Thread by @Minimaliste13

Un fil pour faire le point sur la situation épidémique, à des fins d'archivage et dans dans l'espoir qu'il puisse être utile à quelqu'un. Je ne sais pas si nos voix peuvent se faire entendre, mais ce serait criminel de ne pas essayer.

Un très long fil.

#Reagissez

Les paramètres épidémiques fondamentaux du #COVID19 (proportion des asymptotiques, des cas sévères, des hospitalisations, des réanimations, des décès) sont connus (approximativement) depuis fin février : ils sont tels qu'aucun système de santé ne lui résiste lorsque R>1.

Ni la Californie, ni New York, ni la Suisse, ni la Suède, ni l'Allemagne, ni la France, ni le nord de l'Italie. Tous ont été balayés. C'est une maladie simplement trop mortelle, avec un temps de contagion et un pourcentage d'asymptomatiques contaminants trop important.

Deuxième enseignement (également connu depuis fin février) : en l'absence de mesure, son taux de reproduction est entre 2 et 3, ce qui signifie qu'il faut des mesures drastiques pour maintenir R en dessous de 1.

Quelle conclusion de ces deux ensembles de faits basiques ?

D'abord ce qu'il ne faut pas faire.

1) Laisser circuler le virus. "Une fois que l'épidémie est installée sur tout le territoire national, ça ne sert plus à rien d'empêcher les enfants d'aller à l'école ou autres" Sibeth Ndiaye, 05/03.

lci.fr/politique/sibe…

Le nombre de contaminations est dans ce cas sur une exponentielle violente. Le système de santé explose et pour un pays comme la France, on parle de centaines milliers de morts.

2) Se reposer sur une réponse graduée. "Vous avez vu que nous avons une stratégie claire, qui consiste à avoir une réponse graduée et territorialisée". Jean Castex, 12/10.

francetvinfo.fr/sante/maladie/…

Dans ce cas, R est abaissé, mais tant qu'il reste au-dessus de 1, la croissance demeure exponentielle, celle du nombre de morts aussi, les gens se lassent, se relâchent, R reste durablement au-dessus de 1, et on obtient août/novembre en France.

https://twitter.com/Minimaliste13/status/1300429793058488320

3) Agir par demi-mesure. "Partout sur le territoire, un couvre-feu sera instauré de 21 heures à 7 heures du matin. Toutefois, la circulation sera libre les soirs des 24 et 31 décembre" Emmanuel Macron, 23/11.

elysee.fr/emmanuel-macro…

Dans ce cas, R passe en-dessous de 1, mais pas suffisamment et suffisamment longtemps, tandis que les mesures sont pénibles pour tous, et invivable pour certains. Au bout d'un moment, la pression pour les relâcher est trop forte, R repasse au-dessus de 1. Cf. plus haut.

4) Viser un objectif haut. "Notre objectif à terme est simple : réduire très fortement les contaminations – de 40 0000 contaminations par jour à 5000" Emmanuel Macron, 28/10.

elysee.fr/emmanuel-macro…

Même s'il est atteint, ce qui ne fut pas le cas, que fait-on alors lorsque R repasse au-dessus de 1 ? On se relance dans une exponentielle comme dans les cas précédents, mais avec la lassitude en plus de la population ?

Conclusion : on sait depuis fin février que l'on ne peut pas vivre avec R>1, et on ne peut pas vivre avec les mesures nécessaires à R<1. Alors que fait-on ? Une seule solution : la suppression. Le seul objectif minimalement sensé est zéro cas. #ZeroCovid

https://twitter.com/Minimaliste13/status/1342593858828460032?s=20

Pour cela, on désormais a une gamme d'outils selon la situation. Dans le cas de la France, qui a une circulation élevée, il faut :

-Baisser drastiquement l'incidence et le nombre de cas.
-Vacciner en grand nombre.
-Éradiquer.
-Tester massivement pour détecter les résurgences locales.
-Appliquer des mesures puissantes et immédiates dès la moindre remontée du taux d'incidence (>5 pour 100 000).

