Amb la nova variant de #SARSCoV2 descrita a Anglaterra que ha desfermat cert furor i neguit ha tornat ha emergir la mala praxi, o desconeixement, del que és una variant i del que és una soca, quan parlem de virus. No esmentaré el concepte “sepa” verbalitzat per alguns il·lustres
com Monica Terribas recentment, la Marató de TV3 crec, perquè això ja no seria virologia, si no...altra cosa.
Què és una soca viral? Què és un aïllat viral? Què és una variant?
Imagini’s que vostè atén un malalt de #CoVID19 i li treu una mostra, cultiva aquesta mostra en ...
monocapes cel·lular (una tècnica amb punts d’art), normalment cèl·lules Vero E6, i amb sort (i en funció de la càrrega viral del malalt) veurem com el tapis cel·lular és destruït per un element invisible. Si recuperem el medi post-infecció i mirem per microscòpia electrònica ...
“veurem” el virus, aquest element invisible; si agafem una petita porció del medi i el transferim a altres cèl·lules Vero E6 sanes, s’infectaran i moriran. Hem aïllat el virus, tenim un aïllat, un virus aïllat, separat del seu origen, l’infectat.
Tots aquest aïllats....
de diferents malalts, són #SARSCoV2, donen cos a la soca #SARS_CoV_2. I no, no són iguals perquè si agafem l’aïllat del pacient A, i el del B, i el del C que potser s’ha obtingut a milers de kms, i seqüenciem per saber exactament totes las bases del seu genoma veurem que poden...
presentar canvis, mutacions (errades en la replicació que els ha originat) però no per això deixen de ser i fer el mateix, tenen les “mateixes” propietats biològiques. I si algun aïllat tingués propietats biològiques noves o diferents, per exemple, poder-se unir a un receptor...
diferent, o generar un embolcall més resistent que el faci més estable a les condicions ambientals llavors, sí, llavors potser estaríem davant d’una nova soca.
La variant que ara preocupa (VUI-202012/01 o la primera “Variant Under Investigation” de desembre 2020) i que preocupa..
perquè ha sumat mutacions diverses en diferents punts del genoma (per sobre de la vintena), però no perquè les mutacions siguin noves ja que s’havien descrit prèviament en altres variants el darrers mesos, no difereix en res fonamental del primer aïllat que es constituí com....
la soca #SARSCoV2 a Wuhan el mes de gener de 2020. Es diu q és un 70% més transmissible q la variant “original”, l’estàndard circulant, de #SARS_CoV_2 (darrers càlculs baixen ara aquest percentatge al 55%) però aquest numero té molt més a veure ara mateix amb la epidemiologia...
que no amb la virologia. Els petits canvis i mutacions no tenen prou entitat per permetre poder parlar de noves soques, si no incorporen canvis visibles, mesurables, fins i tot dràstics. Només són variacions naturals, ja que els virus ARN muten...
per la seva natura intrínseca, variants dèiem més amunt, dins una soca, per ara única.
Encara que potser no per sempre aquesta unicitat; però aquesta, aquesta és tota una altra història. #SARSCoV2#SARS_CoV_2#CoVID19Catalunya
• • •
Missing some Tweet in this thread? You can try to
force a refresh
La noticia no està gens malament però el titular és de jutjat de guàrdia. Horrorós i implica nul·la comprensió. #ebola NO està eradicat del Congo. Senzillament està "pausat" gràcies a la vacuna #ervebo de #Merck. interactius.ara.cat/reportatges/ar…
I també gràcies a monoclonals com #mAb114 o #RegnEB3, i a molta feina de seguiment de contactes. Però només fins al proper salt #zoonotic. Mentre hi hagi reservori animal un virus NO podrà ser eradicat, a menys que matem a tots els membres del reservori. I això no és just, oi?
I després un tema lèxic, per què el #polio natural és "salvatge"? Primer, q més aviat seria silvestre, però el q va arribar després és el polio vacunal; per tant el primer, el paralitzant, seria polio, ras i curt, i el q genera la vacuna en alguns casos, seria el #poliovacunal.
