Novo estudo de modelagem (pre-print) confirma que, independentemente do confinamento imposto, a variante #B117 será a dominante em Portugal já em Fevereiro.

Previsões para o desconfinamento também não são nada animadoras. 1/n
A variante #B117 deverá ser dominante (representativa de +50% dos novos casos) já na semana de 15 a 21 de Fevereiro, mantendo ou não o confinamento. 2/n
No final de Março, perto de 100% dos novos casos em Portugal serão atribuíveis à variante #B117. 3/n
Dados do @irj_pt () corroboram este modelo.

A concordância entre dados estimados e os observados no país foi também confirmada pelos autores do modelo. 4/n
Outros dados do mesmo estudo do @irj_pt (virological.org/t/tracking-sar…) confirmam também que o confinamento - e mais tarde o fecho das escolas - teve lugar já durante o período exponencial de crescimento da variante #B117 em Portugal. 5/n
Nada disto é surpreendente.

Já antes de 6 Jan, o comportamento errático da variante tinha sido bem descrito pelo UK e Dinamarca (que conheciam as suas situações com mais detalhe pois sequenciam amostras em larga escala - ao contrário de Portugal): 6/n
Como apontado aqui pelo @kakape (), é como se estivéssemos a viver duas epidemias em simultâneo:

• Uma em que os casos baixam drasticamente com o confinamento.

• E outra (#B117) em que os casos continuam a aumentar lentamente mesmo em confinamento. 7/n
Dados dinamarqueses (que mantém o confinamento rigoroso) indicam que, embora o valor de R(t) geral esteja agora em 0.78, o R(t) relativo à #B117 continua acima de 1 (1.07):

A realidade portuguesa não deverá ser muito diferente. 8/n
De novo, isto não é novidade. Esse crescimento de novos casos 𝐦𝐞𝐬𝐦𝐨 durante confinamento foi na verdade a razão que levou o UK a identificar a nova variante em Dezembro de 2020. 9/n
Olhando para o futuro em Portugal, a situação não é animadora.

De acordo com o modelo, qualquer relaxamento das medidas levará o R(t) geral rapidamente de volta para cima de 1.

Igualmente preocupante: mesmo mantendo o confinamento atual, o R(t)~=1 em Abril. 10/n
Estes dados põem o desconfinamento em perspetiva.

O relaxamento de medidas - virtualmente durante todo 2021 - está dependente de um plano muito bem detalhado de desconfinamento localizado e contact tracing (algo que parece muito complicado no país) ou do rollout da vacina. 11/n
Em Israel os efeitos da vacinação já se fazem sentir:

No entanto, 38% da população israelita já recebeu pelo menos uma dose da vacina. Em Portugal, ainda estamos muito longe dessa realidade. 12/n
Nota 1: Isto não considera resistência às vacinas atuais, mas:

- A variante 🇿🇦 (parcial/ resistente) já foi identificada em PT e transmissão comunitária no UK:

- Mutações relevantes da #B117 já foram identificadas tb no UK: 13/n
Nota 2: Ainda não vale a pena falar de imunidade de grupo pois todos os dados indicam que estamos francamente longe: 14/n
É importante um planeamento adequado, com os pés assentes na terra, da situação delicada que vivemos, em conjunto com uma boa comunicação e gestão de expectativas (@govpt @saude_pt @DGSaude).

Aumentar os testes, aumentar o sequenciamento, melhorar os meios da saúde pública. 15/n
É crucial melhorar a monitorização da situação atual, mas não esperar que as más indicações se confirmem para agir. Não andar atrás da curva. Numa pandemia, precaução é a palavra de ordem:

A informação existe, é preciso é saber o que fazer com ela. 16/n

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More from @diogosimaolemos

3 Feb
Portugal caiu no Ranking Democrático do @TheEconomist, de "Democracia Plena" para "Democracia Imperfeita", colocando-se agora no 26º lugar no mundo.

