1/ Hier is een update van de #UKvariant #B117 groeicurves in verschillende landen en regio's. De verhouding B.1.1.7/overig (odds ratio OR) zou exponentieel groeien ongeacht gedrag van de burgers. (Dit draadje eerder in het Engels: 
https://twitter.com/hk_nien/status/1355634266399453194)
2/ Een 'log slope' 0,08 betekent dat de OR met 8 %/dag toeneemt. Bij elke dataset staat de publicatiedatum en of het is o.b.v. S-gene target failure (SGTF, d.w.z. PCR-tests) of genetische sequencing (seq).
3/ De 'log slope' kun je vertalen naar een reproductiegetalverhouding R_B117/R_overig = exp(log_slope*4) voor een generatie-interval van 4 dagen.
4/ N.B. bij de SGTF-data van 15 jan heb ik een achtergrondcorrectie (voor vals-positief op B117) toegepast (
https://twitter.com/hk_nien/status/1353417070260744197). De recente SGTF-data heeft lagere groeisnelheden; ik vermoed door een beperkte specificiteit voor B117-detectie.
5/ Recente data voor Engeland heeft een OR van 6: 85% van de monsters is positief voor de Britse variant. Een paar procent vals negatief o.b.v. SGTF zou hier veel invloed hebben. (N.B. dat is niet hetzelfde als vals negatief voor Covid-19!)
6/ De sequencing data voor UK, Denemarken, Portugal en Zwitserland (CH) tonen groeisnelheden van 7,6% tot 11,5% per dag: verdubbelingstijden tussen 6 en 9 dagen en een verhouding in R-waarden tussen 1,36 en 1,58 (Nederland: 1,40).
7/ Databronnen: DK covid19genomics.dk/statistics, NL tweedekamer.nl/sites/default/…, PT virological.org/t/tracking-sar…, CH sciencetaskforce.ch/nextstrain-phy…, UK 2020-12-31 imperial.ac.uk/media/imperial…, UK 2021-01-15 doi.org/10.1101/2021.0…, UK 2021-01-29 ons.gov.uk/peoplepopulati…
OMT advies 98 [tweedekamer.nl/downloads/docu…] noemt 19.8% UK-variant in week 2. De groeisnelheid is nu 0.105/dag (factor 1.11 per dag).
• • •
Missing some Tweet in this thread? You can try to
force a refresh