Mirin vostès, si volen saber-ho "tot" sobre l'estabilitat i la dosificació de la vacuna de #Pfizer (no s'oblidin de #BioNTech) vs #SARSCoV2 mirin-se aquest pdf ... fda.gov/media/144413/d… Vagin sempre a les fonts originals. El resum? Una vacuna que ha de transportar-se i ...
emmagatzemar-se a -70ºC ( o més baix) però que s'administrarà a temperatura ambient, si us plau. Els vials s'han de mantenir protegits de la llum. Els contenidors de transport són especials per q permeten, en conjunció amb la neu carbònica, un material perillós, amb codi UN1845..
mantenir aquesta temperatura i es poden fer servir com a congeladors de camp reomplint amb gel sec quan aquest sublima (és pràctica habitual en el transport a llargues distàncies; nosaltres dsd @CReSA_r el contractem més d'un cop). Abans d'administrar cal descongelar, i aquí...
Començaré fort. Si no arribem a taxes de vacunació entre el 50-70% l’efecte de les vacunes vs #SARSCoV2 es veurà clarament compromesa. Recordin que les vacunes no ens protegiran, el que ens protegeix és la vacunació, i com més estesa en l’espai geogràfic i grups d’edat millor.
I la rapidesa amb que s’han obtingut aquestes vacunes fa malfiar alguna gent; òbviament hi ha els que no se la poden posar per estar en grups particulars on el quocient benefici/cost no és favorable (immunocompromesos per exemple, gent amb certes patologies) però també estan...
els a-mi-no-em-passarà-res, o els jo-no-la-necessito, jo-controlo, i després els conspiranoics, aquests ja directament estúpids.
Com és possible que hagin trigat NOMÉS 11 mesos en aprovar una vacuna? Si abans s’estaven anys, 5, 7 anys per aprovar-les, oi? Algunes coses que...
Potser els virolegs ambientals (o jo) no hem explicat bé això de #coronavirus i temperatura. Són els virus sensibles a les temperatures d'estiu (i a la insolació i la radiació associada)? Sí. Són els #coronavirus en general i #SARSCoV2 sensibles a temperatures de 30-37ºC o més?
Taxativament sí, no els hi poso els articles; al meu TL els poden trobar. Però, és un procés q necessita el seu TEMPS (hores, dies) i afecta bàsicament a superfícies i fomites i també als exsudats....però les #fomites MAI van ser un vector principal de transmissió de #SARSCoV2...
i els exsudats, les microgotes, no tenen massa temps per patir les condicions ambientals si...som a 30 cm del company/a a la terrassa del bar, o dins; o a una barbacoa, o ens toquem, abracem, i ens exhalem l'un a l'altre...aquí no hi ha temperatures q hi jugui cap paper pq no...
Llegit l'article. Jo descartaria la contaminació laboratorial com explicació a la senyal positiva de genoma de #SARSCoV2 detectada. Hi ha positiu a dues RTPCR de la mateixa mostra, pero no a E ni a N. Intrigant que sigui a UNA sola mostra; a baix nivell.. lavanguardia.com/local/barcelon…
Que ho sigui unes setmanes després del MWC del 19. Si assumim un origen asiàtic (xinès) potser BCN era EL lloc per detectar-ho. L'article ho fa en grans "pools", com són els volums d'aigues residuals de depuradora, però analitzar volums petits. #SARSCoV2 més q presumiblement...
inactivat. Si la introducció fou puntual i per "via xinesa" és logic q després desaparegué ja que retornà el colectiu amb infectats i el virus #SARSCoV2 ha de començar a propagar-se des de gairebé zero en població nova. Això amb una R0 de 3, i molts infectats no transmissors. ..
Altre estudi de inactivació de #SARSCoV2...ja em perdonaran és la meva dèria. El trobaran aquí... medrxiv.org/content/10.110…. Els hi resumiré breument... en forma líquida la càrrega virica practicament es manté inalterable, no s'inactiva a 4ºC. A temperatura ambient cau un 99,9%...
mentre que a 37ºC aquesta reducció del 99,9% (3 logs) s'assoleix en 24 hores i als 2 dies NO hi ha #SARSCoV2 infecciós...més del 99,99% d'inactivació. A 56ºC o 70ºC #SARSCoV2 és COMPLETAMENT inactivat en 30 minuts (99,99% reducció). Però sembla q estan vostes més interessats...
per les fomites, i també hi ha dades...sobre papers reduccions de la infectivitat de #SARSCoV2 del 99,9% en 30 MINUTS. Sobre roba, assolim aquesta reducció de infectivitat de 3 logs en 24 hores i a 2 dies NO hi ha infectivitat, i sobre acer inoxidable freguem 99,9% inactivació...