🚨Thead important🚨
Etude locale des performances des tests antigéniques (TAG) vs. PCR
Quelles sont les performances des TAG ? Est-ce identique selon l’âge, les symptômes et leurs délais ? Existe-t-il des faux Pos ? Combien de faux nég ?
Vous saurez tout !!
Précision sur le contexte : on s’est organisé avec les 2 grandes pharmacies pendant 15 j :
- elles ont arrêté de faire les TAG pour vacciner +++
- je me suis chargé de leurs TAG (en + des PCR) ; j’en ai profité, avec l’accord des patients pour faire une PCR
(Pour jean-michel-polémique : j’ai fait « gratuitement » les PCR quand elles se sont avérées négatives)
541 prélèvements ont été analysés en double (PCR et Ag), avec le même préleveur à chaque fois, dans des conditions « optimales » de température.
Tous les âges représentés, 50% de symptomatiques
Vous remarquerez d’ailleurs le délai énorme avant de venir faire un test (sans rdv chez moi) : presque 1/4 des symptomatiques viennent au delà d’une semaine… donc APRÈS leur pic potentiel de contagiosité…
Résultats !!
Sensibilité des TAG = 60%… y compris sur les patients faisant le test rapidement
TAG = 4 personnes positives / 10 ne s’isoleront pas
Cette sensibilité de 60% est globalement retrouvée à tous les âges.
Pas de lien à noter avec le statut vacciné ou non
Cette sensibilité autour de 60%, on la connait depuis des mois… (👇)
mais on continue d’être fier en France de laisser dans la nature 4 positifs / 10 alors qu’on pourrait leur proposer une PCR ensuite (avec le Reff d’Omicron je vous laisse imaginer les trous dans la raquette…)
Grosse (mauvaise) surprise pour ceux qui ne le savaient pas encore : j’ai eu 5 faux Pos (2 PCR nég ensuite).

➡️ 1% de tous les TAG sont des faux Pos (ce qui est énorme et gênant vu le nombre… et le fait que 1/3 des TAG ne sont pas suivis par une PCR, pourtant obligatoire)
Ce problème des faux positifs, on en parle depuis longtemps (👇)
Quand le virus circule « peu » (1 à 2% de taux de positivité), cela conduit à avoir la moitié dès TAG+ qui sont des faux +
On avait lu une histoire bien illustrée par @BioHospitalix ici, qui avait pu aller jusqu’à l’identification des virus… qui n’avaient pas grand chose à voir avec le SARS-CoV-2 👇
Entre les faux positifs et les faux négatifs, cela donne ce type de conclusion :
(Et les « faux négatifs » ne se font pas de PCR ensuite dans la vraie vie : ils partent embrasser Tatie Josette et la contaminer)
J’avais fait ce fil il y a qq temps sur des données publiées. Ici, réalisés dans des conditions « optimales », on voit que tous les problèmes des TAG n’en rendent la conclusion que + évidente 👇
D’ailleurs, je ne suis pas le seul à le dire 👇
Et sans vouloir me vanter, encore une fois j’étais dans des conditions idéales :
- de prélèvement (« avec le pharmacien ça va pas si loin !! »)
- de température
- de lecture (j’ai eu des bandes très faiblement +, PCR + à chaque fois)

cf mes EHPAD avec 90% de faux neg👇
A quoi peuvent alors servir les TAG ?
À aller chercher les qq positifs dans la nature, non identifiés cas contacts et asymptomatiques (ou pour le pass « récréatif » dans les mêmes conditions)
Comme les autotests, oui
Conclusion :
- 4 positifs / 10 ne sont pas détectés par les TAG, qq soit l’âge ou le contexte
➡️ un test neg N’exclut PAS le risque d’être porteur du virus (et rassure faussement !)
- 1% de faux positif pour chaque test
➡️ TOUT TAG doit être confirmé par une PCR

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More from @SaiyanBio

14 Dec
Festival aux prélèvements COVID cette semaine :
1️⃣ jeune homme de 24 ans, courbatures, fièvre, maux de tête, toux… depuis 9 jours !!
« J’attendais que ça passe, mais au boulot ça devenait difficile »
2️⃣ Mamie de 72 ans, vaccinée, qui pensait que les tests étaient devenus payants (pour tous). Et donc a attendu 6 jours pour prendre rendez-vous chez le médecin afin d’avoir une ordonnance…
3️⃣ Femme de 28 ans, non vaccinée… qui vient faire sa dernière prise de sang car elle va accoucher dans 2 semaines !
« Mon gynéco m’a dit d’attendre après l’accouchement pour le vaccin »
Read 7 tweets
3 Dec
Beaucoup d’interrogations sur les tests COVID sur prélèvement salivaires et leurs performances.

