טוב, אני צריך להתחיל לעבוד, ומישהו שאל אותי בפייסבוק את השאלה הבאמת נפלאה - "למה לא להזריק לאנשים, במקום נוגדנים וחיסון, את ACE2, שיתחבר לנגיף וימנע ממנו להיקשר ל-ACE2 שעל התאים?".

אז הנה שרשור על האשה שבתמונה, משוואות דיפרנציאליות ונוגדנים. >
לאשה הזו קוראים מוד מנטן, והביולוגים שמביינכם אולי כבר צועקים - "מיכאליס-מנטן!". אז כן, זאת מנטן ממיכאליס-מנטן. אני מעלה אותה ולא את לאונור מיכאליס (שמופיע בתמונה למטה), כי זו אחת מהדוגמאות הנדירות האלו שהאשה שהייתה שם ותרמה מזמנה אשכרה זכתה לחלק מהתהילה. >
מיכאליס (ביוכימאי) ומנטן (רופאה) היו מהראשונים בעולם שניסו לתאר ולנתח תגובה ביולוגית באמצעות אנליזה ומידול מתמטי. זה היה בערך ב-1912 בברלין, והעבודה שלהם סבבה סביב אנזימים וסובסטראטים. אנזימים הם חלבונים שמסוגלים לבצע איזשהי מניפולציה. סובסטראט הוא החומר עליו מבוצעת המניפולציה.
התוצאה של העבודה הזו הייתה משוואה דיפרנציאלית פשוטה שהפתרון שלה מתאר את היחס שבין קצב העבודה של האנזים לריכוז של הסובסטראט. הקבוע אולי הכי חשוב ומעניין במשוואה הזו הוא Km, שלמעשה מתאר כמה טוב האנזים והסובסטראט נקשרים אחד אל השני.
ולמה כל זה קשור לנוגדנים? כי את המודל הזה וההנחות שלו ניתן להחיל גם על קשירה של ליגנד לרצפטור, או נוגדן לאנטיגן. רק שבמקום Km אנחנו קוראים לזה Kd, או "קבוע הדיסאסוציאציה", או במילים אחרות כמה חזק הליגנד נקשר לרצפטור או הנוגדן לאנטיגן. >
עכשיו, אם יש לכם ראש מתמטי יותר והסתכלתם על המשוואה, אז אולי שמתם לב שהקבוע Kd נמצא במכנה של השבר, ולכן אולי כבר הגעתם למסקנה שיש יחס הפוך בין גודל הקבוע לעוצמת הקישור. או במילים אחרות ככל שה-Kd קטן יותר, כך הנוגדן או הליגנד, נקשרים טוב יותר! זה קצת לא אינטואטיבי, אבל... זה מדע >
וזה מחזיר אותי לשאלה שנשאלתי לגבי ACE2 לעומת נוגדנים. אז מה ה-Kd של ACE2 וספייק? ובכן בסביבות ה-100nM. לא משנה עכשיו מה זה M, אבל n זה נאנו. אז בערך 0.0000001M. או 10e-8, שזה ממש קטן, כלומר די חזק. >
ומה ה-Kd של נוגדן ממוצע לאנטיגן שלו? בערך 0.00000000001M. אם אתם סופרים אפסים זה יוצא 10e-11. כלומר בערך שלושה סדרי גודל יותר חזק מהקשירה של ACE2 לספייק של הקורונה. וכבר מהנתון הזה ניתן להבין למה נוגדנים מחיסון יתנו תשובה הרבה יותר טובה לנגיף, מסתם הזרקה של ACE2. >
אבל, צריך לציין, שנוגדנים לא נולדים עם Kd כזה קטן. בהתחלה ה-Kd שלהם יכול להיות די גדול. כלומר הקשירה שלהם אינה חזקה. התהליך שבו הנוגדן הופך להיות כל כך ספציפי ובעל קישוריות כל כך חזקה, הוא אחד התהליכים הכי מגניבים בגוף האדם >
התהליך הזה נקרא somatic hypermutation, והוא כולל יצירה יזומה של מוטציות בתאים שמייצרים את הנוגדנים, ואז ברירה של התאים שהצליחו לייצר את המוטציות הכי מוצלחות. למעשה מדובר בהדגמה של אבולוציה בזעיר אנפין שמתרחשת לכולכם בבלוטות הלימפה כל פעם שאתם חולים. >
ואם אנחנו כבר פה, אז נספר שזו אחת הסיבות לכך שמקבלים הרבה מנות של טטנוס בתור ילדים. וגם מבוגרים שמעולם לא חוסנו צריכים לקבל מספר מנות. החשיפה החוזרת מאלצת את הגוף להעביר את התאים מייצרי הנוגדנים דרך התהליך הזה פעם ועוד פעם ועוד פעם, עד ליצירה של נוגדן בעל קישוריות מאוד חזקה >
ונחשו מה? זו אחת הסיבות שבגינה לא כדאי לוותר על המנה השניה של חיסון קורנה. מנה שניה תתרום ליצירה של נוגדנים טובים יותר ויעילים יותר כנגד הנגיף.
