Estimativas atualizadas dia 24/2, com dados considerados até 20/2 e estimativas até 27/2 (epiweek 8)

Totais estimados para SRAG e COVID-19

Hospitalizações por SRAG: 1,398 mil
Hospitalizações por SRAG-COVID: 827 mil
Óbitos por SRAG: 336 mil
Óbitos por SRAG-COVID: 248 mil
Vemos queda consistente da segunda, mas os intervalos reforçam que essa queda não é tão direta assim.

Seguem as hospitalizacoes por SRAG-COVID nos estados
Aqui vem os óbitos por SRAG-COVID
Destaco alguns estados, GO com uma onda em pleno crescimento
Santa Catarina @AlexandraBoing
Rio Grande do Sul @mellziland @schrarstzhaupt q ainda nao captou o q vem rolando na serra gaucha. (as hosp. por srag-covid estao comecando a retomar o crescimento)
MG tb mostra uma leve retomada nas hosp por SRAG-COVID @lucaszanandrez @olaciencia
Aqui no RJ a queda segue consistente. Mas a chegada da P1 pode mudar esse cenário @PaolaResende1 @MCrisLemos @danielsoranz
SP, o crescimento de casos na regiao de Araraquara ainda nao aparece nas estimativas do estado. @luizacaires3 @rizbicki @rafalpx @TaschnerNatalia
Bom é isso por enquanto. Essas estimativas são resultantes da parceria entre o MAVE e o @obscovid19br.
Notem que, SRAG contém SRAG-COVID. Pois

SRAG sao as hospitalizações ou óbitos notificados no SIVEP com a síndrome respiratória aguda grave independente do resultado do teste.

SRAG-COVID são as hospitalizações ou óbitos notificados como SRAG com confirmação de COVID-19.
Para a cidade do Rio, a gente ja comeca a ver uma mudanca nas notificacoes por SRAG.

covid19br.github.io/municipios.htm…
@MCrisLemos @DanielSchubert @PaolaResende1 estou marcando vcs de novo, pois eu coloquei as series de MG e nao do Rio🤦‍♂️

Como foi muito bem observado pelo @DaInformal (Valeu mesmo).

A serie de SRAG já começa apontar alguma mudanca, e qdo mudamos alguns parametros (cont)
A gente vê sinais de mudança de tendência, concordando com as estimativas do @obscovid19br (isso pode estar associado a uma mudanca no padrao de digitacao/atualizacao de casos q complica a vida do modelo). Enfim, os estudos nunca param...
Errata: As séries do estado do RJ são essas aqui. (No tweet original copiei e colei as de MG 🤦‍♂️ Num classico problema entre a cadeira e o laptop).

Aproveitando o ganho, qdo alguns parametros do modelo sao alterados há uma mudanca no sinal (cont)
Na série anterior usamos toda a série disponível de diferenca de bancos, e permitimos até 15 semanas de atraso (Dmax). Se usarmos menos informacao as ultimas 15 semanas de dados e Dmax=10 semanas (estamos dando um peso maior para notificacoes mais recentes) o cenario é esse
Já aparece um sinal de inversão da tendencia nas hospitalizações, o que é consistente com a chegada da P1 no estado. Vamos explorar mais essa parte metodologica pra ter a melhor estimativa possivel.
Agradecimento publico para o @DaInformal que acompanha a situacao do Rio identificou rapidinho que a figura estava diferente e me avisou da figura trocada.

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26 Feb
Um ano de epidemia de COVID-19 no Brasil, e até o momento foram notificados:

1.397.852 hospitalizações e/ou óbitos por SRAG [com intervalo de 95% indo de 1.381.176 até 1.418.825]

Dessas notificações, a COVID-19 foi confirmada em

814.906 [ 803.042; 830.619] casos de SRAG-COVID Image
Quantos aos óbitos, até o momento foram notificados

336.265 [332.504; 341.635] óbitos com SRAG

E desses, a COVID-19 foi confirmada em

248.267 [245.020; 253.072] óbitos com SRAG-COVID Image
As estimativas são baseadas num modelo estatístico que corrige o atraso de notificação, e os valores são estimativas até a 8a epiweek de 2021. Outros grupos, modelos e configurações paramétricas podem gerar estimativas distintas, por isso é imperativo sempre reportar incerteza. Image
Read 9 tweets
16 Jan
Óbitos por 100 habitantes (com correção de atraso) por estado.
Total de óbitos por estado
Óbitos por SRAG
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15 Jan
Atualização (11/1), Até a semana 1 de 2021. Casos e óbitos semanais notificados como SRAG confirmados com COVID-19

Obitos notificadas: 191.000
Obitos estimados: 201.376 (197.090; 207.187)

Hospitalizações notificadas: 629.108
Hospitalizações estimadas: 664.430 (656.033 675.103)
Casos hospitalizados por SRAG-COVID no Brasil
Óbitos por SRAG-COVID no Brasil. Por esse previsão estamos no pior momento da epidemia em termos de óbitos. Em algumas semanas a gente pode confirmar isso. A estimativa pra semana 1/2021 é de 8730 (5176, 14239), o pico em maio foi de 7500 óbitos por semana.
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13 Jan
Um pouco mais sobre os eventos graves num ensaio clínico, nao necessariamente no da coronavac. Qualquer ensaio clínico para covid.

Vamos supor que vamos fazer um ensaio clínico com 10000 voluntários, dois grupos A e B. E um dos objetivos é comparar os grupos para um evento raro.
No caso da Covid, hospitalizacao e óbito. Baseado no que a gente sabe até agora, em 10 meses de epidemia no Brasil (corrigindo atraso) tivemos até então:

645 mil hospitalizações por SRAG-COVID
200 mil óbitos por SRAG-COVID
Em um estudo com 10 mil voluntários na população, dividos em dois grupos de 5000, esperaríamos em 10 meses de estudo 15 hospitalizações e 5 óbitos em cada grupo.

O estudo precisaria ser muito maior para podermos diferenciar com segurança estatística os dois grupos.
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13 Jan
Sobre o estatiquês da divulgação da Coronavac de ontem (12/1).

Ele usaram um modelo de Cox para estimar a razao de incidências (HR hazard ratio) para diferentes desfechos, e calcularam a eficacia de cada desfecho usando:

Eficacia = 1 - HR.

Warning: Fio bastante matemático.
Antes de continuar, deem uma olhada no excelente fio do Otavio

Os desfechos são o tempo até o evento, onde 3 eventos foram apresentados: (i) caso de Covid confirmado (com eficácia de 50%); (ii) casos de Covid que buscou assistencia (78%); e (iii) casos hospitalizados (100%). Vou chamar de evento pra facilitar a vida. Image
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5 Jan
Nowcasting para óbitos no Brasil

Com os dados do opendatasus já organizados pela equipe de nowcasting do @obscovid19br (valeu @rafalpx )

Total de óbitos por SRAG-COVID corrigidos com atraso: 193.757 (190.030; 200.229)
Se olharmos a série de óbitos por SRAG corrigindo os atrasos já estamos com 269.774 (265.777; 276.123) vidas perdidas.

As figuras são muito parecidas, mas não são as mesmas.
Temos 270 mil óbitos por SRAG, desses 193 mil com confirmação confirmação.

Vale lembrar que desde março, nosso grupo (e acredito que muitos outros grupos tb) vêm afirmando que a maioria dos casos de SRAG são causados pela COVID-19.
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