[Thread] Voici quelques résultats de nos sérologies anti-S !

Est-ce que ça varie avec l’âge ? Est-ce que ça bouge avec le temps ? Peut-on le doser chez son chat ?!

C’est parti !!
⤵️⤵️⤵️
Préambule :

1️⃣ 299 dosages de mon labo. Il peut y avoir des biais de recrutement (on en parlera), mais j’ai aussi des sportifs de haut niveau (pas que des EHPAD ou greffés !)

2️⃣ Anti-S Roche ciblant le domaine RBD *a priori* bien corrélé au standard OMS
J’ai regroupé les données en 5 groupes :
1️⃣ Exposition documentée au virus < 6 mois (immunité « naturelle »)
2️⃣ 1 dose de vaccin > 7 j
3️⃣ 2 doses de vaccin > 14 j et < 6 mois
4️⃣ 2 doses de vaccin > 6 mois
5️⃣ Infection documentée puis vaccin > 7 j
Voyons tout d’abord les données globales :
- similaire entre 1 dose et 1 infection seule
- « boost » de la seconde 💉 (et encore mieux si infection + 1💉 mais ! Sd du survivant)
-↘️ du titre pour les vaccinés > 6 mois

Mais, nous sommes aguerris désormais, analysons + finement ! Image
- On ne peut négliger l’éventuel de l’âge (Paradoxe de Simpson, toussa…)

En effet, on observe visiblement une tendance à une diminution du titre d’Ac avec l’âge (que l’on soit vacciné < 6 mois ou > 6 mois) Image
Si on reprend pour les vax <6 mois vs >6 mois et qu’on regroupe par classes d’âge :

- on retrouve la diminution pour tous entre < et > à 6 mois (mais des chevauchements…)

-😲surprise pour les vaccinés > 6 mois : taux non statistiquement différents entre les <65 et >65 ans Image
Si on utilise le taux de 250 de l’OMS (contestable car me semble très très élevé), on trouve un taux inférieur à ce seuil chez 42% des >65 ans… mais aussi 38% des 40-65 ans Image
Ce qui nous manque, c’est la 𝓢𝓲𝓰𝓷𝓲𝓯𝓲𝓬𝓪𝓽𝓲𝓸𝓷 de ces taux.

Qq histoires de chasses :
- les taux faibles (< 50) sont svt chez les immunodéprimés / greffés
- les rechutes symptomatiques sont svt associées à des taux faibles d’Ac (sur des patients âgés)
Comme évoqué par ailleurs, il serait bien que ce genre de dosages soient réalisés chez les patients hospitalisés double 💉qui rentrent pour COVID…

Des données (indirectes) suggèrent que ce taux soit le reflet de l’immunité « utile » chez ces patients

nature.com/articles/s4159…
C’est d’ailleurs une base du travail mené par la @HAS_sante pour justifier la stratégie de la « 3è dose » : has-sante.fr/upload/docs/ap…
Mais avoir une corrélation est facile !
➡️ définir un seuil est biologiquement beaucoup + complexe (surtout si on veux une «garantie de protection»)
Parlons justement des chevauchements de résultats entre catégories :
- qq taux faibles chez des jeunes : souvent (pas toujours…) lié à une immunodépression (pathologique ou thérapeutique)
- les données à 6 mois sont très comparables entre les < et > 65 ans : la 3è dose…
limitée à cette population doit être vu comme une priorisation des patients à risque, plutôt que sur la base «ils perdent + vite leurs Ac» (qui est p-ê également vrai)

(Mes 299 sont pour l’immense majorité des inclusions dans des protocoles ou réalisés lors de la mise au point)
Pour ceux qui veulent poursuivre cette réflexion et alimenter le débat : quelques données complémentaires :



researchsquare.com/article/rs-858…
Mon opinion (je peux avoir tord) :

1️⃣ la collection des données anti-S _ET_ cliniques me
paraît indispensable (fraction des patients rentrant en hospit ?)

