Ayer me enviaron enlace con virus aislado en orina de paciente, cultivado en células VeroE6 de riñón de mono. La carga detectada fue baja pero se evidencia infección y se plantea posible transmisión fecal/respiratoria urinaria. Se piden medidas de precaución. No se han tomado 😔
He hecho análisis comparativo de proteínas en BLAST entre la proteína Spike de SARS-CoV-2 y la del Spike del virus secuenciado. Y ¡son 100% idénticas! ¿Muestra de orina y muestra nasofaríngea y no cambia nada? 😳 yo lo veo algo raro, en FCoV eso no pasa. tandfonline.com/doi/full/10.10…
En la Pif se estudian mutaciones de muestras y distintos tejidos y que un virus no cambie ni un aminoácido en otro tejido pues no se, no parece muy natural. Aquí os dejo un documento con diferentes muestras de FCeV y FIPV en serotipo I, con diferencias en proteína spike.
El serotipo I es prevalente clínicamente pero es el más difícil de propagar in vitro, por eso me parece un documento importante a tener en cuenta para ver el cambio de FCeV a FIPV y su tropismo celular. También su ratio de mutación
Os lo dejo por si ayuda. arxiv.org/pdf/1412.4034.…
Otro documento que me enviaron fue de 2 pacientes diagnosticados de Covid en Canadá. Compararon sus genomas con genoma consensus de SARs-CoV-2 😔 pero no he logrado hallar su accesión para compararlos en BLAST. Solo las conclusiones. Si lo veis, me decís . wwwnc.cdc.gov/eid/article/26…
Al parecer el virus no se propagó en ninguna línea celular probada, aunque se observaron partículas similares a virus en linfocitos T primarios CD4+ por microscopía electrónica. Los datos sugieren que podría haber otros receptores como CD147 para facilitar la entrada a la célula.
Y los autores concluyen que es intrigante que las células T CD4+ puedan ser susceptibles al SARS-CoV-2, pero no permitieron la replicación del SARS-CoV-2 in vitro. Por tanto, se necesitan estudios adicionales para determinar la amplitud completa de los receptores celulares.
Me resulta curioso, ya lo he leído bastante, que no logren encontrar el virus en tejido pulmonar/intestinal/renal/cardíaco/hepático, etc o que cuando se aísla en células VeroE6 no consiga replicarse. Algo parecido sucede en Pif con serotipo I por eso se estudia más el serotipo 2.
Y por último he leído algo que me pasaron de ingeniería genética con TGEV, me ha parecido interesante y llamativo que entre los autores esté el Dr Enjuanes, si está haciendo la vacuna teniendo en cuenta al TGEV y la PIF dará con buena solución. Ojalá 🙏 mdpi.com/1999-4915/11/8…
Finalmente dejo algo sobre Pif que compartí ayer y que quizá ayude a investigadores que puedan estar interesados en estudiar mejor la Pif para entender mejor SARs-CoV-2.
Es del 2014 y valora receptores en tipos I/II journals.sagepub.com/doi/10.1177/03…
Gracias a todos los que en una simple conversación de Twitter habéis contribuido a que realice este hilo, por si algo de su contenido os ayuda con ESTE virus🙏.
Este trabajo que os he enviado en el hilo, su primer autor es del Dr. Alejandro Pascual-Iglesias. No lo nombré porque tras una conversación creí que iba a molestarle que alguien no científica lo mencionara y me equivoqué. Como dije, es interesante de leer. mdpi.com/1999-4915/11/8…
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A través del taxón 1928434 en el genoma entregado por China del 12 enero 2020 a las 8:17 y que quitaron ese mismo día a las 3:50, se ha sabido que usaron un Rattus norvegicus, en concreto muestra de heces de BJ2019RatCoV02 o RatCoV03 de Beijing
Y a través de los experimentos con gatos de Harbin también se ha podido saber qué tipo de gatos utilizaron en el laboratorio y qué tipo de Peritonitis Infecciosa Felina usaron en sus pruebas.
