İngiltere’deki mutasyonlar Mart ayında kurulan 20milyon pound bütçeli Covid19 genom konsorsiyumunun taramaları sayesinde bulundu. Bugüne kadar 157bin üzerinde SARSCOV2 genomu sekansladılar. Öncelikli olarak takip ettikleri mutasyonları ve sebeplerini anlatıyorum:
👉Mutasyonları okurken bilmeniz gereken 2 detay:
1️⃣Mutasyon numarası Protein sekansındaki kısma denk gelir, mesela D614G mutasyonu toplam uzunluğu 1273 aminoasit olan Spike kılıf proteinindeki 614’üncü aminoasit konumunu simgeler.
2️⃣Mutasyon harfleri de aminoasiti ve değişimi
1️⃣Mutasyon numarası Protein sekansındaki kısma denk gelir, mesela D614G mutasyonu toplam uzunluğu 1273 aminoasit olan Spike kılıf proteinindeki 614’üncü aminoasit konumunu simgeler.
2️⃣Mutasyon harfleri de aminoasiti ve değişimi
simgeler. Mesela D614G mutasyonu, Spike kılıf proteininin 614’üncü konumundaki D (Aspartik asit) aminoasiti G’ye (yani Glisin aminoasitine) dönüşmüş. Aminoasitleri de okuldaki biyoloji derslerinden hatırlarsınız, toplam 20 standart aminoasit vardır.
Gelelim mutasyonlara:
Gelelim mutasyonlara:
👉D614G: B1 soy kümesinde var.
Takip sebebi: lab deneylerinde daha bulaşıcı gözüküyor.
👉A222V: B1.177 soy kümesinde.
Takip sebebi: yayılıyor fakat bilinen bir etkisi yok.
👉N439K: B1.141 ve B1.258 soy kümesinde.
Takip sebebi: Lab deneylerinde ACE2 reseptörüne daha iyi
Takip sebebi: lab deneylerinde daha bulaşıcı gözüküyor.
👉A222V: B1.177 soy kümesinde.
Takip sebebi: yayılıyor fakat bilinen bir etkisi yok.
👉N439K: B1.141 ve B1.258 soy kümesinde.
Takip sebebi: Lab deneylerinde ACE2 reseptörüne daha iyi
bağlanıyor, ve bazı monoklonal antikorlardan kaçabiliyor.
👉del69-70: Silinme mutasyonu. B.1.1 ve B.1.258 soy kümelerinde.
Takip sebebi: Bazı monoklonal antikorlardan kaçabiliyor, ve bazı PCR testlerinde silinme yüzünden algılanmıyor. Doğru testi kullanmak önemli!
👉del69-70: Silinme mutasyonu. B.1.1 ve B.1.258 soy kümelerinde.
Takip sebebi: Bazı monoklonal antikorlardan kaçabiliyor, ve bazı PCR testlerinde silinme yüzünden algılanmıyor. Doğru testi kullanmak önemli!
👉N501Y: B.1.1.7 soy kümesinde.
Takip sebebi: Lab deneylerinde ACE2 reseptörüne daha iyi bağlanıyor, daha sıkça görülerek yayılıyor.
👉Y453F: B.1.1 ve B.1.1.298 soy kümesinde.
Takip sebebi: Lab deneylerinde ACE2 reseptörüne daha iyi bağlanıyor, insan ve vizonlarda var, bazı
Takip sebebi: Lab deneylerinde ACE2 reseptörüne daha iyi bağlanıyor, daha sıkça görülerek yayılıyor.
👉Y453F: B.1.1 ve B.1.1.298 soy kümesinde.
Takip sebebi: Lab deneylerinde ACE2 reseptörüne daha iyi bağlanıyor, insan ve vizonlarda var, bazı
monoklonal antikorlardan kaçabiliyor.
👉Bu mutasyonlardan Y453F henüz Birleşik Krallık’ta görülmedi.
👉Bu Covid19 genom konsorsiyumu 126,219 genomda toplam 1,777 aminoasit değiştiren mutasyon gördü.
👉Yaklaşık SARSCOV2 pozitif vakalarının %10’unda genom sekansına bakılıyor.
👉Bu mutasyonlardan Y453F henüz Birleşik Krallık’ta görülmedi.
👉Bu Covid19 genom konsorsiyumu 126,219 genomda toplam 1,777 aminoasit değiştiren mutasyon gördü.
👉Yaklaşık SARSCOV2 pozitif vakalarının %10’unda genom sekansına bakılıyor.
👉Bu mutasyonların konumunu görmek için görsele bakınız: Spike protein yapısı gösteriliyor, ve dışarıya bakan aminoasit mutasyonları belirtilmiş. Kaynak: cogconsortium.uk/wp-content/upl… 
👉del69-70 silinme mutasyonunun dağılımını bu tvitteki grafikte görebilirsiniz: Bütün Spike kılıf protein varyantlarının yüzdesi verilmiş (mavi), ve giderek artan del69-70 mutasyonu yüzdesi (turuncu) verilmiş.
https://twitter.com/The_Soup_Dragon/status/1340349639946629120
• • •
Missing some Tweet in this thread? You can try to
force a refresh
