Thread by @BoucletteDr

1/ Continuons notre série "où est passé l'argent de la recherche" avec les études du #SARS_CoV_2 dans les #eaux usées.

Sur le principe, pourquoi pas ?

C'est assez robuste pour y retrouver les #drogues. En France, ces travaux du @CNRS étaient dans @libe

liberation.fr/societe/2013/0…

2/ Le soucis est qu'un #virus c'est pas une molécule.

La bonne nouvelle a été que l'on peut détecter le #SARS_CoV_2 dans les eaux usées !

La moins bonne a été qu'il était difficile de savoir quoi en faire...

Car savoir qu'un virus pandémique circule aide peu.

3/ Au niveau du #dépistage, à peu près aucune étude sur les #eaux usées n'a regardé la #sensibilité ou #spécificité de la méthode.

Quelle variabilité pour un même échantillon ?

Quelle variabilité pour des échantillons pris le même jour à une même station ?

4/ Et quelle proportion de faux positifs ?

Par exemple, une #prépublication (heureusement jamais publiée) concluait qu'il y avait du #SARS_CoV_2 dans les égout à Barcelone en... mars 2019.

(Inutile de vous dire que le PC Chinois s'en est délecté.)

medrxiv.org/content/10.110…

5/ L'article le plus pointu vérifie que 2 extractions ARN du même échantillon sont corrélées (heureusement !).

Ils sont aussi les seuls à tester #statistiquement la corrélation entre virus dans les eaux usées & nombre de cas. Mais ça s'arrête en mai 2020

nature.com/articles/s4158…

6/ Depuis, >150 articles étudient ça avec un intérêt variable.

Une #revue systématique (biaisée en faveur de la méthode) les recense dans "Science of the Total Environment" qui les a presque toutes publiées.

L'absence des #stats est frappante.

doi.org/10.1016/j.scit…

7/ À défaut de suivre l'épidémie mieux qu'avec des #dépistages, un intérêt est dans le #séquençage.

Pour le coup, on peut déterminer (plus ou moins) quels #variants circulent, voire d'en détecter de nouveaux.

journals.asm.org/doi/full/10.11…

8/ Et, faut le reconnaître, jolie étude suggérant que des #variants inconnus circulent parmi la #faune des égouts de New York.

Au passage, contrairement aux autres études, eux regardent aussi quel #ADN de #Mammifère circule (pas juste l'#ARN viral).

nature.com/articles/s4146…

9/ En France, un "#pognon de dingues" a été mis dans les eaux usées via le réseau #Obépine.

Environ 72.000 €/semaine depuis mars 2020 surtout via 2 pigeons : @cnrs et @Sorbonne_Univ_

C'est des millions d'€ donc leurs plus gros projets sur #COVID19.

lejournal.cnrs.fr/articles/covid…

10/ Faut pas tirer sur une ambulance mais en 2 ans ce réseau a surtout pondu des infographies pour le @Le_Figaro (souvent après les #vagues épidémiques).

Leur production scientifique est indigente (5 articles dont 2 dans des journaux mineurs #MPDI).

reseau-obepine.fr/publications-s…

11/ Ce gâchis d'argent #public a fini fin Jan 2022, malgré l'académie de médecine (toujours dans les bons coup, comme pour l'#amiante).

Attention, je dis pas que l'approche est à jeter.

Mais le réseau #Obépine a montré qu'ils étaient pas à la hauteur.

franceinter.fr/sciences/en-pl…