C'est la énième alerte au variant qui échappe à la neutralisation par les anticorps.

Mais cette fois-ci, il semble que le nouveau venu ait un potentiel d'échappement bien plus significatif.

Cela ne peut qu'être une mauvaise nouvelle. Mais à quel point ?
Même si rien ne remplace les conditions de la vie réelle (de toute manière, les études in vitro posent aussi la question de la concentration du sérum utilisé, et donc de la possible dilution des anticorps), il est maintenant fort probable que l'efficacité vaccinale
contre l'infection soit de nouveau entamée par l'émergence de ce nouveau variant.

Ce qui rehausse bien sûr l'intérêt d'une troisième dose dans l'optique de limiter la circulation virale au moins à court terme.
Mais la perspective de contrôler cette épidémie seulement par le vaccin et en faisant l'économie des gestes barrière semble de nouveau compromise dans un futur proche.

Pourquoi devons-nous contrôler cette épidémie ? Pour protéger les non-répondeurs au vaccin, peut-être pour
se protéger soi-même des éventuelles formes longues (nous ne savons pas aujourd'hui dans quelle mesure le vaccin en protège) mais aussi pour apporter notre pierre à l'édifice dans la lute contre l'évolution virale qui menace de produire encore et encore des variants.
En attendant peut-être un vaccin reprogrammé spécialement pour nous immuniser face à Omicron (espérons juste qu'aucun variant préoccupant ne surgisse dans l'intervalle).
En ce qui concerne l'efficacité du vaccin contre les formes graves induites par Omicron, il faut raison garder.

Je n'ai jamais adhéré à l'idée selon laquelle, si on n'a plus assez d'anticorps circulants, on retrouve exactement le même risque que si on n'est pas vacciné du tout.
Il faudrait pour cela qu'aucun des anticorps en mémoire ne fonctionne, et que la réponse soit aussi lente que si on n'avait jamais rencontré Spike.

Autant dire que ça n'arrivera pas chez tout le monde, loin de là.
On ne peut pas savoir à partir du taux d'anticorps circulants si les cellules mémoires seront réactivées pour produire des anticorps et à quelle vitesse lors d'une infection.
Conclusions :

🐞 La transmissibilité accrue d'Omicron par rapport à Delta ne peut pas être une bonne nouvelle.

🐞 Sa propension qui se dessine à réinfecter plus facilement les immunisés non plus.
🐞 Je ne crois pas à l'hypothèse du variant moins pathogène qui ne repose sur de la fausse logique (ex : s'il est plus contagieux, il devient moins mortel parce que ça s'équilibre).
C'est l'immunisation croissante de la pop° qui rendra indirectement ce virus moins dangereux.
🐞 Rien ne dit encore que le vaccin, qui plus est au bout de 3 doses, sera moins efficace contre les formes graves.
🐞 Si la capacité d'Omicron à se propager plus vite que Delta (car plus transmissible et parce qu'il infecte plus facilement les immunisés) se confirme, la perspective d'alléger l'application des gestes barrières s'éloigne en conséquence.
Car même si votre risque individuel de
faire une forme grave ne changeait pas fondamentalement, une circulation virale plus intense que ce qu'on a connu avec Delta pourrait vite peser sur l'hôpital, surtout en ce moment car le système de santé est exsangue.
🐞 Les gestes barrières sont toujours les mêmes qu'avant (aération maximale + masque en intérieur, voire en extérieur si contacts prolongés et rapprochés).
Éventuellement, on peut se donner pour objectif d'atteindre des concentrations de CO2 encore inférieures dans les lieux clos
si ce variant est beaucoup trop contagieux.

Quoi qu'il en soit, on n'a pas fini d'entendre parler de ce virus...

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10 Dec
L'immunité croisée si chère à Didier Raoult tombe à l'eau.
L'immunisation contre un autre HCoV entraînerait en fait un retard de la production d'anticorps spécifiques à SARS-CoV-2.

