Tweet

Han-Kwang Nienhuys

1 Oct, 9 tweets, 5 min read

1/ Reproductiegetal Nederland oktober; t/m 23 sep: R=0.99. Door testen voor toegang (TvT) voor horeca mogelijk een week lang verhoogde R-schattingen. Effect lijkt wat groot (6% meer positieve tests). Effect van 25 september gaan we de komende dagen zien.
#COVID19NL

https://twitter.com/hk_nien/status/1421825780372447234?s=20

2/ Achtergrondinformatie:

https://twitter.com/hk_nien/status/1421825780372447234?s=20

N.B. "% gevaccineerd" in de bijschriften staat voor hoeveel mensen alle prikken hebben gehad van de totale bevolking (inclusief kinderen), volgens RIVM; "1 prik na doorgemaakte infectie" telt hier niet mee.

3/ Correctie op nr. 1: een R-toename van 0.9 naar 1.0 als gevolg van bijvangst door TvT zou betekenen +20% positieve tests door TvT (niet +6%). En dat zou vrij veel zijn. Maar de cijfers daarover komen pas a.s. dinsdag.

4/ Update reproductiegetal Nederland t/m 25 sep ("einde 1,5 meter"): R=1.01. Geen dramatische groei zoals met Dansen met Janssen rond 26 juni. Als verhoogde testbereidheid oorzaak is van de sprong op 18 sep, moet R morgen weer zakken. We zullen zien.
#COVID19NL

5/ Update reproductiegetal Nederland t/m 27 sep: R=1.07. #COVID19NL
Ruim boven de 1. Daar is-ie-dan-toch, het "met QR-code hoeft anderhalve meter niet meer" effect.

6/ Update reproductiegetal Nederland t/m 28 sep: R=1.06. #COVID19NL

7/ Update reproductiegetal Nederland t/m 29 sep: R=1.21 (datapunt), R=1.17 (voorlopige trendlijn).
Gisteren was er een datastoring. Ik heb 15% van de positieve tests van vandaag toegekend aan gisteren; op 28 sept: R=1.12. #COVID19NL

8/ Update reproductiegetal Nederland t/m 30 sep: R=1.29 (datapunt), R=1.25 (voorlopige trendlijn). #COVID19NL
Bij R=1.25 is de verdubbelingstijd 12 dagen. Als dat zo blijft, zitten we over een maand op het record van december (met minder ziekenhuisopnames).

9/ Update reproductiegetal Nederland t/m 1 okt: R=1.31 (datapunt), R=1.28 (voorlopige trendlijn).
Gemeentes in de Bijbelgordel + Urk: R=1.4.
Verdubbelingstijd 10.5 dagen (R=1.3) of 8 dg (R=1.4).
#COVID19NL

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh

This Thread may be Removed Anytime!

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

More from @hk_nien

Han-Kwang Nienhuys

@hk_nien

13 Jul

1/10 Over de vertraging in de testuitslagen. De teststraten lijken het redelijk vol te houden; als ik 's morgens vroeg een afspraak probeer te maken krijg ik bij de meeste postcodes wel een tijd later op de dag (sinds zaterdag). 's Avonds lijkt het boekingssysteem overbelast.

@mzelst

2/ @mzelst heeft gisteren getweet over vertragingen in de PCR-labs en GGD-administratie.

https://twitter.com/mzelst/status/1414585649450061827

Hoe groot is de impact daarvan nu?

3/ RIVM publiceert dagelijks casusdata. Daarin staan voor elke datum o.a. hoeveel positief geteste mensen op die dag hun eerste ziektedag (DOO) of positieve uitslag (DPL) hadden. Deze cijfers veranderen dagelijks met terugwerkende kracht.

Read 17 tweets

Han-Kwang Nienhuys

@hk_nien

10 Jul

1/6 Reproductiegetal per variant o.b.v. RIVM data. (Betrouwbaarheidsinterval 68%). Rδ=1.1 rond 18 juni; toen 57% van de infecties. De verhouding Rδ/Rα varieert tussen 1.4 en 1.9. Over twee weken zijn 99% van de infecties δ-variant; momenteel 85-90%.

2/ Rond 18 juni was 29% van de NL bevolking volledig gevaccineerd (bron: RIVM; excl. 14 dagen wachttijd). Zeg 80% werkzaamheid tegen symptomatische èn asymptomatische δ-besmetting. Verder nog immuniteit na doorgemaakte ziekte.

