Thread by @CorneliusRoemer

Der @rki_de Bericht zu den besorgniserregenden Varianten (VOC) wurde endlich upgedatet mit Daten bis KW6. Das exponentielle Wachstum der drei Varianten #B117, #B1351 & #P1 setzt sich fort. Der bundesweite Anteil lag letzte Woche zwischen 20-25%.
Analyse des Berichts hier im 🧵⬇️

Als Hintergrund empfehle ich meine Analyse des ersten Berichts von vor 2 Wochen. Dann muss ich mich nicht wiederholen.
Spannend wird, was neu ist, was verbessert wurde und was nicht.
Erste Verbesserung: Bericht jetzt bereits Mittwoch da, statt Freitag. 2/

https://twitter.com/CorneliusRoemer/status/1357663596784852995?s=20

Diesmal gibt es eine neue Datenquelle! Zu den zweiwöchtenlichen Erhebungen in einem Teil der Labore mit Punktmutationsanalysen (Punkt 1) kommen Daten aus der "RKI-Testzahlenerfassung" hinzu (Punk 2).
Link zu RKI-Bericht: rki.de/DE/Content/Inf… 3/

Die wöchentliche statt 2-wöchentliche Periode ermöglicht schönen Plot aus Tweet 1.
Hier die Ergebnisse als Tabelle. Interessant ist, dass selbst die brasilianische Variante #P1 mittlerweile einen Anteil von fast 0,1% hat, also definitiv angekommen ist 4/
rki.de/DE/Content/Inf…

Hier die Tabelle mit den zweiwöchentlich erhobenen Daten. Ähnliches Resultat. Südafrika-Variante #B1351 ist etwas seltener (0,4 statt 1,3%), das liegt sicher daran, dass ein Hotspot in den einen Daten drin ist und in den anderen nicht (zB @Koeln). #B117-Anteil sehr ähnlich. 5/

Erster Kritikpunkt: Diese Karte ist unverändert nicht so gut.
Es wird die absolute Zahl der VOC-Fälle pro Postleitzahlbereich geplottet. Diese Bereiche haben aber unterschiedlich viele Einwohner, das sollte normalisiert werden.
Schlimmer: aus manchen Regionen kommen 0 Daten. 6/

Das weiße Loch um Rügen + Sachsen ist nur da, weil kein Labor bei der RKI-Stichprobe mitmacht. Man muss die Grafik mit ABSOLUTER VORSICHT genießen. Sie scheint gut, in Wirklichkeit ist sie aber kaum aussagekräftig. Außer, dass es in Nordost-Bayern ein riesiges Problem gibt 7/

Was ist die Entwicklung der absoluten VOC-Zahlen? Diese ist im Bericht nicht analysiert. Aber man kann diese einfach hochrechnen als Anteil * Fallzahlen:
Pro Tag steigt die absolute Zahl der VOC-Fälle exponentiell um 6%!
Das entspricht R=1,27 oder Wochenwachstum von 52%. 8/

Das ist exakt konsistent mit dem Modell der 2 parallel-laufenden Pandemien. Die Wildtyp-Zahlen gehen zurück, während die Mutanten absolut wachsen, bis die Gesamtzahlen wieder unweigerlich steigen.
Siehe Analyse der Kölner Daten ⬇️ (gibt's auch für BW) 9/

https://twitter.com/CorneliusRoemer/status/1361384387540119553?s=20

Erstmals werden auch Stichproben-Sequenzierungen nach Sequenzierungsverordnung sinnvoll ausgewertet (nach KW, Jahresvergleich war sinnfrei)
Auch dort steigt der Anteil, in KW5 sogar auf 15% für #B117 in KW5 (vs 10% nach PCR). Daten für KW6 für Sequenzen liegen noch nicht vor. 10/

Genauso wie die absoluten Fallzahlen der Varianten, kann man auch die Entwicklung des Wildtyps (nicht-Varianten) ableiten.
Der R-Wert für Deutschland in den letzten 5 Wochen liegt für Wildtyp bei 0,86. Deshalb fallen auch die Zahlen noch, trotz steigender VOC-Fälle. 11/

Spannend ist direkter Vergleich des Wildtyp-Plots ⬆️ mit den Gesamtfällen (also Wildtyp + Varianten) ⬇️
R ist durch die Mutanten bereits erhöht, bei R=0,89 statt 0,86.
Gesamt-R wird jetzt jede Woche steigen. Weil sich die Varianten mit R=1,27 gegen Wildtyp mit 0,86 durchsetzt 12/

Sehr traurig ist, dass selbst nach 1 Monat Sequenzierungsverordnung und 4000 übermittelten Sequenzen noch keine davon für die Forschergemeinschaft auf @GISAID veröffentlicht wurden. Deutschland hat Daten, teilt sie aber nicht solidarisch. Das ist einfach völlig inakzeptabel. 13/

Das RKI verwendet weiterhin diesen schlechten Plot im Bericht (übrigens die einzige Visualisierung neben der Karte!)
Die Wellen sind einfach nur da, weil die Zahlen zu klein, und die Repräsentativität schlecht ist. Homburg nutzt sowas gerne für einen Desinformationstweet. 14/

Grafiken sind super, aber dafür müssen die Daten stimmen. Das ist der Fall, bei meinen Plots oben. Diese gehören stattdessen in den Bericht. Unverständlich, warum sich das RKI nicht von meinen Analysen inspirieren lässt. Ich weiß, dass meine Kritik gelesen wird. 15/

Der letzte Teil des Berichts handelt von den (schlechten) Meldedaten zu VOCs direkt aus den Landesgesundheitsämtern. Darauf basierte das RKI die Fehlaussage vor 2 Wochen, dass #B117 nur in 13 von 16 BL detektiert worden sei.
Die Daten sind diesmal kaum besser. 16/

Aus Hamburg und Sachsen nur 2 bzw. 15 VOC-Meldungen.
Unter Annahme, dass dort #B117 ähnlich verteilt ist wie im Bundesschnitt sollten das 500 bzw 1000 Meldungen sein. Dunkelziffer also bei Faktor 250 bzw 80.
Besser: Thüringen, wo praktisch alle Mutationen entdeckt werden. 17/

Da die manche Länder also nichtmal 1% der Mutanten melden, andere aber praktisch alle ist diese Tabelle fast komplett wertlos. Das einzige was man ausrechnen kann ist eine Mindest-Mutantenquote. In Thüringen hilfreich, sonst nicht. 18/