Donc je vais prendre le temps de vous expliquer comment/pourquoi on peut avoir l’@HAS_sante qui dit « ça marche du tonnerre » et moi « c’est nul »

et de vrais chiffres à moi dedans !
Préambule : l’analyse faite sur un prélèvement salivaire est toujours une PCR (je simplifie) ; comme pour un prélèvement nasopharyngé.
Par abus de langage, on parle de « test salivaire » mais on devrait dire « test PCR sur prélèvement salivaire »
Point 1️⃣ : Il y a MOINS de virus dans la salive
- Illustration comparée sur qq patients symptomatiques (entre J1 et J3) sur quelques patients prélevés en double et sortant positif sur les 2 techniques (valeur Ct transcrites en équivalent nbr virus pour l’illustration)
Read 14 tweets
2 Dec
🚨DGS urgent du soir : mesures pour renforcer l’identification des cas OMICRON

Quelles sont les infos importantes ?
⤵️⤵️

(Avec un pic à 1 moment contre la DGS qui se fout de nous)

solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/reply_…
Définition des cas :
«Suspect»: virus + notion de voyage zone à risque (ou contact avec un voyageur)
«Possible»: virus + 1 particularité génétique (non spécifique) - on va y revenir
«Confirmé»: virus + séquençage retrouvant le variant Omicron (B1.1.529)

santepubliquefrance.fr/content/downlo…
La DGS demande donc à ceux qui font les tests de renseigner le champs facultatifs concernant les voyages.
C’est en pratique très très peu fait (même - et surtout - quand le patient rempli lui même ces infos)
Read 8 tweets
2 Dec
Gestion vaccination dans une ville de province : (suis invité à la réunion par l’ARS du dép ce matin)
Florilège de quelque échanges :

- Demande de l’ARS le mois dernier de fermer le vaccinodrome.
Est resté ouvert sur pression des médecins. Et là l’ARS demande de le rouvrir 🙃
- L’ARS informe que ce sera du Moderna la semaine prochaine car réservent le Pfizer aux vaccinations de ville (« c’est + simple pour notre logistique »)

Protestations de médecins et IDE : « ce n’est pas possible ! …
… on a dit à nos patients depuis des mois que le Pfizer était le mieux ! (WTF ?) Ils ne veulent que du Pfizer !»

(Un médecin) « -moi, vu les complications avec le Moderna, j’arrête la vaccination si c’est pas du Pfizer »

Un autre médecin explique que Moderna est aussi sûr
Read 9 tweets
30 Nov
[Thread] La @HAS_sante publie un avis sur la vaccination COVID des enfants 5-11 ans risques de formes sévères, ou dans l’entourage de personnes immunodéprimés.

Que nous dit cet avis ?
Est-ce que la HAS s’est améliorés en maths ?
Et quid des chatons ?

has-sante.fr/upload/docs/ap…
1️⃣ la @HAS_sante se lance dans une revue épidémio… mais qui date de la S44 (soit la semaine du 1/11 !! Pour un avis du 25, et rendu public le 30).
Quelqu’un peut leur dire que la situation a « un poil » évolué au niveau épidémio depuis ?
On « oublie » le principal facteur de confusion : les 0-9 ans sont moins testés, y compris quand ils ont des symptômes.
Le « taux de dépistage » n’est d’ailleurs jamais évoqué... alors qu’ils mentionnent justement que le taux de Pos est le + élevé chez les < 10 ans.
Read 16 tweets
29 Nov
🎉J’ai reçu ma 1ère notification d’alerte de @TousAntiCovid !!

Qu’est-ce qui marche bien ?
Qu’est-ce qui cloche dans l’application et me turlupine ?
Est-ce que mon chat est responsable de cette alerte ?

Go pour #viemaviedecascontact (ou presque)
On a la date « à +/- 1 jour » du contact potentiellement contaminant
🟠MAIS : cela peut être trompeur car si on fait le second test à J6 (et qu’il s’agit en fait du J5), c’est trop tôt…
Dans le premier encart rouge, il est indiqué : « si vous n’êtes pas vacciné, isolez-vous et faites-vous tester ! »
❌ Non ! Il faut se faire tester dans TOUS les cas !
(Pas étonnant que beaucoup de cas contacts ne se soient pas fait tester…)
Read 9 tweets

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