Il s'est trompé sur tout !

cell.com/cell-host-micr…
Traduction française : SARS-CoV-2 n'est pas le seul coronavirus humain (HCoV). Quatre autres sévissent pendant l'hiver. Ils ont pour noms OC43 (suspecté d'être à l'origine de la pandémie de grippe russe au 19ème siècle), HKU1, 229E et NL63.
Ces virus cohabitent avec nous depuis très longtemps et ne sont pas du tout aussi pathogènes que SARS-CoV-2. Dans l'immense majorité des cas, ils ne provoquent que des rhumes (toutefois, un certain neurotropisme a été mis en évidence, notamment pour OC43).
Read 12 tweets
6 Dec
🇯🇵 Japon 🇯🇵

Voilà ce qui s'appelle maîtriser une épidémie.

Et il n'y a même pas de #ZeroCovid.
Juste une meilleure discipline que nous sur le port du masque.
Une compréhension de la transmission par aérosols.
Des efforts concentrés sur les lieux de superspreading.

Bravo à eux.
Alors c'est vrai qu'ils testent peu par rapport à la France (euphémisme).
Mais leurs tests sont mieux ciblés, et de toute façon, si le virus circulait intensément dans la population, ça se verrait très rapidement dans les chiffres de la mortalité (surtout que la moyenne d'âge au Japon est supérieure à la nôtre).
Or, on meurt très peu du COVID au Japon.
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4 Dec
La théorie du réseau idiotypique de Jerne pourrait-elle expliquer les COVID longs et certains effets indésirables des vaccins ?

C'est du moins une piste avancée dans cet article paru dans le NEJM.

nejm.org/doi/10.1056/NE…
Pour éclaircir viteuf' : lors d'une infection à SARS-CoV-2 ou d'une vaccination, nous sommes exposés à la protéine Spike, ce qui va induire la production d'anticorps dirigés contre cette protéine S.
Chaque anticorps est composé d'une partie variable, spécifique d'une zone de l'antigène ciblé (dont la forme lui sera donc complémentaire), et une partie constante qui interagit avec d'autres acteurs du système immunitaire.
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3 Dec
🐞 PRONO 🐞

Ce sera l'obligation vaccinale (comment ?) pour emboîter le pas des Allemands ou le retour de certaines restrictions.

Dans tous les cas, ça reste un aveu d'échec alors qu'on avait les cartes en mains pour s'épargner une fin d'année difficile.
Si on veut tout miser sur le vaccin, encore faudrait-il rouvrir les centres.
A titre d'exemple, celui dans lequel j'ai fait mes deux premières doses ne prévoit pas une réouverture (et de toute manière, dois-je prendre la place d'une personne à risque juste pour garder mon pass
sanitaire ? Non.)

Si on veut lutter contre l'épidémie par des mesures non-pharmaceutiques, c'est raté.
On n'a que les restrictions à la bouche alors qu'il suffirait d'une meilleure communication, de plus de pédagogie et d'un certain nombre de mesures pas si contraignantes.
Read 7 tweets
28 Nov
🐞 THREAD 🐞

Aujourd'hui, ma mission consiste à vous présenter le PAXLOVID™, un nouveau candidat-traitement contre le COVID-19.

Je finis mon sport et je suis à v...
Ouch !

⬇️⬇️⬇️⬇️⬇️
Pas d'inquiétude, je vais bien !

Passons dès maintenant aux choses sérieuses, avec, pour commencer, un focus sur le SARS-CoV-2, agent responsable de la maladie infectieuse respiratoire appelée COVID-19.
Au coup d'envoi de l'infection, la protéine Spike du virus se lie à l'enzyme ACE2 présente à la surface de notre cellule.

Spike est la clé, ACE2 la serrure.

Crédit : Markus Hoffmann / German Primate Centre.
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26 Nov
🐞 Mini-thread 🐞

Puisque l'émergence de B.1.1.529 a mis le monde en panique, votre coccinelle doit vous en toucher deux mots.

On va commencer par éclaircir (un peu) le charabia ci-dessous.

⬇️⬇️⬇️⬇️⬇️ Image
🐞Premier black point :

Le RBD et le NTD sont deux régions de la protéine Spike.

(Ci-dessous, à gauche, D614, la souche sauvage apparue à Wuhan ; à droite, G614, le variant majoritaire lors de la première vague en Europe.) Image
Le RBD c'est la région de Spike qui se lie directement avec notre récepteur cellulaire ACE2.
Il s'agit donc d'un point chaud que tous les observateurs surveillent comme le lait sur le feu. Une mutation du RBD peut augmenter son affinité pour ACE2 et donc l'infectiosité du virus. Image
Read 32 tweets

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