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11 Apr, 13 tweets, 11 min read
Qu’est-ce que le variant indien "double mutant" B.1.617. ?

Un variant du #SARS_CoV_2 originaire d’Inde, décelé dès le 7/12/2020, qui pourrait être responsable d’une récente flambée des cas de 55% dans l’état du Maharashtra, après des mois de baisse. #COVID19 #DoubleMutant #B1617
C'est aussi un sujet d'inquiétude pour les scientifiques et l'état Indien, avec notamment 15-20% des PCR effectuées dans la province de Maharashtra, où circulent déjà le B.1.1.7 UK, le B.1.351 sud africain et le N440K, un ptit nouveau aussi #COVID19 #DoubleMutant #B1617
70% des séquences génomiques présentant les mutations B.1.617, et soumises à la base de données mondiale GISAID (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data) proviennent d'Inde.
Puis du Royaume-Uni (23%), Singapour (2%) et de l'Australie (1%) #COVID19 #DoubleMutant #B1617
Ce variant comprend deux mutations clés, E484Q et L452R, qui avaient déjà été retrouvées séparément mais pas ensemble dans une seule souche. #COVID19 #DoubleMutant #B1617
bbc.com/news/world-asi…
La mutation #L452R était surtout made in california (après un passage danois) ; elle est connue pour rendre le virus + transmissible, et des éléments indiquent qu'elle pourrait résister en partie aux anticorps, vaccins, ainsi qu'aux lymphocytes T #DoubleMutant #B1617 #COVID19
Cette mutation a été retrouvée dans plus de 400 génomes SARS-CoV-2 isolé et dans plus de 20 pays (bases Nextstrain et GISAID). C'est donc un "choix" positif du virus (enfin...positif, pour lui). #COVID19 #DoubleMutant #B1617

biorxiv.org/content/10.110…
La mutation E484Q s’est également avérée moins sensible aux anticorps neutralisants,mais il n'est pas encore prouvé qu'elle rend le virus plus contagieux.
#COVID19 #DoubleMutant #B1617
E484Q signifie qu’à l’acide glutamique (E) situé en 484e position (dans le RBD, donc) s’est une glutamine (Q)
#COVID19 #DoubleMutant #B1617

La mutation E484, que l’on trouve dans les variants ayant émergé en Afrique du Sud et au Brésil ...
posent problème en termes de réduction du pouvoir neutralisant des anticorps : cette diminution varie d’un facteur 35 à 60 avec les mutations E484K, E484Q, et E484P.
Bref, à suivre et de près ... si on cumule les mutations, dans des supers variants
#COVID19 #DoubleMutant #B1617
A lire et relire, l'excellent papier sur les variants et mutations de @StephaneKM vidal.fr/actualites/266…
Le tracker variants du @nytimes (un moteur de recherche intéressant)
nytimes.com/interactive/20…
PS : #DoubleMutant #B1617 vient d'être identifié en Californie. Il faudrait peut-être penser à la quarantaine des personnes provenant d'Inde @olivierveran jdcjdr
cnbc.com/2021/04/08/res…

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9 Apr
Sur quoi se fonde la HAS pour cette décision de recourir à un schéma de vaccination de type "prime-boost hétérologue" avec une seconde injection de type ARN messager (Moderna ou Pfizer)
#AstraZeneca Image
Sur
"de nombreux arguments en faveur de cette stratégie, déjà mise à profit dans le contexte du développement de certains vaccins (VIH notamment) et qui s’est avérée plus efficace que l'approche de prime-boost homologue"
#AstraZeneca ImageImage
Sur
"De nombreuses études en cours dans le cadre du programme européen Vaccelerate et les 1ères données relatives au recours au prime-boost hétérologue dans la vaccination anti-SARS-CoV-2 encore limitées mais encourageantes" mais théoriques et en cours d'études... #AstraZeneca Image
Read 7 tweets
9 Apr
La Haute autorité de santé @HAS_sante recommande donc officiellement d'administrer une 2e dose de vaccin #Pfizer ou #Moderna aux personnes <55 ans ayant reçu une 1ère injection #AstraZeneca, 12 semaines après cette 1ère injection #Covid19
Validé par @olivierveran ce jour
Il faut donc s'organiser car il nous reste 3 semaines compte tenu des dates des 1ères injections #AstraZenaca
Read 4 tweets
8 Apr
Qu'est ce qui est "SANS" risque ? Rien.
#COVID19

Et si on reprend les articles cités par @acadmed dans son communiqué, le risque est rare et évitable, et ne doit pas inquiéter outre mesure.

@franceinfo vous devriez pondérer. Image
Source 1

TROIS évènements indésirables sur 11 476 PCR nasales profondes ou oro pharyngées, soit 0.026%. 2 ruptures de la tige de prélèvement, et une luxation lors de l'ouverture de la bouche.
ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P… Image
Source 2

UN seul cas. Un truc rare, un état antérieur dont on a déjà parlé.
jamanetwork.com/journals/jamao…
Read 8 tweets
8 Apr
Bonne nouvelle #COVID19
Les Français sont de plus en plus nombreux à vouloir se faire vacciner: 42% en décembre, 70% aujourd'hui, +28 points.

Moins bonne : Il reste 14% d'opposants, ce qui peut poser problème à terme s'il faut 90% de vaccinés pour une immunité de groupe.
55% des 18-24 ans déclarent souhaiter se faire vacciner, c'est 84% des plus de 65 ans. Logique.

71% des personnes disent se méfier du vaccin #AstraZenaca. Logique aussi compte tenu du battage médiatique récent.
70% des personnes déclarent faire confiance au vaccin Pfizer, 65% à celui de Moderna et 59% au Janssen (Johnson and Johnson).

Source Odoxa odoxa.fr/sondage/oui-a-…
Read 4 tweets
8 Apr
Que vont devenir les 600.000 personnes <55 ans ayant reçu une injection #AstraZenaca qui sont dans l'attente de la suite de leur programme vaccinal?
Nous le saurons demain, avec la publication des recommandations de la @HAS_sante
Mais il n'y aura pas de surprise (je me spoile👇)
Car il est peu probable que cette deuxième injection soit de type #AstraZenaca, compte tenu des recommandations vaccinales modifiées en Europe et même récemment au RU, avec une cible désormais plus âgée, car moins à risque de thrombose.
Comme il est peu probable que cette dose #AstraZenaca soit "perdue" et que le schéma vaccinale reparte de zéro.
L'Allemagne a d’ailleurs déjà pris une décision en ce sens en validant la stratégie "prime boost" (qui est par exemple utilisée par le #SputnikV)
#AstraZeneca #COVID19
Read 12 tweets
8 Apr
Suite au rapport EPRAC (comité vigilance et sécurité du médicament de l'Agence Européenne) et à la remontée de cas de troubles de la coagulation, le MHRA (Agence britannique des médicaments) a modifié ses recommandations de vaccination #AstraZeneca

MAIS

gov.uk/government/new…
L'avantage du vaccin reste très significatif, comparé aux risques (via @alex_freeman), même sur 16 semaines d'exposition, quel que soit l'incidence #COVID19 (faible, moyenne et élevée)
Dans le cas d'un "low exposure risk", c'est à dire d'une incidence de 20/100.000, l'intérêt de la vaccination chez les moins de 30 ans peut éventuellement se discuter, d'un point de vue personnel #AstraZeneca #COVID19
Read 9 tweets

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