Die wahrscheinlich wichtigste Arbeit zum #Ursprung Herkunft von #SARSCoV2 #COVID19 ist heute als Preprint veröffentlicht. Die Arbeit und das Eingangsstatment zum Dilemma von Datentransparenz sind lesenswert - aber was zeigen die Daten? #origin zenodo.org/record/7754299…
Wissenschaftler haben Anfang März in GISAID (Datenbank zum Teilen von Virussequenzen) neue Einträge gefunden, die vom Huanan Markt/Wuhan stammen. Dabei handelte es sich um Rohdaten, also nicht nur um bereinigte Sequenzen des Virus, sondern alles, was man in den Umweltproben war
Diese Daten gehören zu einem chinesischen Preprint, der zur Schlussfolgerung kam, dass das Virus von Menschen auf den Markt eingebracht wurde. Man vermutete bereits, dass in den Daten mehr zu finden sein muss, die Rohdaten waren aber bisher nicht zugänglich
Warum diese erst jetzt hochgeladen wurden und ob dies absichtlich oder ein Versehen war, ist nicht klar - auch wurden die Daten kurz danach wieder von GISAID entfernt (was man auf Wunsch des Urhebers machen kann). Eine Statement dazu von chinesischer Seite gibt es bislang nicht
Doch zu den Daten: In den Rohdaten fand man nicht nur Virussequenzen, sondern auch genetisches Material von einer Reihe an Tieren - dies in viel höherer Konzentration als DNA von Menschen. Heraus sticht eine Tierart: die Marderhunde (raccoon dog), die auch Wirt für SARSCoV1 waren
Legt man strenge Kriterien für die Ähnlichkeit der Sequenzen an, findet man praktisch keine menschliche DNA mehr hier, die Probe ist aber voll mit Marderhund-DNA: Die Virus-positive Probe kam also sehr wahrscheinlich von einem Marderhund, aber nicht vom Mensch
Alle Proben, die Virus-positiv waren & tierische Sequenzen von einer Reihe potentieller Zwischenwirte aufwiesen, lokalisierten in einer Ecke des Marktes, in der bekanntermaßen Wildtiere verkauft wurden - entgegen früherer Aussagen. Je näher an diesem Stand, desto mehr Virus (rot)
Neben den Marderhunden wurde auch genetisches Material von Schuppentieren (Pangolin), Chinesischen Igeln, Larvenrollern (Schleichkatzen) & Bambusratten gefunden. Einige davon sind im Zusammenhang mit SARSCoV1 & anderen Coronaviren bekannt & bereits als Zwischenwirte diskutiert
All das ist kein Beweis, dass diese Tiere als Zwischenwirt dienten, aber der beste & glaubhafteste Datensatz zu infizierten Wildtieren auf dem Markt aus 2020, den es bisher gibt. Zusammen mit dem Wissen um SARSCoV1 erscheint dies das plausibelste Szenario eines Übergangs
Man weiß, dass es noch mehr Sequenzier-Datensätze von dem Markt geben muss, die aber bisher nicht öffentlich sind & die noch weiteren Einblick in die Ereignisse geben könnten. Warum diese Daten (Proben von vor Schließung des Markts am 01.01.2020!) bislang nicht geteilt wurden?
Schaut man auf die Daten um den Ursprung der 2002/2003 Epidemie, sieht man hier exakt das gleiche Szenario 17 Jahre später. Meine Einschätzung: Hätte man Zucht & Handel dieser Tiere 2003 verboten, hätte es keine Covid-19 Pandemie gegeben. Spätestens jetzt muss dies geschehen.
