Descrição de um cluster de 19 casos COVID19 no Brasil

Muita gente já escutou famílias inteiras que se infectaram, às vezes internados, ou de uma festa de onde surgiram muitos casos. Já descrito em outros países e o fenômeno de super-propagadores👇

19 confirmados e 21 prováveis
Esse artigo relata 5 famílias que fizeram o isolamento na região costeira do Brasil e se dividiam em 2 casas.
O caso índice provável foi a/o babysitter, numa exposição de 2 horas na fila do banco. Os 5 funcionários dividiam o mesmo quarto, assim q do caso índice, correlacionando
os tempos da doença (intervalo serial, tempo de incubação... falo mais no fio abaixo), foi por onde provavelmente a transmissão se dissipou, embora certamente outros membros tinham contato entre si e entre as casas. 17 dias desde o primeiro ao último caso.
Neste cluster ninguém foi hospitalizado e tinham predomínio de pessoas jovens (só 1 de 56 e outro de 83 anos). Dos 6 sintomáticos com dispnéia ("falta de ar"), 5 fizeram tomografia e todos tinham alterações em "vidro-fosco" na tomografias e áreas de consolidação.
Das 24 pessoas que estavam neste condomínio, 19 foram casos confirmados (19/24, 75%) e 21 prováveis (21/24, 88%). Isso seriam taxas de ataque do vírus. Também podemos dividir em taxa de ataque secundária e também taxas de ataque no domicílio ou ainda por idade (em adultos 96%).
A taxa de ataque secundária seriam novos casos a partir de casos índices conhecidos, e o denominador sempre os susceptíveis/contatos (e sem os casos índices).

Abaixo da cartilha de Vigilância em Saúde Pública do grande professor e amigo Eliseu @eawaldma

ead.saude.riopreto.sp.gov.br/pluginfile.php…
Investigar surtos, em domicílios e fora dele, é parte de epidemiologia de campo e vigilância. Temos que levar em conta toda a dinâmica da doença. Conto algo aqui nesta aula cruzando tipo de curvas e tempos.

Aqui um caso para Sarampo em SP. Sarampo tem mais de um tempo, se vc considerar febre ou exantema, por exemplo.

scielo.br/scielo.php?scr…
link para o artigo acima de cluster

jidc.org/index.php/jour…
Meu texto não ficou claro. Melhorando:

São 19 se considerarmos somente os confirmados e 21 (19 confirmados + 2 prováveis) se considerarmos também 2 prováveis.

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More from @otavio_ranzani

9 Oct
Quais os fatores de risco para morrer na Suécia do começo da pandemia por lá até Maio?

-Estudo populacional (7.9 milhões de pessoas) na @NatureComms
-Óbitos COVID19 e outras causas

Maior risco em:
⬆️ Imigrantes, baixa renda e menos educação
⬆️ Não estar casado

Conclusão 👇 Image
O estudo usa as bases populacionais da Suécia que são incríveis de uma longa data. Toda integrada, com identificador único, onde se pode saber toda trajetória, renda individual, educação, etc. Image
Todos os modelos estão ajustados por idade e completos no suplemento. O tempo de seguimento ainda é curto mas reflete o primeiro momento da pandemia. Image
Read 5 tweets
8 Oct
Saiu no @NEJM o trial de tratamento com HCQ para COVID19. Como já sabíamos do pre-print:

- Nenhuma evidencia de benefício em mortalidade
- Evidencia de maior risco para os pacientes.
Mais de 90% dos pacientes com COVID confirmados, tamanho de amostra grande com poder, maior excesso de óbitos por causa cardíaca.
Sem evidencia de beneficio em subgrupos, aliás, quase todos apontando para risco.
Desfechos secundários: menor chance de sair de alta do hospital em 28 dias e maior chance de necessitar de ventilação mecânica ou morrer.
Read 6 tweets
6 Oct
E o Sars-CoV-2 pode afetar os olhos 👀?

Já estamos tendo algumas evidências sobre sintomas oculares, alterações na retina e agora algumas imagens de evidência do vírus. É esperado pela endotelite (inflamação do endotélio, célula que recobre casos) causada e pelos receptores ACE2
Primeiro uma revisão (simplificada) da anatomia dos olhos: Íris é a parte colorida, a pupila que abre e fecha, a córnea, que é a lente, a parte branca que é a conjuntiva. Para dentro, temos a retina lá no fundo (tipo um tapete), embaixo dela tem monte de vasinhos (coróide), etc.
Uma parte da retina, chama mácula, é onde estão os fotoreceptores (receptores que se estimulam com luz). É onde podemos observar algumas agudas e crônicas em alguns exames (eg, fundo de olho). Aqui para ilustrar a mácula e também os vasinhos fininhos embaixo (vermelho)
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27 Sep
Sugiro a leitura deste relatório da missão da OMS na China no começo da pandemia. Explica tanta coisa e parece que quase tudo que se foi descobrindo já estava lá...

Visita: 16 a 24 de Fevereiro

Quem: 25 pessoas (China, US, Korea, Japão, Nigéria, Rússia, Singapura, Alemanha)
São 40 páginas, realçarei alguns pontos numa tradução livre

O vírus: betacoronavírus, efeito citopático em 96h em cultura de células, bloqueio com soro de convalescentes, em animais causando pneumonia multifocal/hiperplasia intersticial; vírus no pulmão e intestino.
Já sequenciaram naquele momento 104 strains, e sem verificar grande evidencia de mutações.
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21 Sep
O que pode ter acontecido em Manaus?

Um preprint do grupo que tem produzido muita ciência traz dados para o entendimento:

Usando sorologia em doadores de sangue e um modelo ajustando para sensibilidade/especificidade do teste, idade/sexo, decaimento

Prevalência acumulada: 66%
Os autores construíram o histórico de prevalências na cidade de Manaus e São Paulo de Fevereiro até Agosto de 2020.

Estudos com doadores de sangue são uma boa fonte, pois o sangue é coletado, armazenado uma parte para exames/sorologia, então temos toda a logística mais fácil.
No casos dos dois bancos de sangue, o material fica estocado por 6 meses após doação (mais sobre isso abaixo).

O teste foi feito o Abbott SARS-CoV-2 chemiluminescence microparticle assay (CMIA), para IgG contra a proteína do nucleopsídio (N). Assim, melhor que os testes rápidos.
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19 Sep
E a tal taxa de positividade dos testes de PCR?

Essa é a nova moda de mistificar a pandemia na Europa (junto com "o que seria uma segunda onda"). E muitos não entenderam um ponto crucial sobre epidemias:

Atenção: nenhum indicador é capaz de explicar ou diagnosticar a pandemia.
Falamos e pedimos muito que reportassem e melhorassem a taxa de positividade. E eu tenho certeza que seguiremos pedindo. Ela mostra um aspecto importantíssimo: se está alta (quase todo RT-qPCR é positivo), significa sem dúvida que estamos testando pouco. Ou seja, estamos testando
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