Essa é a série de hospitalizações por COVID-19 para cada 100 mil habitantes nos 26 estados + DF. Excluí as últimas 4 semanas pois o nowcasting para casos de Covid ainda não está bom. No entanto, dado as noticías recentes, a expectativa para as última quatro semanas não é boa.
Todo mundo falou da situação do Amazonas que, de fato, foi muito ruim e foi o primeiro estado a chegar (próximo?) ao colapso do sistema de saúde. Mas percebam q outros estados como PA, CE, PE, SE, RJ e IMHO o pior deles DF também passaram por momentos muito difíceis.
Os estados da região Sul, e alguns outros estados, a mais de um mês atrás já estavam apontando uma retomada das hospitalizações. Percebam que os estados da região Sul, diferente dos outros estados, enfrentam hoje seu pior momento em termos de hospitalizações por Covid.
Infelizmente não sei estimar a situação de hoje para as hospitalizações por Covid-19, creio que alguns estados já estejam acima dos 20 casos hospitalizados por 100 mil habitantes. Qual o valor para entrar em colapso? Depende de cada estado, alguns mais outros menos.
Por isso, para evitar o colapso do sistema de saúde, é fundamental que nesse final de ano (e nos próximos 6 meses pelo menos) as pessoas sigam as regras usuais, uso de máscara, evitar atividades em ambiente fechados e mal ventilados, fazer o distanciamento físico, etc.
Sei que isso é repetitivo, mas não queremos ver uma nova onda de hospitalizações e muito menos que essas ondas estaduais se transformem em um grande tsunami nacional.
A figura acima foi feita usando ggplot + geofacet e dados aberto do infogripe ( bit.ly/mave-infogripe… )

Mais especificamente o seguinte csv:

Dados_InfoGripe_serie_temporal_com_estimativas_recentes_sem_filtro_sintomas.csv

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More from @leosbastos

16 Dec
Por que vacinar muitos é importante? Quantos sao muitos? Protecao individual versus coletiva? Papel dos antivaxxers?

Segue um fio.
Nenhuma vacina garante proteção a todos q a tomam. Existe uma chance de uma pessoa tomar uma vacina e nao gerar nenhuma resposta. Nesse caso, se a pessoa vacina eventualmente entra em contato com o virus ela vai se infectar.
Geralmente estamos falando de proporções baixas, mas por estarmos falando de populações temos grandes numeros. Lembrem se 1% de 200 milhões são 2 milhões!
Read 20 tweets
13 Dec
Eu entrei hj pra resmungar que nao consegui (pela n-esima vez) bolsa de produtividade do cnpq. Mas ai descrubo por aqui que meu nome (e de todo meu grupo) saiu no plano nacional de vacinacao da covid...
Calcular os grupos de risco pars hospitalização e obito por covid para ajudar na definicao da fila dos grupos prioritarios (independente de qual vacina e de quando ela chegar) foi das analises mais importantes que fiz na vida. Se nao fosse essa zona toda eu estaria orgulhoso...
Read 4 tweets
2 Dec
95% que bruxaria é essa? Quem trabalha com estatistica está acostuma com esse número. Ele usualmente é usado na construção de intervalos como uma forma de representar a incerteza de uma estimativa.

Segue um fio sobre intervalos de confiança e credibilidade.
Quando se estima algo, é importante reportar a incerteza dessa estimativa. O método usado para estimar, q chamamos o método de inferência, vai dizer como a incerteza deve der representada e como chama la.
Sob a ótica frequentista, os parâmetros são estimados como funcao dos dados. E os dados são representados por um modelo estatístico chamado de verosimilhança. Alguns estimadores tem propriedades muito importantes que facilitam o calculo de intervalos e valores p.
Read 21 tweets
1 Dec
Pessoal, não existe isso de 95% de exatidão. Não inventem conceitos estatísticos. Image
A estimativa do grupo do Imperial é basesda em um modelo bayesiano, e portanto eles tem a distribuição de probabilidade a posteriori do Rt. E com ela eles podem fazer o que quiserem como calcular a P(Rt > ) ou o intervalo de credibilidade (a, b) tal que P(a < Rt < b) = 0.95.
Essa merda de exatidão de 95% não existe, s nao ser que esse conceito foi inventado nesse periodo q estou em licença paternidade e de repente a estatística resolveu sofrer uma revolução com a chegada de novos conceitos...
Read 4 tweets
17 Nov
Em 2020, casos e óbitos por SRAG são devidos a COVID-19?

A grande maioria dos óbitos e hospitalizacoes são sim!

Mas um caso de SRAG por ser outra coisa né? Sim pode, existem vários outras doenças que podem causar os sintomas que definem a SRAG, a influenza é a principal delas.
Segue a série da incidência de hospitalizados de SRAG do país todo nesse ano, 2020 (é um print do infogripe). O país todo está com classificado como período de atividade muita alta qdo comparado com o histórico. A série de baixo tem níveis de cores e nota se apenas o vermelho.
Agora segue a série (e mapa) da incidência de hospitalizacoes por SRAG por COVID em 2020 (ignorem o final da série pois o modelo de nowcasting não funciona bem nesse caso, ainda não resolvi isso). Percebam como a série de SRAG-COVID é similar a de SRAG
Read 12 tweets
25 Oct
Apesar de trabalharmos com esse dado há muito tempo, há um bom tempo eu não coloco as hospitalizações e óbitos por SRAG-COVID juntos. Aqui eu excluí as ultimas 5 semanas, pois além do atraso de digitação usual, têm os atrasos de laboratorio e de atualização do registro no SIVEP.
Percebam que as epidemias são bem distintas no espaço, e no tempo. Sul e Centro Oeste estão bem mais a direita, enquanto Norte e Nordeste tudo aconteceu nas primeiras semanas de epidemia no Brasil. O Sudeste teve um aumento rápido, e uma queda bem lenta.
Esse dado não é de SRAG, e sim SRAG-COVID, i.e. casos de SRAG com resultado positivo para SARS-CoV-2. As hopitalizações e óbitos estão definidos por data de primeiros sintomas, o que nos permite fazer a razão de óbitos por hospitalizados.
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