3/ De groepsimmuniteit zal netto ongeveer 40% zijn geweest. Zelfde som over twee weken (14 juli): 60% groepsimmuniteit. Op 18 juni had δ dus R0=2.2, d.w.z. de theoretische R met het gedrag van toen, maar zonder effect van groepsimmuniteit.

Read 6 tweets

Han-Kwang Nienhuys

@hk_nien

1 Jul

https://twitter.com/hk_nien/status/1364582102902145029

1/ Draadje reproductiegetal juli (dagelijkse updates).
Toelichting rekenmethode:

https://twitter.com/hk_nien/status/1364582102902145029

Draadje juni:

https://twitter.com/hk_nien/status/1399719106065096714

Rapportagevertraging:

https://twitter.com/hk_nien/status/1391384017929478144

2/ Update reproductiegetal Nederland t/m 23 jun: R=1.04. Boven de één! De schaduwpunten in de grafiek voor 24-26 juni liggen ruim boven de 1. Die zijn (nog) minder nauwkeurig, maar doet vermoeden dat vandaag niet een uitschieter naar boven was.

3/ Update reproductiegetal Nederland t/m 24 jun: R=1.22 (datapunt), R=1.14 (voorlopige trendlijn).
Veranderingen in R zijn altijd uitgesmeerd over een week in de berekening, dus het effect van 26 juni uitgesmeerd over 23-29 juni.

Read 29 tweets

Han-Kwang Nienhuys

@hk_nien

31 Jan

1/ Wellicht gaan de basisscholen weer open op 8 februari. Tijd voor een nieuwe prognose voor wat dat zou kunnen betekenen. Dit zal het effect van de avondklok (-10% op R) ongeveer ongedaan maken.

2/ Volgens OMT was het effect van de avondklok 8-13% op R. Het OMT-advies over dde basisscholen is nog niet openbaar. Volgens RIVM is het effect van scholen en hoger onderwijs samen 40% [tweedekamer.nl/sites/default/…]. Hier staat het effect van de basisscholen optimistisch op +11%.

3/ Het voorspellen van exponentiële groeiprocessen is gevoelig voor de begincondities. Hier zie je groeivoorspellingen eruit zagen o.b.v. data tot 15 en 21 jan. Ook: minder testbereidheid door het GGD-datalek; recente R is te optimistsch.

Read 6 tweets

Han-Kwang Nienhuys

@hk_nien

31 Jan

https://twitter.com/hk_nien/status/1355634266399453194

1/ Hier is een update van de #UKvariant #B117 groeicurves in verschillende landen en regio's. De verhouding B.1.1.7/overig (odds ratio OR) zou exponentieel groeien ongeacht gedrag van de burgers. (Dit draadje eerder in het Engels:

https://twitter.com/hk_nien/status/1355634266399453194

)

2/ Een 'log slope' 0,08 betekent dat de OR met 8 %/dag toeneemt. Bij elke dataset staat de publicatiedatum en of het is o.b.v. S-gene target failure (SGTF, d.w.z. PCR-tests) of genetische sequencing (seq).

3/ De 'log slope' kun je vertalen naar een reproductiegetalverhouding R_B117/R_overig = exp(log_slope*4) voor een generatie-interval van 4 dagen.

Read 8 tweets

Han-Kwang Nienhuys

@hk_nien

30 Jan

1/ Data on the #UKvariant #B117 in a number of countries and UK regions. The (odds) ratio of the B.1.1.7 variant versus other variants would be expected to grow exponentially (straight line on a logarithmic scale) independent of behavior (lockdowns etc.).

2/ A log slope 0.07 means that the odds ratio increases by 7% per day. The publication date for each dataset is indicated. The datasets are either based on S-gene target failure (SGTF; PCR tests with some selectivity for the B.1.1.7 mutation) or on full genomic sequencing.

3/ The slope can be converted to a ratio in reproduction numbers: R_B117/R_other = exp(slope*Tg) where Tg is the nominal generation interval (value generally assumed between 4 and 6 days).

Read 8 tweets

Support us! We are indie developers!

This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Share this page!

Han-Kwang Nienhuys

Try unrolling a thread yourself!

More from @hk_nien

Han-Kwang Nienhuys

Han-Kwang Nienhuys

Han-Kwang Nienhuys

Han-Kwang Nienhuys

Han-Kwang Nienhuys

Han-Kwang Nienhuys

Did Thread Reader help you today?

Like this author's thread?