Li-Yun Lin (Jamie), PhD Profile picture
Jun 11, 2022 24 tweets 6 min read Read on X
#文獻分享音間 #簡報串

安東尼·佛奇的傳統/經典群體免疫的概念可能不適用於 COVID-19

時間:2022.06.11, UTC+8 21:00(會錄音)
主持人: @alexflybaal

文獻🔗: academic.oup.com/jid/advance-ar…

P. 1
簡易QA:

Q:我要怎麼發問?
A:用音間中的reaction功能發個問號,主持人會看

Q:哪些問題適合發問?
A:跟分享的文獻有關的比較適合

Q:沒跟到怎麼辦?
A:音間會錄音,可以對照推文串來閱讀

Q:音間跟推文串怎麼搭配?
A:推文串有標數字(P. X),可對照來看
讓我們從群體免疫聊到 #COVID19

這篇paper我以四個方向討論

- 群體免疫科普:聊聊定義跟歷史
- 達到群體免疫的疾病:這篇paper舉了什麼例子?沒有達到群體免疫的可能原因是?
- Sars-Cov-2:這病毒的獨到之處及為什麼群體免疫觀念對他不適用?
- 未來建議:該paper的作者對未來疫情控制怎麼看

P. 2
Part 1: 群體免疫科普

在這部分我們來聊聊群體免疫的定義跟相關發現歷史,以及這個觀念出現後學者們的發現

P.3
群體免疫力與群體免疫閾值

群體免疫力是指群眾對於傳染病病原體有保護性免疫力,而該免疫力可能來自:先天免疫、自然感染、疫苗接種

群體免疫閾值代表具有保護性免疫力的人口高到一定比例,能夠阻止病原體傳播,但未接種疫苗或其他未完全保護的個體中的零星暴發除外

P. 4
從18世紀開始對抗天花,到19世紀注意到麻疹有週期性,再到20世紀發現有長期保護性免疫的個體比例對於麻疹流行的影響,再到獸醫研究人員提出“群體免疫”的概念

無數學者投入研究後發現:其實群體免疫在人類社會上達成的難度極高,會受許多因素影響

P.5
Part 2:達到群體免疫的疾病

這篇paper舉了三例子:天花、麻疹、脊髓灰質炎(小兒麻痹),在此也來討論沒有達到群體免疫的可能原因

P. 6
天花、麻疹與脊髓灰質炎(小兒麻痹),上述三者皆有疫苗,傳播方式也不完全相同,目前天花已被根除,而麻疹與小兒麻痺目前接在控制中,未對公衛與醫療體系造成重大衝擊

P. 7
哪些因素可能影響達到群體免疫與否?

- 疾病和宿主之間的差異
- 傳播方式
- 免疫力的持續時間和完整性
- 未免疫人群
- 人群移動
- 人口密度...etc

值得注意的是,免疫的概念是流動的,從完全預防感染到房重症不妨感染,都是免疫的範疇

p. 8
Part 3:Sars-Cov-2

這病毒究竟有什麼獨到之處?
為什麼群體免疫觀念對他不適用?

P. 9
Sars-Cov-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) 為何如此難纏?

1. 有許多新變體且突變速度不慢
2. 感染力與躲避免疫力的能力一流
3. 目前現有疫苗以及感染無法產生長期保護性免疫力

P. 10
為什麼群體免疫觀念對他不適用?

1. 病毒株突變快速
2. 現有疫苗以及感染無法產生長期保護性免疫力
3. 國家政策、公衛干預、人群移動、疫苗接種狀態等都是影響因素
4. 群體免疫閾值高

P. 11
Part 4:未來建議

該paper的作者對未來疫情控制怎麼看?
Living with covid(跟covid一起生活)應該是怎樣呢?

P. 12
面對疫情,我們需要:

更廣效的疫苗:讓施打者可以產生長期且有效的免疫力
有效的預防措施:妥善佩戴口罩、保持通風、空氣過濾消毒等
開發藥物與療法:治療病人很重要

P. 13
作者在這篇文章結尾提到:與 Covid-19 一起生活

不代表:
- 一定要達到群體免疫閾值
- 處心積慮讓自己被感染

而是代表:
- 控制且預防Covid-19
- 不過度影響日常生活的情況下保護最多的人

P. 14
總結

Covid-19突變快、傳播力強,加上現有疫苗與感染無法誘導長期且有效的免疫力,難以達到群體免疫

面對疫情,我們需要更適合的疫苗、藥物、療法以及妥善的預防措施來應對,最重要的是不過度影響日常生活的情況下保護最多的人

P. 15
問答時間

之後會將蒐集到的問題與回答整理好後更新到這串推文中,感謝您的聆聽與閱讀。

P.16
Q1:疫苗研發為何困難?
A1:疫苗研發需要對病毒株有比較全面的了解,需要找出能誘導出針對該病毒的保護性免疫反應的方法

Q2:病毒突變很多了,會不會開發的二價疫苗(beta與omicron BA.1等)打了沒效?
A2:這難說,或許有助於降低重症率死亡率的效果更好,或是能夠降低後遺症風險等
Q3:如何預測突變或如何降低病毒的傳播速率?
A3:可藉由病毒株的分析去預測可能有的突變,而降低病毒傳播速率需要靠疫苗、藥物、預防措施,公衛措施與衛教同樣重要

