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13 Dec, 4 tweets, 2 min read
Eu entrei hj pra resmungar que nao consegui (pela n-esima vez) bolsa de produtividade do cnpq. Mas ai descrubo por aqui que meu nome (e de todo meu grupo) saiu no plano nacional de vacinacao da covid...
Calcular os grupos de risco pars hospitalização e obito por covid para ajudar na definicao da fila dos grupos prioritarios (independente de qual vacina e de quando ela chegar) foi das analises mais importantes que fiz na vida. Se nao fosse essa zona toda eu estaria orgulhoso...
Entrevista da profa @EthelMaciel

g1.globo.com/politica/notic…
Ps: Soube aqui no twitter mas logo depois vi emails e grupos de whatsapp bombando. Eu q naontinha visto mesmo (sabado e recem nascido em casa ne?)

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Leo Bastos 🌻 Profile picture
2 Dec
95% que bruxaria é essa? Quem trabalha com estatistica está acostuma com esse número. Ele usualmente é usado na construção de intervalos como uma forma de representar a incerteza de uma estimativa.

Segue um fio sobre intervalos de confiança e credibilidade.
Quando se estima algo, é importante reportar a incerteza dessa estimativa. O método usado para estimar, q chamamos o método de inferência, vai dizer como a incerteza deve der representada e como chama la.
Sob a ótica frequentista, os parâmetros são estimados como funcao dos dados. E os dados são representados por um modelo estatístico chamado de verosimilhança. Alguns estimadores tem propriedades muito importantes que facilitam o calculo de intervalos e valores p.
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Leo Bastos 🌻 Profile picture
1 Dec
Pessoal, não existe isso de 95% de exatidão. Não inventem conceitos estatísticos. Image
A estimativa do grupo do Imperial é basesda em um modelo bayesiano, e portanto eles tem a distribuição de probabilidade a posteriori do Rt. E com ela eles podem fazer o que quiserem como calcular a P(Rt > ) ou o intervalo de credibilidade (a, b) tal que P(a < Rt < b) = 0.95.
Essa merda de exatidão de 95% não existe, s nao ser que esse conceito foi inventado nesse periodo q estou em licença paternidade e de repente a estatística resolveu sofrer uma revolução com a chegada de novos conceitos...
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17 Nov
Em 2020, casos e óbitos por SRAG são devidos a COVID-19?

A grande maioria dos óbitos e hospitalizacoes são sim!

Mas um caso de SRAG por ser outra coisa né? Sim pode, existem vários outras doenças que podem causar os sintomas que definem a SRAG, a influenza é a principal delas.
Segue a série da incidência de hospitalizados de SRAG do país todo nesse ano, 2020 (é um print do infogripe). O país todo está com classificado como período de atividade muita alta qdo comparado com o histórico. A série de baixo tem níveis de cores e nota se apenas o vermelho.
Agora segue a série (e mapa) da incidência de hospitalizacoes por SRAG por COVID em 2020 (ignorem o final da série pois o modelo de nowcasting não funciona bem nesse caso, ainda não resolvi isso). Percebam como a série de SRAG-COVID é similar a de SRAG
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Leo Bastos 🌻 Profile picture
25 Oct
Apesar de trabalharmos com esse dado há muito tempo, há um bom tempo eu não coloco as hospitalizações e óbitos por SRAG-COVID juntos. Aqui eu excluí as ultimas 5 semanas, pois além do atraso de digitação usual, têm os atrasos de laboratorio e de atualização do registro no SIVEP.
Percebam que as epidemias são bem distintas no espaço, e no tempo. Sul e Centro Oeste estão bem mais a direita, enquanto Norte e Nordeste tudo aconteceu nas primeiras semanas de epidemia no Brasil. O Sudeste teve um aumento rápido, e uma queda bem lenta.
Esse dado não é de SRAG, e sim SRAG-COVID, i.e. casos de SRAG com resultado positivo para SARS-CoV-2. As hopitalizações e óbitos estão definidos por data de primeiros sintomas, o que nos permite fazer a razão de óbitos por hospitalizados.
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24 Sep
Um caso interessante esse de Fortaleza, onde junto dados de dengue e hospitalizações por SRAG com COVID confirmada (SRAG-COVID). Segue o fio 1/n Image
A fugura mostra dados até a semana 29 para excluir problemas com atrasos de notificação tanto dengue quanto SRAG-COVID. Em vermelho tem-se a mediana e os quantis 10 e 90% de casos notificados de dengue de 2010 a 2019, para reforçar a heterogeneidade nas séries.
Para 2020, temos notificações de dengue (em verde) e SRAG-COVID (azul). Percebam que a série de dengue estava bem alta até a semana 11, quando de repente cai. Será que eu deveria pensar que a COVID-19 protege pra dengue? Nope.
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14 Jul
Dados de síndrome respiratória aguda grave (SRAG) no estado do Rio de Janeiro. Deixo aqui um parabens aos envolvidos (ironia!), estamos revertendo a tendência de queda.
Já me perguntaram o que eu achava do relaxamento do isolamento no Rio, e eu não tive dúvidas na resposta, os casos vão voltar a crescer. Não teve nenhuma cura mágica, por que iria continuar a cair se o comportamento das pessoas só mudou pra pior? Por que?
Notem q não são os casos confirmados de covid-19, são as notificações de SRAG que estão voltando a subir. Os casos de COVID-19 e depois os óbitos virão na sequência. Ao corrigir o atraso de notificação, uma mudança no padrão dos casos com pouco atraso é captada e "inflacionada"
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