Thread by @mellziland

Hoje vou falar de uma variante que tem preocupado muitos pesquisadores desde sua primeira identificação, a B.1.618 e da B.1.617, predominantemente encontrada na Índia

Confira 🧶

Detectada inicialmente em West Bengal, na Índia, a primeira sequência foi depositada em 25/10/20, mas também já tem dados de ocorrência nos EUA, Suíça, Cingapura e Finlândia, entre outros locais

Mais infos em: cov-lineages.org/lineages/linea…

É caracterizada por deleções* de 6 nucleotídeos (H146del e Y145del), além das mutações conhecidas E484K e D614G na região da Spike. Fora da Spike, mutações na ORF1ab, ORF3a, ORF7a, ORF7b e genes relacionados ao nucleocapsídeo também são encontradas.

*

https://twitter.com/mellziland/status/1374779445844832262

Nessa imagem, observamos que as deleções podem estar envolvidas com escape da resposta imunológica, além da presença da E484K, e a mutação D614G pode estar associada com um aumento da infectividade

Fonte:

No fio do @vinodscaria , ele traz um link muito bom de um site em que podemos ter os dados de mutações que podem conferir escape de resposta imunológica para o SARS-CoV-2 aqui

clingen.igib.res.in/esc/#/data603a…

Thank you very much for your information, @vinodscaria !

Ainda não sabemos o impacto dessas mutações fora da Spike no comportamento do SARS-CoV-2, ou como essas alterações impactam na estrutura da Spike, fator importante para a interação com o ACE2 e a entrada na célula-alvo.

https://twitter.com/vinodscaria/status/1384375755392438274

🚨Mas um dado preocupante revela que há um crescimento da proporção de infecções por B.1.618 em West Bengal Em Fev/Mar, fruto da interação dessas mutações (adaptações conferidas) + ambiente e suas pressões seletivas

Dados do GISAID mostram que a B.1.618 é a terceira variante mais comum sequenciada nos últimos 60 dias (12%).

A B.1.617 é a mais comum entre as sequências ( 28%), seguido pela B.1.1.7 hindustantimes.com/india-news/new…

Sobre a B.1.617, foi observada ganhando espaço no estado ocidental de Maharashtra (Índia) entre dezembro de 2020 e março de 2021.

theguardian.com/world/2021/apr…

Em 24 de março, o ministério da saúde indiano relatou que 15% -20% das amostras sequenciadas na região (início da segunda onda do país) - carregavam duas mutações incomuns: E484Q e L425R. O número subiu para mais de 60% na região desde então. A variante foi nomeada B.1.617.

Chama a atenção a presença da mutação L452R, a qual pode ajudar o vírus a evitar alguns anticorpos da resposta imunológica, enquanto E484Q tem semelhanças com a mutação E484K, que pode conferir um escape ou resistência a ação dos anticorpos neutralizantes

@melmarkoski recentemente comentou sobre algumas essas mutações num fio dela

https://twitter.com/melmarkoski/status/1384902297457680384

Essa L452R também é encontrada na CAL.20C, um conjunto de variantes de preocupação nos EUA, comento aqui:

https://twitter.com/mellziland/status/1371872273309831170

Mas um alerta importante é feito no fio do @vinodscaria : No momento, não há evidências conclusivas de que essa variante impulsione a epidemia em W. Bengal. Mais investigações epidemiológicas precisam ser feitas, e o monitoramento é decisivo e necessário

https://twitter.com/vinodscaria/status/1384396135050014722

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