Dvir Aran Profile picture
17 Jul, 14 tweets, 3 min read
למה זה קורה לנו? למה יש פה גל רביעי?
כשמסתכלים על התפשטות מחלה מסתכלים על ה-R האפקטיבי, כמה אנשים מדביק כל חולה. אחרי החיסונים הצלחנו להוריד את המספר הזה ל~0.7, וכך זה המשיך עד לכמעט אפס חולים. אז איך חזרנו ל-R~1.3? שרשור ארוך מדי על מחשבות שלי בנושא...
להורדת ה-R מה-R0 (יכולת ההדבקה של הנגיף ללא הגבלות וחיסונים) יש כמה סיבות שמשתלבות, לא רק חיסונים, וכדאי לדון מה התרומה שלהן למצב. לדעתי סיבות אפשריות הן (1) עליה של R0 בדלתא (כביכול יותר מדבק), (2) פריצת החיסון ע״י דלתא, (3) הורדת המסיכות, (4) ביטול התו הירוק,
(5) עליה מתמדת בהכנסת הנגיף מחו״ל, (6) מד ״פחד״ מהנגיף שגורם להגבלות אישיות וולנטריות. סביר שיש עוד סיבות, אבל זה מה שעולה לי לראש כרגע כבעל אפקט משמעותי.
בהפשטה, אפשר להסתכל על זה כך – נניח שהיינו ב-R אפקטיבי של 0.7, כל אחת מהסיבות תורמת משהו, למשל הורדת המסיכות יכולה להוסיף 0.2, פריצת החיסון עוד 0.2 וכן הלאה, וה-R האפקטיבי הוא הסכום של כל אלו יחד.
ה-R האפקטיבי הנוכחי, לאחר החזרת המסיכות לאיזורים סגורים הוא כ-1.3, כלומר, הסכום של כל 5 ההסברים הנוספים הוא כ-0.6, לא כ״כ הרבה, מה גורם לזה?
כבר כתבתי בפוסטים אחרים שאני מטיל ספק בהסבר 1, אין עדות שדלתא מדבק משמעותית יותר מאלפא. הסבר 2 כן מוכח, החיסונים כן פחות יעילים מול דלתא, אבל זה לא ירידה משמעותית. לפי כל העדויות יעילות החיסונים היא עדיין בין 80-90%. זה מעלה את ה-R האפקטיבי בסדר גודל של 0.2.
כביכול 3 כבר מחושב ב-R האפקטיבי. לדעתי לתו הירוק היה אפקט משמעותי, במיוחד בצמצום של אירועי הדבקה המוניים שהם נפוצים מאוד בקורונה, הרבה יותר ממה שמקובל לחשוב, ולכן לדעתי זה חלק משמעותי מה-0.6 שצריך לחפש.
בנוסף, מהנתונים רואים שעשירית (!!!) מהמאומתים בחודש האחרון הגיעו מנתב״ג, זה מספר מדהים, ובהנחה שכל אחד מהם הדביק 1.3 אנשים שבעצמם הדביקו 1.3 וכן הלאה, התרומה של זה ל-R האפקטיבי היא להערכתי סדר גודל של 0.3-0.4 מתוך עלית ה-R. זה מטורף.
יש גם גורם מאזן – ״מד הפחד״, אני חושב שיש לו אפקט משמעותי בהורדת ה-R, וכיוון שהמדד הזה עלה בחודש האחרון סביר שיש לו תרומה מסוימת. כלומר 5 ההסברים האחרים לא צריכים להסביר רק 0.6 אפקט אלא קצת יותר, אולי 1, כך או כך, לדעתי ההסברים שאינם קשורים בדלתא בעלי תרומה משמעותית בעליית ה-R.
מה המשמעות של זה? מספיק לתרץ את הגל הזה בדלתא. זה תירוץ קל, אבל אין הרבה עדויות לכך שיש לו חלק משמעותי. אמנם באופן קצת מבלבל, הפחדות עם דלתא כן מעלות את מד הפחד ובכך מקטינות את ה-R, אבל לא נראה לי שלזה אנחנו מצפים מהממשלה.
מה כן צריך לעשות? בראש ובראשונה להתמודד עם הפרצה מנתב״ג. זה פשוט מטורף שכבר יותר מחודש עשירית מהמאומתים הם מנתב״ג ועדיין לא נעשה דבר כדי לצמצם זאת ולהגביר את הבקרה על בידודים.

