Thread by @T_Fiolet

Étude dans Nature qui classe l'impact de 6 068 mesures sur 79 territoires pour faire diminuer le nombre de reproduction R (ralentir la transmission de la pandémie)

Mesures les + efficaces :
1⃣ Eviter les petits rassemblements
2⃣ Fermeture des écoles
3⃣ Fermeture des frontières

😷 Augmenter la disponibilité des équipements de protection, limiter les mouvements, le confinement national, améliorer la communication sur les risques et éduquer le grand public sont des mesures efficaces

Chaque mesure fait diminuer jusqu'à -0,35 le R

🏫 Par exemple fermer les écoles, les université, les jardins d'enfant fera diminuer le R que d'au maximum 0,34

Aucune mesure isolée ne peut faire passer le R<1

Il faut une bonne combinaison de mesures et le faire "le plus tôt au possible"

⏱️ Le timing représente une grosse partie de la bataille. Les masques faciaux se sont révélés les plus efficaces dans les pays qui ont promu très tôt une utilisation volontaire, par rapport aux pays qui ont mis en œuvre une utilisation obligatoire à des stades ultérieurs

Point important : les interventions précoces et volontaires surpassent les mesures similaires qui sont prises tardivement et comme lignes directrices obligatoires

Les confinements et restrictions de mouvement sont plus efficaces lorsqu’ils ont été imposés très tôt

🧼 Mesures peu efficaces : le nettoyage des surfaces, les contrôles de santé aux frontières, recevoir ou donner un aide international, les mesures de traçage

Ils ont mesuré une entropie normalisée qui reflète la variabilité géographique de l'impact de ces mesures sanitaires

ça représente l'hétérogénéité entre les pays de l'efficacité d'une mesure (par rapport aux caractéristiques socio-économique, le contexte local)

A droite une entropie faible = efficace dans la plupart des pays

A gauche = entropie élevée = efficace que sur certains territoires

Ces graphiques montrent l'impact du timing, le moment où on introduit ces mesures (epidemic age of adoption) sur la transmissibilité du virus Rt

Pour la fermeture des écoles, restrictions sur les rassemblements, le confinement : adoption précoce est mieux

Sur la figure 4c , l'amélioration de la capacité de dépistage et la surveillance ont un impact négatif (augmentation du R), c'est mathématiquement lié au fait que davantage de tests permettent d'identifier plus de cas

Cette étude se limite à l'analyse des interventions entre Mars et Avril 2020. C'est une période associée à une augmentation soudaine et brutale des cas qui ont dépassé les capacités de traçage et de test de nb pays ce qui a rendu les mesures correspondantres inefficaces.

Même chose pour le traçage des cas qui a un effet initialement négatif puis qui devient positif

En conclusion, le confinement national semble avoir un petit impact (petit ΔR) mais cela s'explique parce qu'il est adopté après l'adoption de d'autres mesures simultanées

Cette conclusion n'exclut pas l'efficacité d'un verrouillage national précoce (ex : Nouvelle-Zélande, Chine), mais suggère qu'une combinaison appropriée (séquence et moment de la mise en œuvre) d'un ensemble plus petit de mesures de ce type peut remplacer un confinement national

Prises ensemble, "les mesures de distanciation sociale et de restriction des mouvements évoquées ci-dessus peuvent donc être considérées comme l'option nucléaire : très efficaces mais causant des dommages collatéraux substantiels à la société

Avoir une communication claire sur les risques est également efficace. A l'inverse, le nettoyage des surfaces infectées s'avère peu efficace mais peu de pays ont rapporté ces données

Les infections dans les transports en commun semble avoir une contribution limitée

Certaines mesures ont été adoptée par beaucoup de pays, à l'inverse les mesures peu adoptées ont un niveau de confiance plus faible, en raison d'un manque de puissance statistique

Côté méthode, le R a estimé avec des séries chronologiques des taux de croissance des cas

Pour quantifier l'impact des mesures sur le R, ils ont utilisé 4 méthodes
1- Une comparaison des pays mettant une mesure X vs les pays ne mettant pas en place cette mesure. La comparaison était appariée sur l'âge épidémique et le moment de mise en œuvre de la mesure

(modèle de régression multivariée qui prend également en compte la densité de pop, la poptotale)

2- Une régression par lasso qui sélectionne les mesures qui décrivent le mieux l'évolution du R

3- Méthode des forêts aléatoires (machine learning)
4- Modélisation de transformateur

Source : nature.com/articles/s4156…