היכולת הזו, במידה מסויימת גם מאפשר שינוי של נוגדנים כדי להתמודד עם ווריאנטים חדשים בעלי דמיון לווריאנט נגדו נוצרה החסינות החדשה. >
אז אחרי שניצלתי את ההזדמנות להשתפך על אחד המנגנונים המופלאים ביותר בטבע, הרשו לי לציין שיש עוד חסרונות להזרקה של ACE2 לעומת נוגדנים או חיסון: ACE2 חיצוני עלול להתחרות עם ה-ACE2 נאטיבי על הליגנד של הרצפטור. ובנוסף לכך היציבות של ACE2 בדם וקצב הדעיכה שלו מהיר יותר מזה של נוגדן. >
לסיכום... מוד מנטן... משוואה מתמטית... משהו על נוגדנים.

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with Aner Ottolenghi

Aner Ottolenghi Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @AnerOtto

17 Nov 20
אולי נדבר קצת על RNA? אבל ממש קצת, כי זה עולם ומלואו. ליטרלי... RNA נחשבת למולקולה היסודית לחיים הראשונים בכדור הארץ הצעיר. תקופה שזכתה לכינוי - עולם ה-RNA. יש לה תפקידים רבים וניתן להעביר עליה, ומעבירים עליה קורסים שלמים. >
אז ראשית RNA זה ר"ת של חומצה גרעינית ריבוזית, או RiboNucleic Acid. זהו חומר שדומה מאוד ל-DNA, אך נחשב פחות יציב מחד, ומאידך (וכפועל יוצא) יותר אקטיבי ונכון להשתתף בתגובות כימיות.
בניגוד ל-DNA בעל מבנה הסליל הכפול המפורסם, RNA נוטה להיות חד גדילי, אך זה לא מחייב, ולעיתים הוא מתקפל על עצמו ליצירת מבנים מורכבים בעלי יכולות קטליטיות. תפקידו המוכר ביותר של ה-RNA הוא לשאת את המידע המקודד ב-DNA אל מחוץ לגרעין התא. >
Read 36 tweets
16 Nov 20
ישנן מיסקונספציות רבות לגבי פלצבו במחקרים. אחד השימושים שלו בשלב *הבטיחות* הוא לאתר תגובות לוואי שנובעות "מנוצבו". רבים מניחים שתכלית הפלצבו היא לאתר תגובות לוואי שליליות, אך לשם כך ברוב המקרים לא נחוץ פלצבו, ולמעשה תכליתו היא בעיקר לנפות החוצה תגובות פסיכולוגיות "לא אמיתיות" >
ישי מראה את התופעה יפה מאוד בשרשור שלו על סטטינים, ואני אוסיף שבשנים האחרונות היא מתבלטת מאוד בשוק התרופות הביוסימילריות. תרופות שעושות את אותה עבודה על אותו מרכיב פיזיולוגי, אך הן שונות. זה בעיקר נכון לטיפולים נוגדניים, כאשר מוחלף הטיפול, אנשים מדווחים על הרעה דרמתית במצב >
התופעה הזו זכתה לכינוי נוצבו, שהוא בעצם הביזארו-פלצבו: המחשבה שמשהו פחות יעיל, או באמת יכול לגרום לך נזק, ולכן אתה חש רע יותר. ובהרבה מקרים זה ממש ניתן למדידה פיזיולוגית. אז למה נוצבו חשוב במחקרי *בטיחות*, לצורך העניין של חיסון, לצורך העניין לקורונה > Image
Read 6 tweets
12 May 20
אני רוצה להרחיב קצת על נוגדנים מונוקלונאלים, ולמה ההישג של המכון הביולוגי הוא אולי לא מדהים כמו שמשרד הביטחון רוצה שנחשוב, אבל מדוע זה עדיין הישג יפה שכרוך בעבודה קשה, ובהחלט עוד יכולות להיות לו השלכות חיוביות. ואולי קצת על איך בדיקות נוגדנים עובדות >
אבל, אני מוצא שבכל פעם שאני מנסה (או אפילו סוג של מצליח) לכתוב משהו בנושא (בלי לגנוז אותו באמצע), אני תמיד מרגיש שהרבה מהניואנסים הולכים לאיבוד כי קשה מאוד לדבר על דברים בלי קונטקסט ורקע. ואין לי ספק שלא ניתן להעביר את כל הניאנסים כולם, אבל כדי להעביר חלק מהם צריך להתת הרבה רקע >