Fora comentários incendiários sobre uma headline certamente tentadora e esmiuçando um pouco: economist.com/graphic-detail… Image
França e EUA caíram com Portugal, estando abaixo de países como Uruguai, Chile ou Costa Rica. O ranking é liderado pela Noruega e países escandinavos. ImageImage
A explicação dada pelo @TheEconomist para a queda deste ano: "In Portugal, the frequency of parliamentary debates (through which the prime minister is held accountable) was reduced during the pandemic. This, coupled with the lack of transparency around the appointment...
Read 7 tweets
30 Jan
Projeções do @IHME_UW estimam que estejamos já a iniciar o período descendente na curva de novas infeções.

Segundo o modelo, o pico foi atingido nas ~45 mil infeções diárias (inclui os casos não testados). 1/n covid19.healthdata.org/portugal
A incerteza do modelo considera possível um pico com 70 mil infeções diárias, mas nunca inferior a 30 mil. 2/n
Estes dados são uma indicação sóbria de que o nº de novos casos divulgado diariamente representa apenas uma pequena proporção da realidade.

Continuamos a fazer muito poucos testes. A média móvel do rácio de testes/casos positivos é agora de 19,2% (@WHO recomenda <5%). 3/n
Read 12 tweets
30 Jan
O crescimento exponencial da #B117 em Portugal pelo @irj_pt:

• "No início de dezembro não passaria de um percentual mínimo de 1%"

• "À data de hoje, entre 35% e 40% dos casos totais"

• "Dentro de 3 semanas serão cerca de 65% de todos os casos" 1/5 visao.sapo.pt/visaosaude/202…
"Terão ocorrido 'imensas introduções' durante o mês de dezembro. Esses casos terão sido associados naturalmente com o massivo regresso dos nossos emigrantes a trabalhar no Reino Unido e também muitos turistas britânicos que vieram passar férias a Portugal." 2/5
Não é nada de novo, esses dados eram já conhecidos no início de janeiro: 3/5
Read 5 tweets
18 Jan
Se nos mostrassem estes gráficos em Março, alguém acreditaria?

Infelizmente parece que a vida humana perdeu valor com o tempo.

#FicaemCasa, por favor. ImageImage
O pequeno epidemiologista que cresceu em todos nós em 2020 deve conseguir olhar para estes gráficos e entender que isto não vai ficar por aqui.

É triste chegar aqui. Muito triste saber que podia ter sido evitado. E ainda mais triste saber que vai piorar.
Um ano depois do início da pandemia ainda persistem comportamentos inconscientes, medidas desajustadas e má comunicação.

É também por isto que é certo que esta não será a última pandemia.

Mas pelo menos que se acabe com esta de uma vez por todas.
Read 5 tweets
10 Jan
De forma similar a Março, entramos agora numa nova fase crítica da pandemia #COVID19. Não só pelo confinamento que estamos prestes a iniciar mas pela dimensão da incerteza associada. 1/n
Como se tem falado extensivamente em Portugal, começamos a pagar a fatura dos relaxamentos de Natal e Ano Novo, no entanto algo mais preocupante pode estar subjacente ao que está a acontecer. 2/n
Há fortes indícios de que a nova variante #B117 seja um dos principais responsáveis pela situação, e isso deve fazer soar os sinais de alarme. Esta variante, embora não seja mais severa do ponto de vista clínico, causa um aumento da transmissibilidade em cerca de 1,5x. 3/n
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19 Mar 20
At the attention of all healthcare workers (@DGSaude, @saude_pt, @BastonarioOM in 🇵🇹):

Very relevant #COVID19 insights from the University Hospital San Paolo, in Milan, collected today at a @WHO webinar with Dr. Claudio Colosio.

1/11
Early front-line experience (~2000 cases in Milan) can inform adequate procedures for other hospitals.

A LOT of attention must be given to the healthcare workers potential infection, not only as an individual measure, but as a way of interrupting further transmission.

2/11
In Portugal, 20% of the identified cases in the country are medical doctors, and the real amount of cases should be much higher. Every infected health worker is a potential super transmitter since an index case could lead to a hidden network of asymptomatic transmission.

3/11
Read 11 tweets

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