1/n Un peu de recul et de prospective avec la revue et méta-analyse de John Ioannidis précédemment annoncée. Quel IFR? Combien de morts à prévoir et qu'est-ce qui sera déterminant? Des projections toujours discutables mais éclairées. onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.11…
2/n Voici déjà le résumé, qui synthétise beaucoup d'éléments. Je retiens que l'alpha et l'oméga des conséquences finales de cette crise est la capacité à protéger sélectivement les personnes les plus à risque.
Mais, au delà de cette évidence, que nous dit Ioannidis?
3/n Le nombre de décès qui s'établit à moins de 1 pour 100 000 à l'échelle planétaire est probablt à la fois sous estimé (défaut de tests dans les pays à revenu fbl et intermedr) et surestimé (décès avec multiples comorbidités soulevt la q de la cause du décès).
4/n Dans l'analyse de la surmortalité il est difficile de distinguer la mortalité causée par le Covid19 et celle due au défaut de prise en charge d'autres pathologies et aux effets de la crise (niveau de preuve élevé) qui aura un effet sur la mortalité à long terme.
5/n Stratification par âge et par niveau de risque. Dans 5 pays développés l'âge médian des décès attribués au Covid19 est proche de l'espérance de vie à la naissance. Il va de 77 ans (USA) à 85 ans (UK).
6/n Toutefois l'impact du Covid en termes de mortalité est beaucoup plus fort dans les ethnies qui représentent les catégories sociales défavorisées. P exp l'âge médian du décès dû au Covid était de 11 ans inférieur chez les hispanqs (71) aux USA/ blancs (81).
7/n Certaines pathologies, surtout dans leur forme sévère, comme le diabète déséquilibré, l'insuffisance rénale ou un cancer récent, BPCO.. peuvent accroître le risque de décès d'un facteur 1,5 à 5.
8/n Années de vie perdue. Les estimations du nombre moyen d'années de vie perdues , 11,7 ans, sont fortement surestimées car elles se basent sur l'espérance de vie moyenne (rappelons que 40 à 50% des décès ont eu lieu chez ls résidts en EHPAD dns les pays développés).
9/n Pour être plus claire les personnes décédées avec ou à cause du covid19 ont, en moyenne, une espérance de vie très inférieure à l'espérance de vie moyenne des personnes de leur âge.
10/n Mortalité évitable en début d'épidémie. Elle est due principalement à un surtraitement (ventilation inutile, traitements inutiles..), renvoie inopportun de personnes infectées dans les EHPAD, infections nosocomiales.
11/n A cet égard je laisse les médecins méditer sur ce très bon article de la revue médicale suisse qui montre que, comme souvent en médecine, bien que peu de médecins le croient, le mieux est l'ennemi du bien et q les traitm superflus snt aussi délétères. revmed.ch/covid-19/COVID…
12/n Pour Ioannidis, le nombre d'infections réels pourrait excéder d'un facteur 20 le nombre observé, ce qui nous amènerait à une proportion des la pop mondiale déjà infectée de 10%.
13/n Ioannidis se risque à une estimation de l'IFR en fonction des études de séroprévalence. L'IFR serait de 1,5 à 2 pour 1000 en moyenne mais de 3 à 4 pour 10 000 chez les personnes âgées de moins de 70 ans. Cela signifie 300 à 400 décès par million d'infectés chez les <70 ans.
14/n La propagation future de l'infection dépend du seuil d'immunité de groupe qui permettrait de clore un cycle de diffusion virale dans la pop. Ce seuil varie de 10 à 60% selon les hypothèses et les modélisations.
15/n Pendant un cycle pandémique complet sur 5 ans le nombre de décès dus au Covid19 pourrait varier de 1,76 à 8,76 millions (si immunité de groupe à 60%) soit, au maximum, 2,9% de la mortalité sur cette période de 5 ans.
16/n L'hypothèse basse ne pourrait se réaliser que si on limitait les infections chez les personnes de plus de 65 ans qui représentent 9% de la population mondiale. Les mesures globales com le confinmt ont pour effet d'exposer relativement davantage les population plus à risque.

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More from @MartinFierro769

12 Oct
1/n Faut-il s'inquiéter de l'augmentation du nombre de cas et édicter des mesures impactant l'ensemble de la population, voire envisager un reconfirment?
