Thread by @pablotsukayama

Algunos comentarios post-anuncio del @Minsa_Peru sobre la variante británica del virus #B117 en Perú. 1/12

El genoma fue secuenciado en los laboratorios de @INS_Peru Entiendo que están trabajando con @DGE_MINSA y tienen acceso a muestras de viajeros que recientemente dieron positivo + sus contactos. 2/12

Esta la mejor estrategia para identificar introducciones recientes y cortar su transmisión antes que se propaguen por la comunidad. Es bueno ver a los equipos de rastreo de contactos en acción. Los vamos a necesitar en las próximas semanas. 3/12

Pero es probable que ya hayamos tenido múltiples introducciones de #B117 en los últimos días y semanas, y que estas ya hayan iniciado nuevas cadenas de contagio en Perú. 4/12

Con INS estamos coordinando una segunda estrategia: un muestreo *aleatorio* de 90 genomas de casos en Lima en diciembre, para ver si la variante ya se está transmitiendo en la comunidad. 5/12

Nuestro secuenciador está trabajando al 100% y hemos procesado la mitad de esas muestras. Tendremos el set completo el próximo viernes, informaremos a INS/MINSA y las subiremos a @gisaid para que todxs puedan analizarlas. 6/12

Esta vigilancia (rastreo de viajeros + búsqueda en la comunidad) debería realizarse de forma sostenida en varias regiones por todo 2021-2022. Solo así podremos saber cómo el virus está mutando y transmitiéndose en el país. 7/12

Aquí el reporte actualizado de países que ya han identificado genomas #B117. Chile y Perú no no aparecen porque aún no publican sus secuencias. 8/12 cov-lineages.org/global_report_…

Y algunas aclaraciones sobre lo que dijo la Ministra:

(1) No existe una red mundial de vigilancia genómica. Hay una red creada por OPS para coordinar la vigilancia en la región. INS coordina en Perú pero OPS no financia las actividades de vigilancia en los países miembros. 9/12

(2) No tenemos 17 centros de secuenciamiento, ni los hemos expandido a 40. Entiendo que solo INS y UPCH tienen capacidad instalada. Nuestro proyecto busca aumentar esta capacidad a 4 laboratorios más en Lima, Arequipa y Chachapoyas. 11/13

(3) Existe una red peruana de vigilancia, creada por INS en setiembre. UPCH y varias universidades participan. Pero no hay fondos y cada grupo es responsable de financiar sus actividades. 🤷🏻‍♂️ 12/13

OMS ha lanzado una guía para implementación de vigilancia genómica y promueve que los países mejoren capacidad local. Ya tenemos laboratorios, equipos y personal entrenado. Pero no tenemos fondos (estatales o privados) para ejecutar el programa. who.int/publications/i… 13/13