שבוע טוב!
לוחשים לי באזניה שסיבה נוספת היא דעיכת החיסוניות. עוד לא ראיתי נתונים ברורים לכך, אבל נדמה שיש כבר מידע שמאשש חששות כאלו. כך או כך, אני חושב שמהניתוח הזה, גם עם דלתא ודעיכת החיסוניות אנחנו עדיין יכולים להוריד את R מתחת ל-1 בהגבלות מקומיות וסגירת הפרצה מנתב״ג.
נראה לי שזה שווה תוספת
למי שהיה סקפטי עד עכשיו, לפי הנתונים הללו, אם סוגרים את נתב״ג מחר בבוקר בעוד שבועיים הR קטן מ1.

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with Dvir Aran

Dvir Aran Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @dvir_a

19 Jul
בואו נדבר שוב על נתב״ג. למה אני חושב שזה מקור כל הצרה?

אז קודם כל נתונים, מתחילת יולי (עד ה-17 לחודש) היו 9,169 מאומתים, מתוכם 922 הגיעו מחו״ל. תעשו את החשבון לבד. אם ה-R שלנו הוא 1.3, בלי מאומתי נתב״ג אנחנו ב-1.17, בערך חצי מהדרך להקטנת ההתפשטות.
אבל זה רק חישוב נאיבי. אין לי את המספרים המדויקים, אבל בהנחה שנכנסים 20,000 איש ביום לישראל, כ-0.25% מהחוזרים נושאים את הנגיף. באותה תקופה, הסיכוי היומי להדבק בכלל האוכלוסיה ~0.005%. זה יחס של פי 50.
כלומר, הסיכוי של חוזר מנתב״ג להיות חולה ולהדביק אחרים הוא פי 50 (!!!) מאשר אדם אקראי. גם אם יש תת-אבחון בישראל, זה מקסימום פקטור של 2, לא מתקרב ל-50.
Read 6 tweets
18 Jul
Finally, some data from Israel on vaccine effectiveness. Before we start, a couple of comments: 1. Almost all new infections in Israel are with the delta variant. 2. We don’t believe confirmed cases count since there are complicated incentives for testings. Image
The data that we look at is new severe hospitalizations by age group and vaccination status. Let's look at the numbers:

