Share this page!

Cornelius Roemer Profile picture
Twitter logo
8 Feb, 7 tweets, 3 min read
.@RegierungBW veröffentlicht detaillierte Pressemeldung zum BaWü-Mutanten-Sequenzierungsprogramm.
Erste Einordnung und noch offene Fragen folgen im Thread hier 🧵⬇️1/
baden-wuerttemberg.de/de/service/pre… Image
Es ist toll, dass BaWü daran arbeitet, alle positiven Proben zu sequenzieren. Ebenfalls ausgezeichnet, dass vor der Vollgenomsequenzierung, welche immer ein paar Tage dauert, mithilfe PCR-Tests bereits auf Mutationen geprüft wird. 2/ Image
Ein kleiner Fehler ist hier in der Meldung: Die Brasilien-Variante heißt P.1 - Konvention für B.1.1.28.1
B.1.1.28 wie in der Meldung ist auf jeden Fall falsch, das ist der Vorfahre der Brasilien-Variante. 3/
Sehr kritisch bin ich, was folgenden Absatz angeht.
Wissenschaftsministerin @TheresiaBauer wirbt mit dem Aufbau einer landeseigenen Sequenzdatenbank. Deren Zweck bleibt völlig unklar. Warum werden die Sequenzen nicht sofort auf @GISAID geteilt, der weltweiten Datenbank? 4/ Image
Deutschland ist extrem schlecht im Teilen seiner Daten. Eine eigene Datenbank in Baden-Württemberg setzt falsche Prioritäten. Die Daten sollten als erstes direkt mit der internationalen Community geteilt werden. Bisher schmarotzt Deutschland da. Bitte anpassen! 5/
Anscheinend wurden bereits mehr als 1000 Vollgenomsequenzen erstellt. Solange diese auf irgendeiner Festplatte rumliegen sind sie leider nicht wertvoll. Erst durch Teilen und die Verknüpfung mit anderen Sequenzen entsteht der Wert. 6/
Zuletzt wäre es super, wenn das Ladesgesundheitsamt @MSI_BW eine Tabelle teilen könnte, in der die Zahl der Mutationsfälle pro Landkreis aufgeschlüsselt ist. Diese Daten existieren garantiert, Transparenz wäre toll.
Also: gute Idee mit Verbesserungspotenzial im Detail. 7/

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
　

Keep Current with Cornelius Roemer

Cornelius Roemer Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @CorneliusRoemer

