Μάλιστα δίνει και μια πιθανή "διέξοδο" για να ξεπεραστεί το πρόβλημα με τα συγκεκριμένα εμβόλια!
Εν συντομία, το πρόβλημα είναι μόνο στα εμβόλια ιικού φορέα, και τον τρόπο που λειτουργούν. Μετά τη μεταγραφή του γονιδίου της πρωτεϊνης spike στον πυρήνα του κυττάρου και πρίν...
/2
...τη μετάφραση σε πρωτεϊνη, μεσολαβεί "κοπτική" στο RNA (=RNA splicing) που τελικά οδηγεί σε παραλλαγμένες **διαλυτές** μορφές της πρωτεϊνης spike. Αυτές είναι που επικάθονται στον ACE2 υποδοχέα των ενδοθηλιακών κυττάρων και προκαλούν τις θρομβώσεις.
/3
Το γονίδιο στο J&J έχει λιγότερα splicing sites απ'ότι το AZ, ενώ στα mRNA εμβόλια **δε γίνεται splicing** (μεταφράζεται το μήνυμα απευθείας στα ριβοσώματα των κυττάρων).
Τροποποιώντας το γονίδιο στα εμβόλια J&J ώστε να μη γίνεται splicing, πιθανώς να λύνεται το πρόβλημα!
/4
Βέβαια αυτό δεν είναι άμεση λύση, και θέλει επανασχεδιασμό των εν λόγω εμβολίων...
Σε κάθε περίπτωση όμως, είναι εκπληκτικό πως σε ελάχιστο χρονικό διάστημα μπόρεσε να διαλευκανθεί ένας τέτοιος μηχανισμός. Η βιολογία έχει προχωρήσει πάρα πολύ!
Μια εκτίμηση της επιπλέον μεταδοτικότητας μπορεί να γίνει *και* στα ελληνικά data, κ μάλιστα αυτά τα λίγα και αδρά που δημοσιεύει ο ΕΟΔΥ.
/2
Πως? Από την κλίση της ευθείας μοντελοποιώντας το λόγο B.1.1.7 / non-B.1.1.7 σε διαφορετικές χρονικές στιγμές (με mixed-effects logistic regression with OLRE).
(Προφανώς δεν έχουμε adjustment για γεωγραφική περιοχή, ενώ έχουμε regression dilution γιατί πρόκειται για... /3
Επειδή χθες είχα μια συζήτηση με κάποιον που ισχυρίστηκε (δεν κάνω πλάκα) οτι ο @eody_gr δημοσιεύει επαρκή στοιχεία για την πανδημία... (ακούς @nyrros?😆)
Πορτογαλία: github.com/dssg-pt/covid1…
Επίσης downloadable με git. Μάλιστα πιο κάτω έχουν λίστα με δουλειές τρίτων βασσμένες στο επίσημο dataset.
Διότι οι σοβαροί φορείς δημόσιας υγείας δεν "κάθονται" στα data τους, αλλά ενθαρρύνουν τη χρησιμοποίηση τους από τρίτους.#OpenData (2/5)
Ην.Βασίλειο: coronavirus.data.gov.uk
Εδώ έχουμε πολύ πιο λεπτομερή visualizations, για να είναι αντιληπτά στο ευρύ κοινό, και τεράστιο πλούτο στοιχείων (με δεδομένα για τα κρούσματα ακόμη και σε επίπεδο δημοτικού διαμερίσματος!).
Download links υπάρχουν στη σελίδα About. (3/5)
Τα #δημοτικά θα πρέπει να αντιμετωπίζονται ως essential services, κατά τη διάρκεια του #lockdown2gr, όπως τα νοσκομεία και τα super-market.
Σωστά είχε πει ο @PrimeministerGR πως θα είναι τα ΤΕΛΕΥΤΑΙΑ που θα κλείσουν.
Δεν έχουμε κλείσει ούτε βδομάδα σε lockdown. Δεν είμαστε εκεί.
Η ζημιά που γίνεται στα μικρά παιδάκια είναι πολλαπλάσια από τον όποιο όφελος εκ του περιορισμού των μετακινήσεων των γονιών.
Δεδομένου πως ούτως ή άλλως οι μετακινήσεις δεν είναι και δε θα είναι ποτέ στο μηδέν, αυτό το >0 πρέπει να περιλαμβάνει τα #δημοτικά.
Για να μη σχολιάσω τι μήνυμα δίνει το να κλείνεις τα σχολεία, αλλά να γίνονται ποδοσφαιρικοί αγώνες...