Since the start of July, there were 117 severe cases. Of them, 79 in ages 60+, 28 in ages 40-60 and 10 below 40.
> In the 40-60 group (blue), 8 of the 28 were vaccinated (29%). About 85% of this group is vaccinated, so this translated to ~90% effectiveness. More or less what we expect. Great. (below 40, there are 10 unvaccinated severe patients)
Read 9 tweets
18 Jul
מסתבר שבמצגת ״מכלול אשפוז״ של משרד הבריאות יש נתונים על חולים קשה לפי סטטוס חיסון. יש כאן מספר קבוצות גיל. הנתונים על אחת הקבוצות מטרידים, ומצוינים על השניה. היה הרבה רעש על מחסור בנתונים בימים האחרונים (@rutihersh), אז נראה לי שזה שווה פוסט. נצלול למספרים -
נתחיל בקבוצת הגיל 41-65 (כחול). בקבוצה זו 28 חולים קשים, מתוכם בין 6 ל-11 לא מחוסנים (יש 5 עמודות בהן אין מספר בסוגריים), שזה 20-40%. בהנחה שכ-85% מקבוצה זו מחוסנים זה מתרגם ל-90-95% יעילות במניעת מחלה קשה. אחלה.
בקבוצת הגיל 65+ (אדום) ספרתי 79 חולים קשה, מתוכם 71 מחוסנים (בסוגריים) (90%). זה רק קצת פחות מאחוז המחוסנים בקבוצת גיל זו. נראה שהחיסונים לא יעילים במיוחד בקבוצה זו. נתון מטריד מאוד. מה יכולים להיות ההסברים? הנה רעיונות:
1. אם 98% מחוסנים בקבוצה הזו אז זה כן מתרגם ל80% יעילות.
Read 10 tweets
4 Jul
איך יודעים שדלתא יותר מדבק מאלפא? ברור, תוך זמן קצר מאז שהתגלה הוא הוריאנט הפופולארי ביותר במדינות רבות. סחף גנטי מהיר קשור בדרך כלל ביתרון אבולוציוני, ויתרון אבולוציוני במקרה שלנו הוא ״יכולת העברה״. אבל זהו, לא בהכרח. היו איתי לשרשור ארוך שכולל בעיקר מחשבות =>
דלתא התפשט ברחבי הודו במשך תקופה ארוכה והדביק שם בתוך תקופה קצרה מעל 20 מליון איש (מזוהים, סביר שהרבה יותר בפועל). בגלל שיש כ״כ הרבה הודים, ובגלל שבחודשים אלו הוירולנטיות הכלל עולמית היתה בדעיכה, דלתא הפך לנפוץ באופן ממוצע: באפריל-מאי זוהו בהודו 17 מ׳ איש, בשאר העולם רק 23 מ׳ איש
בגלל מחסור חמור בשירותי בריאות, הודים רבים שנחשפו לנגיף בחרו לברוח מהודו למערב. הבריטים בחרו לא לעצור את הטיסות מהודו (נקיפות מצפון?) ונתנו לעשרות אלפי הודים שנחשפו לדלתא להיכנס למדינה. במצב שבו ה-R של וריאנט אחד מתחזק כל הזמן בגלל ייבוא מבחוץ הוא ישתלט מהר מאוד.
Read 17 tweets
21 Mar
האם חיסוניות-עדר אפשרית? לפני כחודש רואינתי לכתבה הזו ב-@Nature. מסקנת הכתבת היא שחיסויות-עדר אינה סבירה. לדעתי, העדויות המצטברות דווקא מעידות שאנחנו כבר חצינו את החסם של חסינות עדר. (פוסט בעברית לבקשת @Meir_Rubin) --> nature.com/articles/d4158…
הכתבת מזכירה 5 סיבות: 1. לא ברור עם החיסון מונע העברה. אני חושב שיש כבר מספיק עדויות לכך שהחיסון כן מונע העברה, וברמה גבוה מאוד, כנראה באיזור ה-90%. 2. יש מדינות מחוסנות יותר ויש פחות ולכן לא ניתן להשיג שליטה גלובלית. תודה לאל, אנחנו ביותר.
3. הוריאנטים החדשים - בישראל כבר השתלט לחלוטין הוריאנט הבריטי, כך שמה שאנחנו רואים כבר כולל את השינויים שהוא מביא איתו (והוריאנטים האחרים כנראה לא מדבקים יותר, אפשר לדון בכך בנפרד).
Read 7 tweets
21 Mar
Is herd-immunity probable? I was interviewed a month ago for this piece in @Nature. The conclusion of the reporter is that the answer is no. IMHO, with the emerging evidence coming from Israel the answer is YES!
nature.com/articles/d4158…
Why? First, empirically, Israel opened almost everything and R is at ~0.66. Second, more evidence suggests that transmission-blocking is high (~90%). Third, immunization in Israel is already after the B.1.1.7 variant is dominating (>90%).
About a month ago @geller_mic posted this model on what vaccination rate required for herd-immunity. With no restrictions and R~4, we estimated it at 90%. Our mistake was that vaccines are probably highly protective against transmission.
Read 4 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!

:(