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Les quiero contar algo sobre virus, arqueas, las archifamosas #CRISPR, Alicante y heces.
En 2015, investigadores estadounidenses analizaron las muestras de heces de personas americanas, francesas, gambianas y hasta de simios del zoo de San Francisco. Todas las muestras
En 2015, investigadores estadounidenses analizaron las muestras de heces de personas americanas, francesas, gambianas y hasta de simios del zoo de San Francisco. Todas las muestras
procedían de individuos y animales que sufrieron brotes de diarrea típicos de una gastroenteritis viral.
Al determinar el #virioma en la muestras de heces (todos los virus presentes), notaron que una alta incidencia de un virus desconocido para la ciencia.
Al determinar el #virioma en la muestras de heces (todos los virus presentes), notaron que una alta incidencia de un virus desconocido para la ciencia.
Lo llamaron smacovirus. Estos virus son realmente diminutos, su genoma es de apenas 2.5 Kb.
Para que tengan una idea, el genoma del VIH es de 9.2 Kb, el de zika de 11 Kb y el del ébola de 18 Kb, aproximadamente.
Sin embargo, no pudieron infectar ratones con #smacovirus.
Para que tengan una idea, el genoma del VIH es de 9.2 Kb, el de zika de 11 Kb y el del ébola de 18 Kb, aproximadamente.
Sin embargo, no pudieron infectar ratones con #smacovirus.
De esta forma, quedó sin responder qué células son las dianas de los smacovirus. Un completo misterio.
El paper es este: ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27774288
El paper es este: ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27774288
Hago un paréntesis para contarles que entre 2007 y 2013 viví en #Alicante. Hice el doctorado en el mismo departamento de Francisco Mojica, descubridor de las CRISPR, en la @UA_Universidad.
El profesor Mojica no lo hizo solo, como es habitual en la ciencia. Una persona clave fue
El profesor Mojica no lo hizo solo, como es habitual en la ciencia. Una persona clave fue
su estudiante César Díez-Villaseñor, a quien, desde luego, también conocí bastante bien.
Ayer, César compartió en su Facebook la publicación de su más reciente paper en Nature, y tiene que ver con los smacovirus y CRISPR. Así que volvemos a la ciencia.
Ayer, César compartió en su Facebook la publicación de su más reciente paper en Nature, y tiene que ver con los smacovirus y CRISPR. Así que volvemos a la ciencia.
En procariotas, un método para saber cuál es la diana de un virus es tomar ventaja de las CRISPR.
Un arreglo CRISPR está formado, grosso modo, por secuencias repetidas y espaciadores. Los espaciadores derivan de virus que infectan al microorganismo y la proveen inmunidad
Un arreglo CRISPR está formado, grosso modo, por secuencias repetidas y espaciadores. Los espaciadores derivan de virus que infectan al microorganismo y la proveen inmunidad
adaptativa contra esa infección.
Conocer la secuencia de los espaciadores de las CRISPR hace posible asignar el par virus-huésped en procariotas de una forma bastante certera.
Con esto en mente, César hizo una búsqueda exhaustiva de genomas virales en espaciadores de CRISPR.
Conocer la secuencia de los espaciadores de las CRISPR hace posible asignar el par virus-huésped en procariotas de una forma bastante certera.
Con esto en mente, César hizo una búsqueda exhaustiva de genomas virales en espaciadores de CRISPR.
Y sonó una alarma.
Encontró, casi por serendipia, una pareja perfecta entre los espaciadores de CRISPR de una arquea metanogénica y un smacovirus.
La arquea es Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis, un habitante de nuestros intestinos.
Encontró, casi por serendipia, una pareja perfecta entre los espaciadores de CRISPR de una arquea metanogénica y un smacovirus.
La arquea es Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis, un habitante de nuestros intestinos.
Ahora desde la @UniversidadMH, él provee evidencias sólidas de que los smacovirus no infectan a las células eucariotas, sino a esas arqueas.
Y sugiere que, de alguna forma aún desconocida, esta infección entre microorganismos en nuestros intestinos puede ocasionar diarrea.
Y sugiere que, de alguna forma aún desconocida, esta infección entre microorganismos en nuestros intestinos puede ocasionar diarrea.
¿Cuál es el papel de esta arquea en las gastroenteritis? Pues aún no se sabe.
Lo que hace maravilloso este paper, entre otras implicaciones, es que confirma nuestros puntos ciegos sobre la vida microbiana, su diversidad y su ecología.
Lo que hace maravilloso este paper, entre otras implicaciones, es que confirma nuestros puntos ciegos sobre la vida microbiana, su diversidad y su ecología.
También, que los smacovirus portan los genomas más pequeños que pueden infectar procariotas.
Yo alucino y felicito a César Díez-Villaseñor, codescubridor de las CRISPR, por este aporte.
El paper es este: nature.com/articles/s4146…
#ComunicaCiencia #Microbiología
Yo alucino y felicito a César Díez-Villaseñor, codescubridor de las CRISPR, por este aporte.
El paper es este: nature.com/articles/s4146…
#ComunicaCiencia #Microbiología
¡Casi lo olvido!
El propio César ha hecho una reseña en @NatureMicrobiol sobre su trabajo.
naturemicrobiologycommunity.nature.com/channels/346-b…
El propio César ha hecho una reseña en @NatureMicrobiol sobre su trabajo.
naturemicrobiologycommunity.nature.com/channels/346-b…
Su usuario es @CsarDiezV, para que pasen y lo llenen de vítores