De préférence, il faut appliquer ces mesures dans cet ordre, car vacciner lentement dans un contexte d'incidence élevé, c'est prendre le risque d'appliquer ue pression de sélection des variants plus contagieux ou résistants au vaccin.

https://twitter.com/EckerleIsabella/status/1345024694643208195?s=20

Et tester massivement mais sans avoir baissé drastiquement le nombre de cas et l'incidence est informatif, mais ne change rien à l'exponentielle.

Que change le variant V.O.C détecté au Royaume-Uni ? Toutes choses égales par ailleurs, son R est supérieur de 0,4 à 0,7 au virus non-V.O.C.

Cette phrase est la définition même de l'adjectif terrifiant.

https://twitter.com/MRC_Outbreak/status/1344601601823170560?s=20

Au plus fort du confinement de mars/avril, R est descendu à 0,6 en France. Peut-être que le confinement du Hubei en janvier/février a fait descendre R à 0,4, mais pour avoir discuté toutes les semaines avec un collègue qui l'a vécu à l'époque, vous ne voulez pas vivre ça.

Cela signifie qu'aucune mesure de confinement que nous avons connues, sauf peut-être les plus sévères (et encore) peuvent faire descendre R en-dessous de 1 pour V.O.C.

Sars-CoV-2 V.O.C circule depuis septembre au Royaume-Uni. Il a été détecté dans 32 pays, dont la Belgique, le Danemark, la France, l'Allemagne, l'Irlande, l'Italie, les Pays-Bas, la Norvège, l'Espagne, la Suède, la Suisse et bien sûr le Royaume-Uni.

Si vous pensez qu'il ne circule pas en France, j'ai un message d'Olivier Véran pour vous :

"Il n'y a pas de malade identifié ce soir sur le territoire national. Il n'y a ce soir pas de circulation du virus sur le territoire national", le 24/02.

lefigaro.fr/flash-actu/cor…

Et si on ne le détecte pas, c'est parce qu'un séquençage génétique est nécessaire pour le différencier de Sars-CoV-2 non-V.O.C. Or :

"La France, elle, séquence peu et ne partage pas ses données."

liberation.fr/sciences/2020/…

(Incidemment, j'ai une connaissance travaillant dans le séquençage génétique des virus que la politique de recherche française sur le sujet rend fou depuis le début de l'épidémie)

Dans ces circonstances, que faire : la plus élémentaire des précautions est de décréter immédiatement un confinement très strict, pour baisser drastiquement l'incidence et le nombre de cas et entamer un dépistage de V.O.C.

Immédiatement.

#Reagissez

Ne pas le faire, c'est prendre le risque (encore) d'une exponentielle (encore) qui d'ici quelques semaines balaiera (encore) notre système de santé et nous laissera avec des dizaines de milliers de morts à pleurer (encore).

Les paramètres de Sars-CoV-2 sont connus depuis février. Les événements se sont passés depuis exactement comme il était prévisible (et prévu) qu'ils se passent. Les deux fois. Castex et Macron nonobstant, l'exponentielle est une courbe assez prévisible.

https://twitter.com/Minimaliste13/status/1329357117300629506?s=20

Qu'avons nous à perdre à confiner maintenant, et très sévèrement ? Au pire, V.O.C a déjà disparu et on divisera par 8 le nombre de cas de Sars-CoV-2 non-V.O.C. Au pire, on en finira donc avec nos 150 morts quotidiens.

edition.cnn.com/interactive/20…

Et si, comme tout l'indique, V.O.C circule sur le territoire français, si son R est effectivement aux environs de 1,5 en ce moment ? Alors on est partis pour fêter les 100000 morts pour l'anniversaire du premier confinement.

Le choix ne me paraît pas si difficile.