2/n La grippe présente une létalité par cas (case fatality rate) comprise entre 1% et 1 pour 1000 environ. 5000 à 20000 décès estimés pour 2 à 6 millions de cas en France.
Devra-t-on se confiner à chaque épidémie de grippe?
3/n Ah! On me dit dans l'oreillette que ce sont des estimations, et que malgré un testing intense en hôpital il n'y a, chaque année, que quelques centaines de cas en réa.
Read 13 tweets
11 Oct
1/n La question est importante: doit-on régler nos vies sur le taux de remplissage des lits de réa par des patients Covid+?
2/n Je pense, d'une part, qu'en tant que scientifique, on ne doit pas se laisser sidérer par des chiffres bruts et toujours se demander ce qu'il y a derrière ces chiffres.
3/n Depuis quelques mois, l'on teste frénétiquement pour le Covid19, d'abord à l'hôpital et ensuite de plus en plus hors de l'hôpital. Tous les malades hospitalisés AVEC un test + au Covid19 sont représentés comme étant hospitalisés A CAUSE du Covid.
Read 19 tweets
10 Oct
1/n Je vois que beaucoup de médecins continuent à penser que le nbr de cas est l'indicateur le plus abouti de la gravité de l'épidémie de Covid19 et celui q doit déterminer les choix sanitaires avc leur cortège d conséquences économiques et sociales. Or, non, ce n'est pas le cas.
2/n Les Japonais ont fait le choix de ne pas tester largement pour ne pas submerger leur système de santé de demandes inadéquates et ne pas avoir à hospitaliser des cas peu sévères.
3/n Pour notre part, notre gouvt a fait le choix de tester de plus en plus largement, mais sans priorisation, c'est à dire le choix inverse.
Entre la semaine 33 et la semaine 40 le nombre de tests a pratiquement doublé, passant de 547 000 à 1 028 000.
Read 17 tweets
9 Oct
1/n A propos de la séroprévalence, une étude qui était prospective, à la différence de la plupart des autres études q snt rétrospectives, faite à Tokyo montre que pendant l'été le taux de positivité ( IgM et IgG) était passé de 5,8% à 46,8% dns différts sites d'une société.
2/n 1877 volontaires travaillant sur 11 différents sites d'une société à Tokyo ont été recrutés et les tests ont été répétés à intervalles réguliers entre le 26 mai et le 25 août. Ls auteurs constatent que parmi les sujets testés la séropositivité globale est passée de5,8% à 46,8
3/n Parmi les 1877, 615 ont eu au moins un test. Et parmi ceux qui avaient été testés plusieurs fois 21% de ceux qui avaient été testés négatifs sont devenus positifs et 12% de cx qui avt été testés + sont dévenus négatifs medrxiv.org/content/10.110…
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9 Oct
1/n Deux articles intéressants sur les particularités de l'approche suédoise. L'un dans le @FinancialTimes où Tegnell explique, encore une fois, que son approche n'avait pas pour objectif l'immunité collective, mais une politique durable, qui permette de tenir la distance.
2/n Cette approche était fondée sur l'idée qu'il n'y aurait pas de solution miracle.
Pour être francs, si la clé de la propagation du virus se trouve dans l'aérosolisation et le port de masques, Tegnell et l'agence publique suédoise ne l'ont pas compris.
3/n A la différence d'autres pays, les décisions de la Suède ont été portées uniquement par l'agence de santé publique, sans intervention des politiques. Ils ont fondé leur politique préventive sur certaines mesures barrière, surtt la distanciation physique et le lavage des mains
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6 Oct
1/n Trois épidémiologistes de renom se réunissent clandestinement dans le Massachusetts pour appeler à un changement radical de stratégie face à la crise du Covid19. Je résume les idées principales présentées dans l'interview pour les non anglophones unherd.com/2020/10/covid-…
2/n Comment est-on arrivé à une situation où des scientifiques renommés doivent se réunir clandestinement pour exprimer leur désaccord avec les politiques menées, demande le journaliste F Sayers?
3/n Cette crise a été marquée par la censure du débat scientifique au nom de l'urgence. S Gupta, M Killkroff et J Bhattacharya ne savent pas comment on en est arrivés là.
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