qualità dei dati

Focus sulla Campania 👇
Focus Campania: livelli di rischio molto diversi nei miei 3 scenari

Per come e' definito l'algoritmo, se a una domanda si risponde NO la successiva non viene considerata anche se la risposta e' SI.

Ma i miei scenari vanno da severo a permissivo
Read 6 tweets
6 Dec 20
Dall'ultimo bollettino @istsupsan scopriamo qualcosa in più' sui due Rt: "Rt medio 14 giorni" e "Rt puntuale".

Sebbene ci siano delle FAQ e sappiamo che il modello adottato per la stima di Rt e' quello di Cori, alcuni dettagli sono ancora da chiarire.

iss.it/primo-piano/-/… Image
Nel bollettino si riporta Rt medio 14 giorni accompagnato da un "range" mentre a Rt puntuale si accompagna un intervallo di confidenza.
In più si considera il 17 novembre come data per la stima, 14 giorni prima della data del calcolo (2 dicembre).

epicentro.iss.it/coronavirus/bo… ImageImage
In figura 9 si specifica che il punto di ciascuna stima di Rt e' calcolato nel giorno centrale dell'intervallo di 14 giorni.

Dunque Rt medio e' riferito al 17 novembre, considerando un intervallo di 14 giorni dall'11 a 24 novembre.
Meno chiaro a cosa si riferisca il range. Image
Read 5 tweets
5 Nov 20
Al momento, si sta parlando di quali sono gli indicatori.
Un bell'articolo di @EasyInve riassume gli indicatori qui


Si stanno poi mostrando gli algoritmi, già noti dal DM 30 aprile 2020
trovanorme.salute.gov.it/norme/renderNo…
Non si mostrano ancora nel dettaglio i valori degli indicatori, ma solo una mega giga slide.

Io vedo un sacco di rosso, non so voi
Read 18 tweets
4 Nov 20
Zone Italia 4 novembre 2020

🔴Rosse:
Calabria
Lombardia
Piemonte
VdA

🟠Arancioni:
Puglia
Sicilia

🟡Gialle:
Abruzzo
Basilicata
PA Bolzano
Campania
ER
FVG
Lazio
Liguria
Marche
Molise
Sardegna
Toscana
PA Trento
Umbria
Veneto
I criteri e i valori dovrebbero essere resi disponibili prossimamente.

Questo e' molto importante

Qui un riassunto delle aree e delle misure definite dal DPCM 3 novembre 2020, che entreranno in vigore venerdì 6 novembre 2020

ilsole24ore.com/art/coronaviru…
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