Thread. Cercando di fare ordine nulla nuova variante di SARS-Cov-2 trovata in UK e conseguenze. Come è successo a Marzo si vedono pochi studi pubblicati in giro e tanti comunicati/tweet a riguardo. E questo non è un bene. Facciamo un po' di ordine. Premessa 1/n
Le mutazioni nei virus succedono continuamente, sono utili per seguire le "sotto-famiglie" di SARS-Cov-2, i discendenti insomma, ma non sempre hanno un significato biologico. L'ultima mutazione che ha cambiato drasticamente il virus è la mutazione D614G qr.ae/pNctqa
In UK è stato individuata una nuova "famiglia" di SARS-CoV-2 (chiamata B.1.1.7), che ha diverse mutazioni, fra cui ma non solo, N501Y. Questa famiglia ha in poco tempo rimpiazzato le altre (Fonte: virological.org/t/preliminary-…) 3/n
Questo è dovuto al puro caso? O ha un vantaggio selettivo sulle altre famiglie? Secondo gli autori del paper appena citato non è il caso, il virus ha un vantaggio (questo non è il mio campo, altri epi confermano?? @LucaFerrettiEvo @Di_SPACE_Lauro ?)
Ma la cosa importante è che non sanno qual sia questo vantaggio biologicao! Quindi suggeriscono di intensificare gli sforzi per capire di cosa si tratta.
Vediamo un po' le opzioni: aumentata trasmissione? E' la cosa più probabile, ma attraverso quale meccanismo?
Alcune mutaz suggeriscono una maggiore capacità di legare le cell. Sappiamo che la versione precedente ci metteva circa 15min a infettare una persona, forse questo ci mette meno? Non lo sappiamo. O forse è più efficiente a restare in forma di aerosol? Non lo sappiamo ancora
Questi "non lo sappiamo" sono il motivo per cui sia Londra che UK hanno cambiato i piani per il Natale, stringendo il lockdown e secondo me hanno fatto bene!!

FAQ: questo virus causa una forma più grave? No (fonte comunicato stampa :( gov.uk/government/spe…)
La nuova variante elude il sistema immunitario? No. Se così fosse avremmo tante persone che hanno avuto la COVID per la seconda volta, ma al momento non ho letto niente del genere.
La nuova variante rende inutile il vaccino?
No, Pfizer e Moderna usano un pezzo grosso di proteina del virus, e crea anticorpi contro diverse parti di questo pezzo, queste piccole mutazioni difficilmente influiranno sul risultato finale del vaccino
Questa variante sfugge al tamponi? Non in UK, qui si cercano 3 porzioni diverse del virus. La nuova variante fa perdere le tracce di 1, ma si risulta positivi alle altre 2. In Italia si usano geni diversi (non li conosco, qualcuno ha info? @vi__enne )
Concordo pienamente sul fatto che questo problema nasce dal punto di non voler controllare la pandemia


Se avete altre notizie twittate pure qui sotto, ma solo se ci sono le FONTI!!! Sono stanco di tweet e comunicati stampa.
Spero possa servire
Ah, una cosa ve la posso garantire! Può essere che questa variante fosse già in giro in Italia prima e non lo sapevamo perché l'Italia fa poche sequenze del virus (tanto a che serve), ma sicuro ci è arrivata ora con tutti gli spostamenti pre-natalizi che si stanno facendo.
Extra: anche in Italia la variante viene correttamente individuata dal test molecolare (grazie @nicolatosti1 e @AdrianaSpappa per le info)
ho controllato le sequenze e (a differenza di quelle UK) non sarà possibile capire se siamo di fronte alla variante originale o quella mutata solo dal test molecolare, andrebbe aggiunto un altro gene
E questo è quanto poco si sequenzia in Italia:
0,4 sequenze ogni 1000 casi di COVID contro 56 del regno unito.
E ci mettiamo 170 giorni in media per depositare le sequenze. Questa non è ricerca, è una barzelletta.

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