Zu den Marderhunden gibt es aber noch einen anderen Aspekt: Zwar werden diese als exotische Nahrung verkauft, der größte Teil wird aber für die Pelzproduktion gezüchtet (>14 Million Tiere pro Jahr), und dies für den globalen Markt (Nachfrage ⬆️Pelzverbrämung an Jacken & Mützen)
Ja, es ist wichtig, dass wir in pandemic preparedness investierten, also Virusüberwachung, Sequenzierung, neue Impfstoffe, Medikamente etc - ABER neuartige Zoonosen sind kein eben kein "natürliches" Ereignis sondern menschgemacht. Zu wenig Fokus ist auf Prävention! #OneHealth

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Mar 20
#RaccoonDog & #SARSCoV2: What's the link? Often when trying to understand emerging viruses, looking at another spillover event provides important insights. #SARSCoV2 & SARSCoV1 (cause of 2002/2003 epidemic) are very similar viruses (same species): SARS1 may hold some clues 1/
Upon investigating the origin of #SARSCoV1, animals sold in wet markets of outbreak regions were tested. Most work was done on civet cats but there were surprising results on raccoon dogs as well: All raccoons dogs tested on markets were SARS1 positive incl. virus isolation 2/
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Feb 1
Wo stehen wir gerade mit #SARSCoV2 #COVID19 - meine persönliche Einschätzung: Übergang von #Pandemie zu #Endemie ist in meinen Augen größtenteils vollzogen. Omikron "Variantensuppe" löst keine größeren Wellen mehr aus & macht auch keine großen Sprünge mehr
Die befürchteten Wellen durch die immun-evasiven BQ.1, BQ.1.1, XBB sind ausgeblieben. > 1 Jahr Zirkulation mit Omikron-Abkömmlingen lässt vermuten, dass dies das endemische Virus bleiben wird. Zirkulation aktuell nicht auf hohen Werten trotz Kälte & Aufhebung aller Maßnahmen
Für mich sind die letzten Wochen seit Anbeginn der Pandemie die ersten, in denen ich die Situation sich entspannen sehe. Für Risikopersonen gilt das nicht - die sollten sich weiter konsequent schützen, aber weniger Gesamtzirkulation bedeutet auch weniger Ansteckungsrisiken
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Dec 18, 2022
Liebe Eltern kleiner Kinder, reduziert das Risiko, dass sich Euer Kind jetzt infiziert. Trefft Euch nicht mit kranken Freunden oder Familie, schickt kranke Kinder nicht auf den Kindergeburtstag, tragt selbst eine Maske wenn ihr viele Menschen trefft, lasst kranke Kinder daheim
Es stimmt zwar, dass jedes Kind irgendwann seine erste Infektion mit RSV, Influenza, SARS-CoV-2 durchmacht - aber es "muss" auf garkeinen Fall diesen Winter sein. Auch wenn die meisten Kinder es gut durchstehen, werden einige sehr krank: Umso mehr, je jünger & bei Risikofaktoren,
aber auch komplett gesunde Kindern können so krank werden, dass sie in die Klinik müssen. Auch wenn die Kinderärzte & das Klinikpersonal alles geben, sind es aktuell einfach zu viele kranke Kinder & zu wenig Personal. Niemand will mit seinem kranken Kind im Flur liegen.
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Dec 17, 2022
In den letzten drei Jahren war jedes Immunsystem mit alle dem konfrontiert: Antigene aus Nahrungsmitteln, aus der Umwelt (z.B. Bakterien, Pilze), Herpesviren, unbehüllte RNA-Viren (zB Rhinoviren, Adenoviren), apathogene Viren, Pollen, Pflanzenstoffe, Antigene von Haustieren usw.
Die Vorstellung, dass das Tragen von Masken außerhalb des eigenen Haushaltes (selbst wenn dies einige Stunden am Tag war) zu einem "zu wenig" an Immunstimulation geführt hat, ist vollkommen unsinnig. Viele Kinder, die jetzt krank sind, haben nie eine Maske getragen (siehe Alter!)
Niemand ist immunsupprimiert, weil es in den 2,5 letzten Jahren temporär Infektionsschutzmaßnahmen gab, diese Art der Immunosuppression gibt es nicht & ist biologisch nicht plausibel. Es gab allerdings für einige Viren weniger Zirkulation (hauptsächlich behüllte Atemwegsviren),
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Dec 13, 2022
I see #MERS trending - a few thoughts on it. MERS is a coronavirus, just like SARS-CoV-2, but there are many differences: MERS is primarily transmitted from camels to humans by zoonotic transmission. It is continuously circulating in camels which themselves do not get very sick
Unlike SARS-CoV-2, the virus is replicating in humans in the lower respiratory tract, therefore it's not easily transmitted between humans unless there are special conditions that favor transmission (eg health-care related). At-risk of infection are those with close camel contact
Very unlikely that someone who visits a soccer game without close camel contact contracts MERS. So while I am not worried about MERS in this setting, constant spillover gives the virus a chance to adapt. We should keep an eye on MERS but also important to be clear about risks
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Dec 2, 2022
#SARSCoV2 #COVID19 & #Schwangerschaft: Wer schwanger ist, der sollte alles tun, um eine Infektion zu vermeiden, auch nach mehrfacher Impfung. D.h. Menschenansammlungen meiden/nur mit qualitativ hochwertiger Maske (FFP2)/Kontakte mit akut erkrankten Personen vermeiden.
Ich bin immer wieder erstaunt, wie viele Schwangere man im Nahverkehr, Supermarkt, etc. ohne Maske sieht. M.E. fehlt hier ganz gezielte Aufklärung! So vieles ist in der Schwangerschaft tabu, teils aus reinem Vorsichtsgedanken - #COVID19 sollte unbedingt dazu gehören!
Ebenso bei #Neugeborenen: Erkältete oder sonstig akut erkrankte Personen gehören nicht in die Nähe kleiner Babies! Bei aktuellem Infektionsgeschehen (v.a. wegen RSV) sinnvoll, Besuche & Kontakte außerhalb des Haushaltes auf ein Minimum reduzieren - oder mit Maske oder draußen!
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