כדי להבין מה זה נוגדן מונוקלנאלי, צריך להבין איך נוגדנים נוצרים בגוף, ובשביל זה צריך להבין מהם תאי B, ומהם נוגדנים בכלל. אז אני הולך לנסות להסביר בכמה חלקים קצת רקע בצורה טיפה יותר עמוקה, ואז לנסות להגיע משם לדברים יותר מתקדמים שמדברים עליהםבתקשורת כאילו הכל ברור ונהיר לכולם. >
Read 77 tweets
15 Apr 20
אחרי שכתבתי על תרופות אנטי-וויראליות בשרשור אחר, אני רוצה לכתוב עכשיו על השימוש בתרופות אנטי-דלקתיות בקונטקסט של covid-19, ספציפית על טוסיליזומאב, וסארילומאב. אני חושב שזה שרשור חשוב, כי קצת משמעם לי, אז... >
כמו בתרופות האנטי-וויראליות שנגמרו בסיומת 'וויר', אפשר לראות שגם תרופות אלו מסתיימות בסיומת מסויימת. אז וויר זה בגלל ווירוס, אבל דלקת באנגלית זה Inflamtion, אז מה הקטע עם מאב? אולי נתקלתם בעוד תרופות עם שם שמסתיים במאב, שדווקא מגיעות מעולם הסרטן. האם גם להן אפקט אנטי-דלקתי? >
ובכן לא. הסיומת מאב - mab, היא ר"ת של monoclonal antibody. או בעברית מאוד תקנית - נוגדן חד-שבטי. אבל אני הולך לקרוא לזה נוגדן מונוקלונאלי.
אז בעצם התרופה הזו היא נוגדן? כן! אנשים שמקבלים תרופות כאלו מקבלים נוגדנים. ואני בטוח שכבר שמעתם על טיפול עם נוגדנים לקוויד19 >
Read 25 tweets
26 Dec 19
לציוץ "סערת הציטוקינים" שלי הגיבו כמה אנשים בחשש שמא החיסון עלול לגרום להופעתם של זנים אלימים יותר, בדומה לחיידקים העמידים לאנטיביוטיקה. אז אחרי שנתתי יום צינון לפיד שלי, אני חושב שעכשיו אפשר לחפור קצת, על לחצי סלקציה והמבנה הגנטי של ווירוס השפעת. >
> אז האם באמת חיסונים יכולים לגרום להופעתם של זנים אלימים כמו חיידקים עמידים לאנטיביוטיקה? לפני שעונים על השאלה הזו צריך להתייחס להנחה הגלומה בה - שחיידקים עמידים לאנטיביוטיקה באמת אלימים יותר. ובכן... לא. זה בעיקר נראה לנו כך כי אנו חיים קרוב ל-100 שנים במציאות של אנטיביוטיקה >
> לפני אותו יום גורלי בו אלכסנדר פלמינג גילה את ההשפעה של הפנצילין בצלחות ששכח בסוף שבוע (וגם קצת אחרי, כי לקח זמן לפנצילין להיכנס לעולם הרפואה) אנשים פשוט מתו מזיהומים. מתו מזיהומים ממש פשוטים. אם היה להם מזל, היה אפשר לכרות איבר לפני שהזיהום התפשט. >
Read 21 tweets
24 Dec 19
ב-1918, בזמן התפרצות השפעת הגדולה, תועדו מקרים רבים של אנשים שחשו טוב בבוקר, לא כל-כך טוב בצהריים, ובערב כבר מתו. משפעת. התופעה הזו נדירה יחסית בשפעת עונתית ומאפיינת יותר שפעת פנדמית. אבל מה גורם לזה? איך מחלה שבד"כ היא לא הרבה יותר מלא נעימה, מכריעה אדם בריא בכמה שעות? >
> ראשית צריך להבין ששפעת היא לא מחלה קלה. יש לה מופעים קלים, אבל ברמת העיקרון זו מחלה קשה. לרוב כאשר אנו בטוחים שהייתה לנו שפעת, זה בכלל היה צינון שנגרם מווירוס אחר לגמרי. אדם בוגר בריא יחלה בשפעת בערך פעמיים בעשור. לכן אין להקל ראש בנוגע למחלה זו. לכו להתחסן! >
> עכשיו, אחרי שפינינו את זה מהדרך, אפשר לשאול איך ווירוס הורג בן אדם בכמה שעות. והתשובה לשאלה מתאימה מאוד לשמים המתקדרים לקראת הסופ"ש הגשום הבא עלינו, והבשורות העגומות מבתי-החולים על ילדים ומבוגרים במצב קשה ממחלת השפעת - סערה. סערת ציטוקינים ליתר דיוק. >
Read 16 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!