Q4:台灣可能會有多少人有Longcovid
A4:這比例會受到疫苗覆蓋率、衛生營養狀態、病毒株等影響,個人評估可能會落在15~25%,可能更高
Q5:Covid有許多後遺症,不完全只有呼吸道症狀,在公共衛生上應該怎麼處理?
A5:還是要回歸病毒原始的特性、傳播路徑等去處理,加強衛教、通風過濾等還是很重要。

相關補充閱讀資料:
cdc.gov/mmwr/volumes/7…
Q6:確診omicron無法產生足夠的保護性免疫反應,那身體怎麼清除病毒的?
A6:免疫系統會產生很多抗體跟免疫反應來清除病毒,但病毒的特性導致產生了很多抗體但可以拿來對抗再感染的保護性免疫力不足,這兩點要分開來討論。

Q7:mRNA疫苗保護力為何消退得快?
A7:疫苗特性或是配方需加強,努力改良中
Q8:對鼻噴劑疫苗的看法?
A8:持保留態度,主要是以我所知鼻噴劑疫苗可能會對大腦有影響,不知道這十幾年來這個問題克服沒。

Q9:現在常講的康復是代表完全恢復還是?
A9:感染導致的急性期症狀結束並不再有感染力。

Q10:有後遺症是不是covid的特殊屬性
A10:其實也有其他冠狀病毒確診後有後遺症
Q11:有沒有可能covid會潛伏於體內中改天捲土重來
A11:有可能不排除這個可能性

Q12:病毒只利用ACE2感染細胞嗎?
A12:不只喔!但到底可以透過多少種路徑感染細胞還在研究中

Q13:兒童肝炎跟covid還是腺病毒有關?
A13:在肝臟中沒有檢驗出現腺病毒,到底跟腺病毒有沒有關聯需要更多研究
Q14:市面上針對空氣過濾中有很多產品,有可能有效嗎?
A14:不確定,產品的濾網、過濾效果等不一,可能更有助於讓容易對花粉、粉塵過敏的人覺得舒服些。
對於預防病毒感染可能沒效,也不排除可能會讓病毒傳播的更廣的可能性,且環境通風會比局部通風更重要!

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Sep 8, 2022
#闢謠推

疫苗有預防性跟治療性兩類,前者的功能明確包含:預防、降低風險,但世界上沒有任何疫苗能完全預防感染有些人用了就沒效),最初covid疫苗的效力大家其實不抱期望,也不抱持希望能百分百有效,最後在感染大爆炸下能有這樣的效果堪稱奇蹟

(續
Stephanie的研究扣掉數據分析錯誤外,在文獻方面引用方面屬錯誤引用與惡意解讀

簡單舉例

A跟B有關
A跟C有關

要證明B與C有關聯需要額外證明,不能用上述兩條就下定論B與C一定有關

而且通篇沒相關pathway的數據,你問任何相關領域的研究人員都會給你一樣的評價

(續
在上篇中我有提到為什麼有問題,在統計上的確1-2個極端值可以導致計算上的顯著差異,但那不代表真的有差

而能用來反駁的研究可參考下篇我在關於mRNA過敏反應引用的文獻

系統跟細胞不是概念問題,這是用錯專業術語,而且專業用詞上接受不能含糊,要把可能性說出來
Read 10 tweets
Jun 17, 2022
#文獻整理或許可以算是闢謠推

何院士的這篇貼文相信不少人有看到,那可信嗎?

今天就讓我們聊聊該院士所引用的文獻與今天剛出刊關於 #Delta#Omicron BA.1/2的 #Longcovid 風險分析研究

結論:文獻引用及解釋需更謹慎,以免傳播錯誤資訊誤導大眾

貼文連結:facebook.com/michelle.ho.58…
首先,先讓我們來看英國國家統計室ONS所整理的 “自我回報” 有長新冠者的數據(截圖+連結)

接種兩劑疫苗者:
Delta:15.9%
Omicron BA.1:8.7%

接種三劑疫苗者:
Delta: 7.4~8.5%
Omicron BA.1: 7.8~8%
Omicron BA.2:7.4~9.3%

❗️三種病毒株的LC盛行率沒有顯著差異

🔗:ons.gov.uk/peoplepopulati…
而在該院士貼文中所提到的未經同儕評審的日本發表為節圖這篇

這篇發表有個最致命的核心問題: 樣本數極低(18位Omicron確診者+18位確診後康復的對照組)

而根據對照組的確診時間推斷,主要應該是感染Alpha株,由此可知該發表不能拿來做Omicron與Delta LC的比較!

