BREAKING🔔 The 7th preprint from G2P-Japan🇯🇵 is out @biorxivpreprint. #Omicron BA.2 variant seems to be more contagious and pathogenic than BA.1 variant. Please RT. 1/5
biorxiv.org/content/10.110…
1⃣ Statistical analysis shows that the effective reproduction number of BA.2 is 1.4-fold higher than that of BA.1. 2/5
2⃣ Neutralization experiments show that the vaccine-induced humoral immunity fails to function against BA.2 like BA.1, and notably, the antigenicity of BA.2 is different from BA.1. 3/5
3⃣ Infection experiments using hamsters show that BA.2 (note: because clinical isolates of BA.2 have not been obtained yet, we generated a chimeric virus bearing BA.2 S by reverse genetics) is more pathogenic than BA.1. 4/5
▶️ Our multiscale investigations suggest that the risk of BA.2 (a.k.a. "stealth Omicron") for global health is potentially higher than that of BA.1. 5/5
⏩ Viral genome sequences of BA.1 and BA.2 is ~2-fold more different from those of an original Wuhan-Hu-1 and #Delta and #Alpha. We showed the virological features of BA.2 is clearly different from that of BA.1. Should BA.2 be given a letter of the Greek alphabet? 5/5+1

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Feb 16
#拡散希望 🔔速報🔔 新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japan🇯🇵のプレプリント第7弾を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。#ステルスオミクロン とも呼ばれる「BA.2系統」は、従来の #オミクロン株 (BA.1系統)よりも、伝播力も病原性も高い可能性があります。1/6
biorxiv.org/content/10.110…
以下、本研究の概要です。
1⃣ ウイルス配列の数理統計解析によって、BA.2(ステルスオミクロン)の #伝播力 は、BA.1(従来のオミクロン)よりも約1.4倍高いことを明らかにしました。実際、デンマークやインド、フィリピンなどの国では、すでにBA.2への置き換わりが進んでいます。2/6
2⃣ ワクチン接種者の血清を使った中和試験の結果、BA.2(ステルスオミクロン)は、BA.1(従来のオミクロン)と同様、ワクチンによって誘導される中和抗体にきわめて抵抗性であることを明らかにしました。3/6
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Dec 25, 2021
速報です。#拡散希望
当ラボ主宰の新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japanは、新型コロナウイルス #オミクロン株 の病原性が、 #デルタ株 や従来株よりも低いことを、実験動物を用いて実証しました。1/5
#デルタ株 の場合、病原性と細胞融合力が高く、スパイクタンパク質が効率よく2つのサブユニットに分割されます(G2P-Japan論文第3弾 @Nature )。つまり、ウイルスの ①病原性、②細胞融合力、③スパイクタンパク質の分割効率 には、正の相関があることが示唆されます。 2/5
nature.com/articles/s4158…
一方、#オミクロン株 の場合、①病原性、②細胞融合力、③スパイクタンパク質の分割効率、のすべてのパラメーターが、デルタ株のみならず、従来株の新型コロナよりも顕著に低いことを実証しました。3/5
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Dec 25, 2021
BREAKING🎄 The 6th preprint from G2P-Japan - #Omicron is less infectious and pathogenic than #Delta and even an early pandemic SARS-CoV-2 in infected hamster model. 1/5
How come?
We have recently reported that Delta spike is efficiently cleaved into two subunits, and therefore, Delta is highly fusogenic and highly pathogenic @Nature . 2/5
nature.com/articles/s4158…
In sharp contrast, Omicron is less fusogenic (left panel) and its spike is faintly cleaved (right panel). Our data suggest that the efficacy of spike protein cleavage, fusogenicity and pathogenicity are well correlated each other. 3/5
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Jul 29, 2021
#拡散希望 当ラボ主宰の新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japanのプレプリント第3弾を、bioRxiv @biorxivpreprint に公開しました。本研究では、「注目すべき変異株 #VOI 」のひとつであり、南米で流行拡大する #ラムダ株 のウイルス学的特徴と進化動態を描出しました。1/5
biorxiv.org/content/10.110…
まず、#ラムダ株 が、ワクチンで誘導された #中和抗体 に強い抵抗性を示すことを明らかにしました。次に、ラムダ株特有の、スパイクタンパク質の大きな欠損変異(246-253欠損変異)が、このラムダ株の中和抗体抵抗性を規定していることを明らかにしました。2/5
分子系統学解析の結果、「246-253欠損変異」を持つ #ラムダ株 は、昨年7月頃に誕生し、その後南米各国で流行拡大したことが示唆されました。さらに、#ラムダ株 特有の #L452Q 変異が、#デルタ株#L452R 変異と同様に、ウイルスの感染力を増強させることを明らかにしました。3/5
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Jun 18, 2021
当研究室が主宰する新型コロナ研究コンソーシアム「G2P-Japan」のプレプリント第2弾を、@biorxivpreprint に発表しました。
本研究ではまず、 #デルタ株 (通称 #インド株 、B.1.617.2系統)に感染した細胞が、周囲の細胞と「くっつきやすい」ことを明らかにしました。 1/4
biorxiv.org/content/10.110…
そしてその「くっつきやすさ」が、 #P681R 変異という、デルタ株特有のスパイクタンパク質の変異によって引き起こされることを明らかにしました。 2/4
↓は、プレプリントからの抜粋・改変した、新型コロナに感染した細胞の写真。従来株(B.1.1系統)に比べて、 #インド株 (B.1.617.1とB.1.617.2系統)に感染した細胞は周囲の細胞と「くっつきやすく」、より大きな細胞塊を形成します(G2P-Japanメンバー、清水健太博士@北海道大学が撮影・提供)。 3/4
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Apr 5, 2021
#拡散希望 当ラボが主催する新型コロナ研究コンソーシアム「The G2P-Japan」の研究成果をbioRxiv @biorxivpreprint に掲載しました。
概要:流行拡大する #新型コロナ の変異株のひとつ #カリフォルニア株 が、日本人の免疫から逃避する可能性を明らかにしました。1/11

biorxiv.org/content/10.110…
ヒトの免疫、特に #獲得免疫 は、#液性免疫(中和抗体)」と #細胞性免疫 に大別されます。イギリス株やブラジル株などの新型コロナ変異株が、液性免疫(中和抗体)から逃避する可能性については世界中で研究が進んでいますが、細胞性免疫からの逃避の可能性については報告がありませんでした。2/11
The G2P-Japanでは、まず、新型コロナウイルスのスパイクタンパク質の一部が、「HLA-A24」という、日本人に多く見られる型の細胞性免疫によってきわめて強く認識される(つまり、HLA-A24のエピトープになる)ことを、免疫学実験によって実証しました。3/11
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