Tapi di era Megawati, Theys dibunuh. Orang Papua dipaksa berpikir, jika risikonya sama-sama mati, ya lebih baik angkat senjata sekalian.
Giliran Megawati dan SBY, yang dikirim 40.000 pasukan. Perang 2 tahun tak pernah dimenangkan siapapun. Sampai dipaksa berdamai oleh tsunami 2004.
Saat KSAD, ia juga tak menang perang di Aceh. Korban kadung banyak.
Padahal sebaliknya. Bagi sebagian, jalan spt Merauke ke Boven Digoel dianggap mempercepat perampasan tanah untuk sawit.
Sementara di tempat lain, jalan hanya diaggap untuk kepentingan militer.