Cornelius Roemer Profile picture
10 Feb
Das @rki_de hat den Bericht über die Virusvarianten heute upgedatet. Neu ist eine Tabelle, die den Anstieg des Anteils der Varianten pro Kalenderwoche aufzeigt, mit Daten bis zum 7.2. (vermutlich) 1/
KW2: 2%
KW3: 4%
KW4: 5%
KW5: 12%
Bericht als PDF: rki.de/DE/Content/Inf… Image
Unverändert ist die (Falsch-)Aussage, dass laut IfSG-Übermittlung #B117 in nur 13 von 16 Bundesländern nachgewiesen wurde. Stand der Daten des RKIs weiterhin 31.1.
In Wirklichkeit war bereits am 30.1. bekannt, dass B.1.1.7 in allen BL detektiert wurde. 2/ Image
Erstmals gibt es bundesweit repräsentative Daten über die Verbreitung der südafrikanischen Variante #B1351. Diese ist momentan etwa 1/15 mal so häufig wie #B117, sie macht etwa 6-7% der gesamten Varianten-Fälle aus. 3/ Image
Read 6 tweets
Cornelius Roemer Profile picture
7 Feb
Hervorragend systematischen Daten aus BaWü zeigen: Mutanten-Anteil bereits bei 12% - und das im Schnitt über die letzten 7 Meldetage.
Die 6% aus dem @rki_de-Bericht sollte man schnell als veraltet abheften, lieber hierauf schauen.
Transparente Berechnung: docs.google.com/spreadsheets/d… Image
Auch die Entwicklung der Zahl der Mutantenfälle wächst exponentiell (also nicht nur der Anteil).
Trotz Rückgang der Fallzahlen steigen die Zahlen der Mutanten - wie man das bei einem R von ca. 0,9 des Wildtyps auch erwarten würde. R der Mutanten dann bei ca. 1,3. 2/ Image
Warum sind die BaWü-Zahlen so wertvoll? Weil dort alle Fälle auf Mutationen untersucht werden. Sehr weise von @RegierungBW um einen besseren Überblick über die Lage zu bekommen - und nicht von veralteten, punktuellen @rki_de-Zahlen abhängig zu sein.
swr.de/swraktuell/bad…
Read 6 tweets
Cornelius Roemer Profile picture
5 Feb
Zwei grobe Fehler in 17 Sekunden @rki_de Pressekonferenz:
1. Am 31.1. war #B117 bereits in allen Bundesländern nachgewiesen (MV zuletzt am 30.1.)
2. Verbreitung von #B117 bei 6% vom 22.1.-29.1., momentan (+7T) sind es +50% mehr, also 9% 1/
In der Tabelle sind die Erstnachweise von #B117 pro Bundesland aufgeführt. Alle Nachweise wurden im Trackingsheet täglich gesammelt.
Warum um alles in der Welt gibt das RKI einen Stand von vor 6T an, und das dann auch noch falsch?
Quelle: docs.google.com/spreadsheets/d… 2/
Wieler sagt: "Momentan ist die Verbreitung von #B117 bei 6%".
Das ist falsch, weil veraltet. Daten stammen aus der Periode 22.1.-29.1., diese Periode endete vor 7 Tagen.
Pro Woche erhöht sich der Anteil von #B117 um 50-70% gegenüber Wildtyp - liegt mittlerweile also bei 9-10%. 3/
Read 4 tweets
Cornelius Roemer Profile picture
5 Feb
Warum spricht @rki_de Chef Wieler von Variante B.1.1.28.1 (und stockt dabei)? Die Nomenklatur ist international standardisiert. Um ewig lange Reihen zu vermeiden heißt diese Variante P.1, so wird sie in Medien und Literatur genannt. Nur im RKI nicht? Vertrauenserweckend. 1/
Hier kann man das genau nachlesen. Steht im Original-Paper, welches die Variante definiert hat:
Diese Mutation kann NICHT B.1.1.28.1 genannt werden, weil das momentane Klassifikationssystem dies verbietet.
Stattdessen wird sie P.1. genannt (B.1.1.28 = P)
virological.org/t/genomic-char…
Es geht hier um einen Stammbaum.
Jeder Punkt, bedeutet, dass es sich um Nachfahren handelt.
B.1.1.28 ist also das "Kind" von B.1.1.
Damit B.1.1.28.1 keinen langen Namen hat, definiert man B.1.1.28 gleich P und nennt B.1.1.28.1 dann P.1 (Kind von P, welches Urenkel von B ist).
Read 4 tweets
Cornelius Roemer Profile picture
5 Feb
Das @rki_de hat endlich offizielle Zahlen über den Anteil von #B117 in Deutschland veröffentlicht:
6% für Zeitraum 22.1.-29.1. (ca. vor 1 Woche)
In diesem Thread analysiere ich den Bericht und seine Schwachstellen. 🧵 ⬇️ 1/
rki.de/DE/Content/Inf…
In einem Teil der deutschen Labore (auf welche 57% aller positiven Proben entfiel) wurden 70% der positiven Proben mithilfe spezieller PCR-Tests auf die Variante B.1.1.7 untersucht. Insgesamt also 40% aller positiven Proben zwischen 22.1.-29.1. 2/
Ausschließlich der Anteil der Variante B.1.1.7 (England) wurde bestimmt. Über den Anteil der Variante B.1.351 (Südafrika) kann nur gemutmaßt werden. Diese könnte bis zu 1,1% sein, da 1,1% der Proben die Mutation N501Y aber nicht die Deletion delH69/V70 aufwiesen. 3/
Read 30 tweets
Cornelius Roemer Profile picture
4 Feb
Deutschland testet so wenig wie sonst nur (Süd-)Osteuropa.
Absolut peinlich. Dafür gibt es keine valide Ausrede.
Es ist die gemeinsame Schuld von @ALMevTeam @rki_de @BMG_Bund @RegSprecher.
Allein dafür gehört @jensspahn entlassen. 1/
ourworldindata.org/coronavirus-da…
Anfang August waren wir noch vorne dabei, aber statt Kapazitäten aggressiv auszubauen hat man sich auf falschen Lorbeeren ausgeruht. Fadenscheinige Argumente wie "Personal", "Reagenzien", "Budget" wurden aus der PR-Kiste geholt. Dabei zeigt Umland was für ein Quatsch das ist. 2/
Ich sollte als Metrik mal noch Tests/Bruttoinlandsprodukt ausrechnen. Da wäre Deutschland dann mit Niederlande und Schweiz ganz weit hinten.
Read 4 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!

This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!

Like this author's thread?

Get emails when @CorneliusRoemer has new unrolls!

Check out other threads from @CorneliusRoemer!

Read all threads by @CorneliusRoemer