🔗:medrxiv.org/content/10.110…
Read 11 tweets
Jun 16, 2022
#covid #omicron #reinfection #丹麥 #再感染

關於再感染的丹麥研究引起了不少討論,先來重點摘要:

- 品質足以做分析是否為重複感染的檢體有限
- 該發表採集樣本時段在Delta浪潮末尾至Omicron BA.2浪潮開始
- 有BA.1-BA.2、BA.1-BA.1、BA.2-BA.2重複感染的案例
- 感染BA.1後可短期再感染BA.2
這張是該發表的研究方法流程圖:

從指定時段內的1, 848, 466個確診案例
⬇️
找出1739例是間隔20~60天再度檢測出陽性
⬇️
將這些案例去做比對挑出1056個檢體去做定序分析
⬇️
分析過程中有433個檢體定序失敗
⬇️
263個案例可以做後續分析

要做再感染的檢驗分析難度其實很高,最後合格的樣本數並不多
時空背景資訊:

該研究採集檢體的時間段2021年11月22日至2022年2月11日為Delta浪潮的末尾接到Omicron BA.1的大流行,再到Omicron BA.2開始崛起

這可以告訴我們什麼?

- 該時段內的再感染者一定非常多感染過Delta
- Omicron BA.2再感染BA.2者應該不多,因為剛崛起不久

Read 9 tweets
Apr 13, 2022
#Covid 問答集

1. 無症狀確診者會不會有後遺症?
有可能有,但是不一定會察覺,目前尚未知長期影響。

已有研究點出無症狀、輕症的青少年確診者肺部受損,(doi.org/10.1101/2022.0…),有研究點出病毒能在器官中生存可能導致未來病變 ,有發表點出腦部與其他器官也有影響(doi.org/10.1038/s41586…)
2. Longcovid (LC) 不會好?
這到不一定,有些人的症狀會逐漸改善,有些人症狀可能兩三個月就好轉,有些人可能用年來看;也有些人確診後一個多月才發現有症狀,目前LC的成因還在研究,有很高的機率跟發炎有關

3. 症狀嚴重才會有LC
無症狀或是輕症者也有可能有LC,相關發表不少可以翻我過往的推。
4. 打疫苗還是會被感染,是不是直接確診最實在?

完整施打疫苗可以降低住院率跟重症率,以目前有的文獻發表來看可以降低LC的機率,而現在流行的Omicron家族病毒株免疫源性低,你確診後還是可以繼續確診身體無法產生有足夠保護性的抗體,請千萬別以為確診後就有無敵星星,很高機率會眼冒金星後遺症滿滿
Read 6 tweets
Apr 5, 2022
1. 目前WHO所認證的疫苗主要是以最初始的covid-19病毒株去做開發,在delta病毒株出來的時候就發現突破性感染的機率高,但是施打疫苗可以降低重症率、住院率以及確診後有Lomgcovid的機率,目前已知病毒會長時間潛伏於人體,是否會造成更多病變仍須研究,但已有確診者出現其他器官病變的案例報告。
2. 冠狀病毒科的病毒在過往研究中可以在低溫環境下存活82天,澳洲的科學家的研究做出來的結果是Covid可以附著在絕大多數的物體上6-7天仍具有感染力,在部分材質的表面如紙鈔等可以維持28天,天氣寒冷了話可以活更久,所以洗手、返家後即時更衣、更換口罩有其必要。

link.springer.com/epdf/10.1186/s…
關於病毒是否變弱,以Covid-19為例,在Omicron BA.1 出現的時候學界覺得病毒株變弱了點,但其家族後來的變種也是現在的主流病毒株BA.2不管是反覆確診造成的傷害、住院率及死亡率都有所提升

如果有興趣可以看一看這篇新paper: nature.com/articles/s4157…

病毒不一定會變弱呦
Read 6 tweets
Apr 4, 2022
關於PCR檢測間隔時間

針對目前的病毒株,我如果接觸確診者要在病毒所內採檢,基本上我們是抓三天這個時間段

假設禮拜天我碰到確診者,禮拜一對方告知我他確診,那我應該禮拜三或禮拜四去檢驗,太早檢驗病毒量不夠鼻子或咽喉根本被捅了個寂寞還浪費醫療資源

病毒感染跟量多到足以測出需要時間啊!
然後我挺常被捅到流鼻血的,所以有特別去找家醫開專門的藥膏擦來保護鼻腔黏膜(法國今年真的乾冷非常多),醫檢師/醫生看到我流鼻血都是先把檢體放入管中標記好,而我自己去一邊抽衛生紙加壓處理

其實如果採檢者跑來關心我我會很擔心他之後檢體搞混,採檢到流血我都請他們優先處理檢體而非關心我🧪
補充一下法國的採檢法(戳法)

如果附近有椅子,會讓人坐在椅子上口罩稍微拉下來露出鼻子,稍微仰頭後先戳一邊鼻孔,如果戳的不順採檢者會用另一隻手扶著你的頭讓採檢順利,戳到鼻咽處轉一轉停留一下,拔出來再換另一邊的鼻孔戳下去重複一樣的步驟,之後放進檢體瓶內

沒有椅子就太空椅到採檢結束
Read 4 tweets

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