🚹Thead important🚹
Etude locale des performances des tests antigéniques (TAG) vs. PCR
Quelles sont les performances des TAG ? Est-ce identique selon l’ñge, les symptĂŽmes et leurs dĂ©lais ? Existe-t-il des faux Pos ? Combien de faux nĂ©g ?
Vous saurez tout !!
PrĂ©cision sur le contexte : on s’est organisĂ© avec les 2 grandes pharmacies pendant 15 j :
- elles ont arrĂȘtĂ© de faire les TAG pour vacciner +++
- je me suis chargĂ© de leurs TAG (en + des PCR) ; j’en ai profitĂ©, avec l’accord des patients pour faire une PCR
(Pour jean-michel-polĂ©mique : j’ai fait « gratuitement » les PCR quand elles se sont avĂ©rĂ©es nĂ©gatives)
541 prĂ©lĂšvements ont Ă©tĂ© analysĂ©s en double (PCR et Ag), avec le mĂȘme prĂ©leveur Ă  chaque fois, dans des conditions « optimales » de tempĂ©rature.
Tous les ùges représentés, 50% de symptomatiques
Vous remarquerez d’ailleurs le dĂ©lai Ă©norme avant de venir faire un test (sans rdv chez moi) : presque 1/4 des symptomatiques viennent au delĂ  d’une semaine
 donc APRÈS leur pic potentiel de contagiosité 
RĂ©sultats !!
Sensibilité des TAG = 60%
 y compris sur les patients faisant le test rapidement
TAG = 4 personnes positives / 10 ne s’isoleront pas
Cette sensibilité de 60% est globalement retrouvée à tous les ùges.
Pas de lien à noter avec le statut vacciné ou non
Cette sensibilitĂ© autour de 60%, on la connait depuis des mois
 (👇)
mais on continue d’ĂȘtre fier en France de laisser dans la nature 4 positifs / 10 alors qu’on pourrait leur proposer une PCR ensuite (avec le Reff d’Omicron je vous laisse imaginer les trous dans la raquette
)
Grosse (mauvaise) surprise pour ceux qui ne le savaient pas encore : j’ai eu 5 faux Pos (2 PCR nĂ©g ensuite).

âžĄïž 1% de tous les TAG sont des faux Pos (ce qui est Ă©norme et gĂȘnant vu le nombre
 et le fait que 1/3 des TAG ne sont pas suivis par une PCR, pourtant obligatoire)
Ce problùme des faux positifs, on en parle depuis longtemps (👇)
Quand le virus circule « peu » (1 à 2% de taux de positivité), cela conduit à avoir la moitié dÚs TAG+ qui sont des faux +
On avait lu une histoire bien illustrĂ©e par @BioHospitalix ici, qui avait pu aller jusqu’à l’identification des virus
 qui n’avaient pas grand chose Ă  voir avec le SARS-CoV-2 👇
Entre les faux positifs et les faux négatifs, cela donne ce type de conclusion :
(Et les « faux négatifs » ne se font pas de PCR ensuite dans la vraie vie : ils partent embrasser Tatie Josette et la contaminer)
J’avais fait ce fil il y a qq temps sur des donnĂ©es publiĂ©es. Ici, rĂ©alisĂ©s dans des conditions « optimales », on voit que tous les problĂšmes des TAG n’en rendent la conclusion que + Ă©vidente 👇
D’ailleurs, je ne suis pas le seul à le dire 👇
Et sans vouloir me vanter, encore une fois j’étais dans des conditions idĂ©ales :
- de prélÚvement (« avec le pharmacien ça va pas si loin !! »)
- de température
- de lecture (j’ai eu des bandes trùs faiblement +, PCR + à chaque fois)

cf mes EHPAD avec 90% de faux neg👇
A quoi peuvent alors servir les TAG ?
À aller chercher les qq positifs dans la nature, non identifiĂ©s cas contacts et asymptomatiques (ou pour le pass « rĂ©crĂ©atif » dans les mĂȘmes conditions)
Comme les autotests, oui
Conclusion :
- 4 positifs / 10 ne sont pas dĂ©tectĂ©s par les TAG, qq soit l’ñge ou le contexte
âžĄïž un test neg N’exclut PAS le risque d’ĂȘtre porteur du virus (et rassure faussement !)
- 1% de faux positif pour chaque test
âžĄïž TOUT TAG doit ĂȘtre confirmĂ© par une PCR

‱ ‱ ‱

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14 Dec
Festival aux prélÚvements COVID cette semaine :
1ïžâƒŁ jeune homme de 24 ans, courbatures, fiĂšvre, maux de tĂȘte, toux
 depuis 9 jours !!
« J’attendais que ça passe, mais au boulot ça devenait difficile »
2ïžâƒŁ Mamie de 72 ans, vaccinĂ©e, qui pensait que les tests Ă©taient devenus payants (pour tous). Et donc a attendu 6 jours pour prendre rendez-vous chez le mĂ©decin afin d’avoir une ordonnance

3ïžâƒŁ Femme de 28 ans, non vaccinĂ©e
 qui vient faire sa derniĂšre prise de sang car elle va accoucher dans 2 semaines !
« Mon gynĂ©co m’a dit d’attendre aprĂšs l’accouchement pour le vaccin »
Read 7 tweets
3 Dec
Beaucoup d’interrogations sur les tests COVID sur prĂ©lĂšvement salivaires et leurs performances.