Anyway, δεν πιστεύω οτι οποιοσδήποτε επιστήμονας ελάχιστα σχετικός με τη δημόσια υγεία μπορεί σοβαρά να έχει εισηγηθεί κλείσιμο #δημοτικών...
Αλλά αν ναι, show us the evidence!
Thread: Για ποιό λόγο το #lockdown2gr δυστυχώς δε θα κρατήσει μόνο 3 εβδομάδες (πολύ απλοποιημένα):
ΕΣΤΩ ότι (διότι τα ακριβή νούμερα δε τα λέει ο ΕΟΔΥ...) σήμερα έχουμε Rt=1.3, και 15 νέες νοσηλείες ΜΕΘ/ημέρα.
Ρυθμός με τον οποίο θα κάνουμε πλατώ περίπου στις 250 ΜΕΘ. (1/6)
Έστω 1 εβδομάδα η μέση περίοδος επώασης και το serial interval της #COVID19 (κανονικά είναι 5-6 ημέρες αμφότερα, βάζω 7 για απλούστερους υπολογισμούς).
Ας πουμε οτι με το lockdown ρίχνουμε *σήμερα* το Rt=1. Επειδή όμως έχουμε κρούσματα που επωάζουν, στο τέλος της πρώτης... (2/6)
...εβδομάδας θα έχουμε 1.3*15 = 20 ΜΕΘ τη μέρα κατά μέσο όρο. Ο οποίος αν διατηρήσουμε Rt=1 μένει σταθερός, και αντιστοιχεί σε πλατώ 330 κατειλημένων ΜΕΘ.
Ας γίνουμε πολύ πιο αισιόδοξοι: έστω Rt=0.85 με το lockdown. Εκεί έπαιζε το Rt το Μάιο, όταν μειώνονταν τα κρούσματα. (3/6)
τότε πρέπει να κάνουμε την ανάγκη φιλοτιμία & να πάμε σε καθολικό lockdown. Ο χρόνος δυστυχώς τελείωσε.
(2/9) Εκτός αν είμαστε ΟΚ με το ενδεχόμενο να πεθάνει μαζικά κόσμος (από κορωνοϊό αλλά κι από άλλα νοσήματα) λόγω έλλειψης ΜΕΘ.
ΑΝ συμφωνούμε αυτό πρέπει να αποφευχθεί πάση θυσία, πρέπει να πάμε στο "maximum" των μέτρων (=lockdown) ΣΗΜΕΡΑ και όχι αργότερα. Για δύο λόγους:
(3/9) Πρώτον, με serial interval 5-6 ημέρες, ότι μέτρα λαμβάνουμε σήμερα, επηρεάζουν την καμπύλη μετά από ≈2 εβδομάδες. Στο μεταξύ τα κρούσματα συνεχίζουν να σκαρφαλώνουν, και δη *εκθετικά*.
Δεύτερον, ακόμη κι αν καταφέρουμε να ρίξουμε το R από το 1,2-1,4 (εκτίμηση) σε ⩽1, ...
Thread: Η κρισιμότερη παράμετρος για τον έλεγχο της πανδημίας #COVID19 είναι ο πραγματικός αναπαραγωγικός αριθμός R (=πόσα νέα κρούσματα δημιουργεί κάθε υπάρχον).
Από τον μαθηματικό ορισμό του R, προκύπτει άμεσα το τι χρειάζεται να κάνουμε, για να ελέγξουμε την πανδημία: (1/6)
Αν R>1 η πανδημία εξαπλώνεται (εκθετικά), αν R<1 φθίνει.
Το R δίνεται από τον τύπο R = β*c*D, όπου: 1. β (contact rate): αριθμός κοινωνικών επαφών στη μονάδα του χρόνου, 2. c: πιθανότητα μετάδοσης του ιού ανά επαφή, 3. D: διάρκεια μεταδοτικότητας
(όλα μέσοι όροι προφανώς) (2/6)
Για να μειώσουμε το R<1, πρέπει να μειώσουμε τους τρείς παράγοντες του γινόμενου β*c*D:
1. Μειώνω τις επαφές μου: μένω σπίτι όσο γίνεται, περιορίζω τον κύκλο των ατόμων που συναντώ, δουλεύω με τηλε-εργασία αν γίνεται, αποφεύγω κάθε είδους συνωστισμό (μετρό, πλατείες, κλπ) (3/6)