Gatos con un virus salvaje (FIPV HRB-17) en la forma húmeda.
Hay también estudios del descubrimiento de un nuevo linaje en ratas (Rattus norvegicus) en China. Con implicaciones para el linaje A de los Betacoronavirus. Al parecer hallaron un linaje distinto del coronavirus murino (MHV) y del coronavirus humano (HKU1) jvi.asm.org/content/89/6/3…
¿VIRUS CON HOJA DE RUTA? Este virus tiene diferentes vías de infección. Infecta bacterias, hongos, hemoparásitos, sangre. Tratar de ir mirando cada receptor según tipo de infección me estaba llevando a caminos lentos y complicados. He buscado otra forma de estudiarlo👇
Recordé un detalle del video de Dra. Acevedo gracias por enviarlo @davcamposnie 🤗 que llamó mi atención. Al parecer infectar una célula le lleva al virus muy poco tiempo, unos 10 minutos. Algo no cuadraba. Si infecta tan rápido ¿por qué no tenemos síntomas nada más exponernos?
Pienso que este virus necesita “paralizar” la respuesta inmune INNATA para “trabajar” cómodamente. Es la primera que surge como defensa contra cualquier patógeno. Por algún motivo (ya estudiado y no natural, sería vacuna?) sabe que debe anularla/engañarla. ¿Cómo podría hacerlo?
Hay dos cuestiones importantes en este virus que están vinculadas a su genoma.
1.Fuerte afinidad de este virus por el doble triplete CGG-CGG hace que el huésped elegido sea humano.
2.Ausencia de un aminoácido en el corte de furina.
Para la 1ª cuestión es bueno tener en cuenta que esta doble secuencia se encuentra en ADN de virus felinos con tripletes AGAAGA. En virus naturales es normal que algún nucleótido cambie sin que altere la traducción al ARN, pero no sucede lo mismo en SC2, sus codones no cambian.
¿Tal vez esta fijación y solidez de CGGCGG (producto de los anticuerpos del conejo introducidos en gato) pueda ser debida a la presencia de transposones que perpetúan su posición en el S1 del genoma? Es algo en lo que estaría bien poder profundizar. De momento, dejo la pregunta.
Hoy me he levantado con una noticia esperanzadora. Gracias a @franciscodeasis 🤗 que me ha pasado un hilo de J.G. Andersen... hablando POR FIN, de los coronavirus felinos. Al leer “tienen similitudes en PRRAR”, he sentido como tristeza.
Por supuesto Andersen es acérrimo de la teoría natural y bloquea y no permite debate con nadie que se salga de ella. Y como no se permiten publicaciones sobre teoría artificial pues su argumento de que “no hay evidencia científica” está a salvo. Deshonesto me parece hacer eso😔
Pero aún así la evidencia es aplastante. Nombra el consensus que se usa desde hace años R-X-K/R-R para decir que SC2 no encaja tanto. Considera que el FCS (sitio de furina) no es óptimo pero es suficiente para el éxito de SC2. (Pues menos mal que no es óptimo cómo infecta) 😳
Este virus está planteando unos problemas éticos importantes.
Según un estudio del New England Journal of Medicine, los niños portadores de Covid tendrían enfermedad más leve y contagiarían a adultos de manera más leve, sin requerir UCI.
¿Menos muertes a cambio de más enfermos?😔
Al parecer los niños excretarían una carga viral más débil por lo que su manera de contagiar a un adulto también sería más leve. Esto “ayudaría” a que los adultos no desarrollaran síntomas graves que los enviaran a las UCIs. Por contra podría haber más hospitalizados leves. 🤔
Personalmente y aún sabiendo que es difícil decisión, expandir covid por los niños para contagios más leves NO lo veo opción. 😔 Os dejo un estudio que establece una crítica a las evidencias de covid en niños, actualizado a marzo de 2021, por si ayuda aeped.es/sites/default/…