Donc je vais prendre le temps de vous expliquer comment/pourquoi on peut avoir l’@HAS_sante qui dit « ça marche du tonnerre » et moi « c’est nul »

et de vrais chiffres Ă  moi dedans !
PrĂ©ambule : l’analyse faite sur un prĂ©lĂšvement salivaire est toujours une PCR (je simplifie) ; comme pour un prĂ©lĂšvement nasopharyngĂ©.
Par abus de langage, on parle de « test salivaire » mais on devrait dire « test PCR sur prélÚvement salivaire »
Point 1ïžâƒŁ : Il y a MOINS de virus dans la salive
- Illustration comparĂ©e sur qq patients symptomatiques (entre J1 et J3) sur quelques patients prĂ©levĂ©s en double et sortant positif sur les 2 techniques (valeur Ct transcrites en Ă©quivalent nbr virus pour l’illustration)
Read 14 tweets
2 Dec
🚹DGS urgent du soir : mesures pour renforcer l’identification des cas OMICRON

Quelles sont les infos importantes ?
——

(Avec un pic Ă  1 moment contre la DGS qui se fout de nous)

solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/reply_

DĂ©finition des cas :
«Suspect»: virus + notion de voyage zone à risque (ou contact avec un voyageur)
«Possible»: virus + 1 particularité génétique (non spécifique) - on va y revenir
«Confirmé»: virus + séquençage retrouvant le variant Omicron (B1.1.529)

santepubliquefrance.fr/content/downlo

La DGS demande donc Ă  ceux qui font les tests de renseigner le champs facultatifs concernant les voyages.
C’est en pratique trĂšs trĂšs peu fait (mĂȘme - et surtout - quand le patient rempli lui mĂȘme ces infos)
Read 8 tweets
2 Dec
Gestion vaccination dans une ville de province : (suis invitĂ© Ă  la rĂ©union par l’ARS du dĂ©p ce matin)
FlorilĂšge de quelque Ă©changes :

- Demande de l’ARS le mois dernier de fermer le vaccinodrome.
Est restĂ© ouvert sur pression des mĂ©decins. Et lĂ  l’ARS demande de le rouvrir 🙃
- L’ARS informe que ce sera du Moderna la semaine prochaine car rĂ©servent le Pfizer aux vaccinations de ville (« c’est + simple pour notre logistique »)

Protestations de mĂ©decins et IDE : « ce n’est pas possible ! 


 on a dit Ă  nos patients depuis des mois que le Pfizer Ă©tait le mieux ! (WTF ?) Ils ne veulent que du Pfizer !»

(Un mĂ©decin) « -moi, vu les complications avec le Moderna, j’arrĂȘte la vaccination si c’est pas du Pfizer »

Un autre médecin explique que Moderna est aussi sûr
Read 9 tweets
30 Nov
[Thread] La @HAS_sante publie un avis sur la vaccination COVID des enfants 5-11 ans risques de formes sĂ©vĂšres, ou dans l’entourage de personnes immunodĂ©primĂ©s.

Que nous dit cet avis ?
Est-ce que la HAS s’est amĂ©liorĂ©s en maths ?
Et quid des chatons ?

has-sante.fr/upload/docs/ap

1ïžâƒŁ la @HAS_sante se lance dans une revue Ă©pidĂ©mio
 mais qui date de la S44 (soit la semaine du 1/11 !! Pour un avis du 25, et rendu public le 30).
Quelqu’un peut leur dire que la situation a « un poil » Ă©voluĂ© au niveau Ă©pidĂ©mio depuis ?
On « oublie » le principal facteur de confusion : les 0-9 ans sont moins testés, y compris quand ils ont des symptÎmes.
Le « taux de dĂ©pistage » n’est d’ailleurs jamais Ă©voquĂ©... alors qu’ils mentionnent justement que le taux de Pos est le + Ă©levĂ© chez les < 10 ans.
Read 16 tweets
29 Nov
🎉J’ai reçu ma 1ùre notification d’alerte de @TousAntiCovid !!

Qu’est-ce qui marche bien ?
Qu’est-ce qui cloche dans l’application et me turlupine ?
Est-ce que mon chat est responsable de cette alerte ?

Go pour #viemaviedecascontact (ou presque)
On a la date « à +/- 1 jour » du contact potentiellement contaminant
🟠MAIS : cela peut ĂȘtre trompeur car si on fait le second test Ă  J6 (et qu’il s’agit en fait du J5), c’est trop tĂŽt

Dans le premier encart rouge, il est indiquĂ© : « si vous n’ĂȘtes pas vaccinĂ©, isolez-vous et faites-vous tester ! »
❌ Non ! Il faut se faire tester dans TOUS les cas !
(Pas Ă©tonnant que beaucoup de cas contacts ne se soient pas fait tester
)
Read 9 tweets

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