2️⃣ chaque jour je refoule des patients qui veulent un dosage anti-S plutôt que de se voir administré une 3è dose : …
le pass ne nécessitant pas pour les >65 ans cette 3è 💉conduit à ce que bcp cherchent à ne pas la faire («j’ai été malade la dernière fois !»)… et des médecins veulent prendre une décision de non injection en demandant ces dosages…😔

Au contraire
3️⃣ plutôt que d’apréhender
ce taux comme «suffisamment vacciné», on devrait l’envisager pour anticiper les éventuels échecs, not. pour les travailleurs exposés (soignants, contacts du public)
… QUAND on aura réussi à établir un seuil (cf 1)

«La biologie ce n’est pas un chiffre, mais une interprétation»

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14 Nov
Témoignage très intéressant :
Le fameux protocole « on ne ferme pas une classe quand il y a un cas +, on teste tous les élèves à la place »
Pourquoi ça coince ?
3 raisons ⤵️⤵️
1️⃣Déjà c’est limite : on détecte avec les tests à J0 ceux qui ont pu contaminer le cas 0 (ou des co-contaminés avec le cas 0), mais pas les cas contacts en incubation.

Donc c’est une bonne chose, mais tous les cas Nég doivent avoir masque (y compris maternelle) + repas isolés
2️⃣ Pour des tests en volume, la question clé c’est l’ANTICIPATION
Le pb n’est quasi *jamais* le test mais le temps administratif d’enregistrement des dossiers
=> il aurait fallu pour ces classes tests un enregistrement de tous les élèves au niveau des labos (avec valorisation €)
Read 7 tweets
6 Aug
Une fois n’est pas coutume, je vais aborder un sujet avec un regard prudent sur la maxime que l’on a bcp entendu «le variant delta est 1000 fois + contagieux»
Avec des vraies données à moi dedans

Est-ce que c’est si simple ? est-ce que les « CéTé » disent tout ?
Go !!
⤵️⤵️⤵️
la fameuse notion « il est 1000 fois + contagieux » vient de cet article :

medrxiv.org/content/10.110…
Ils ont comparé le signal de détection (les Ct) entre l’infection historique de Wuhan et le premier cluster chinois de variant delta.
Ils trouvent un signal 10 Ct + tôt, donc 2^10 = 1024 => voici la source du « 1000 fois + contagieux »
Read 14 tweets
5 Aug
Même en plein mois d’août, même à 4 jours du déploiement élargi du pass sanitaire, il ne connaît pas de repos.
Qui ça ?
Le DGS urgent pardi !!

solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/dgs-ur…

et quoiqu’il raconte ? ⤵️⤵️⤵️
Le titre nous parle de sérologies COVID pour bénéficier d’une vaccination « complète » avec une dose (rien de neuf sous le soleil jusque là, en tout cas pour ceux qui ont vu les 76 épisodes précédents)
MAIS….
chose amusante (on s’amuse comme on peut en lisant les DGS urgents, voyez donc l’état de mon système limbique), la 1ère phrase précise « en ville »… z’auriez pas pu le mettre dans le titre ?
Read 8 tweets
22 May
La recherche des variants COVID, déclenchée pour tout prélèvement positif en France, est réalisé par « criblage »
Comment ça marche ?
Pourquoi il y a des limites ?
Et pour quelle raison il va bientôt y avoir de GROS changements ?
C’est parti !!
Petit rappel tout d’abord : pour mettre en évidence le matériel génétique du SARS-CoV-2, on fait une « rétro transcription » (RT) pour transformer l’ARN du virus en ADN (car on ne sait travailler que sur de l’ADN) puis une amplification (PCR) de certaines zones du génome viral...
Pour cette PCR on utilise des « amorces » qui garantissent la spécificité de la zone choisie. Toujours par 2 ces amorces vont, et quand les 2 se fixent, on peut amplifier la zone en question, et par la suite détecter cette amplification.
Read 23 tweets
20 May
Je vais être très méchant. C’est lamentable cette historie car :
1/ dès le 1er jour on avait mis en garde dans les labos sur ce risque : «pas de problème, on va gérer les doublons efficacement, on a la meilleure méthode du monde» Arrogance du fonctionnaire qui n’y connait rien
2/ on apprend qu’il y aurait un soucis avec la casse (minuscule / capitale) : mais qui est le génie qui ne transforme pas tout en capitale pour les identités ? (Spoil : à ma 1ère formation d’identitovigilance on nous sensibilise à cela)
3/ il y a d’autres soucis (qui sous-estiment ou sur-estiment les cas +) qu’on a fait remonter (par ex discordance entre Ag et PCR dans les mêmes 24h, enfant sous 2 n° de sécu,...), mais porte close de l’administration qui refuse de « tout changer les tableaux déjà fait »
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