Thread by @jamiesmurmur

#covid #omicron #reinfection #丹麥 #再感染

關於再感染的丹麥研究引起了不少討論，先來重點摘要：

- 品質足以做分析是否為重複感染的檢體有限
- 該發表採集樣本時段在Delta浪潮末尾至Omicron BA.2浪潮開始
- 有BA.1-BA.2、BA.1-BA.1、BA.2-BA.2重複感染的案例
- 感染BA.1後可短期再感染BA.2

這張是該發表的研究方法流程圖：

從指定時段內的1, 848, 466個確診案例
⬇️
找出1739例是間隔20~60天再度檢測出陽性
⬇️
將這些案例去做比對挑出1056個檢體去做定序分析
⬇️
分析過程中有433個檢體定序失敗
⬇️
263個案例可以做後續分析

要做再感染的檢驗分析難度其實很高，最後合格的樣本數並不多

時空背景資訊：

該研究採集檢體的時間段2021年11月22日至2022年2月11日為Delta浪潮的末尾接到Omicron BA.1的大流行，再到Omicron BA.2開始崛起

這可以告訴我們什麼？

- 該時段內的再感染者一定非常多感染過Delta
- Omicron BA.2再感染BA.2者應該不多，因為剛崛起不久

https://twitter.com/Laurie_Garrett/status/1519735674596999168?s=20&t=RDeDqezYnkvUiRBbjsV-nA

定序後該研究團隊得到怎樣的結果呢：

（第一次感染）- (再感染）：案例數
Delta - Delta：30
Delta - BA.1：26
Delta - BA.2：140
BA.1 - BA.1：17
BA.1 - BA.2：47
BA.2 - BA.2：3

注意：該發表時空背景下BA.2剛崛起不久，所以這篇儘管BA.2- BA.2 不多，但不能說這樣的反覆感染極度罕見

同時他們也追蹤了47例BA.1-BA.2的病人的狀況，其中有33例有回報，該圖表藍色代表BA.1感染，紅色代表BA.2感染

有28例於感染BA.2時有症狀，大多是輕症

有趣的是他們第一次檢測出感染BA.1主因是因為跟確診者接觸所以去做進一步檢測，而會去做第二次檢測（確診BA.2）主要跟出現症狀有關

該團隊針對定序後的結果去做進一步分析，想要找出是否有容易導致在感染的病毒株以及再感染者可能有哪些特性

以該研究的分析結果來說並沒有找到特定病毒株容易導致再感染，而該研究所分析之再感染案例大多都是未接種疫苗者

該研究指出：
- 確診後的確短時間內（20-60天）可能再度確診
- 過往說間隔60天以上檢測出陽性才可定義成再度感染這點需要重新評估
- 再感染主要人群為未接種疫苗者，但接種疫苗者也可能在感染（比例較未接種疫苗者低）
- 感染BA.1後可能在短時間內感染BA.2，尤其是沒接種疫苗或只接種一劑者

論文連結在此：

medrxiv.org/content/10.110…

以下為我個人的看法：
- 有可能再感染，但不一定檢測的了（檢體分析難度與品質要求高）
- 該發表的BA.2-BA.2再感染少見，不代表這樣的案例稀少；當時時空背景下BA.2流行浪潮才剛開始，但已出現案例這點我會視為警訊
- BA.4/5免疫逃避性更好，再感染案例可能會更多
- 謹慎面對疫情勿恐慌但也勿過度放鬆