Thread by @Fischblog

OK, hier ist ein Paper, laut dem das Erbgut des Sars-CoV-2 #coronavirus ins menschliche Genom integriert werden kann. Ich bin sehr skeptisch, ob die Behauptung einer näheren Überprüfung standhält.
Kurzer Thread.
biorxiv.org/content/10.110…

Laut Veröffentlichung ist dafür die Reverse Transkriptase von LINE-1 verantwortlich. LINE-1 ist ein transponierbares Element, das mit Hilfe eines in ihm codierten Enzyms mit Reverse-Transkriptase-Fähigkeit an anderen Orten des Chromosoms wieder eingebaut werden kann.

Die Vermutung ist anscheinend, dass dieses Enzym von LINE-1 sich das Virusgenom reift und einbaut. Diese These basiert darauf, dass die Gruppe in anderen publizierten Daten infizierter Zellen gemischte RNA aus viralen und menschlichen Teilen gefunden hat.

Dass LINE-1 dafür verantwortlich ist, schließen sie daraus dass sie Zellen so verändert haben, dass sie Zellen verändert haben, damit sie sehr viel LINE-1-Reverse-Transkriptase herstellen. Dabei haben sie Indizien für eingebautes virales Genom gefunden.

Außerdem zeigen sie Indizien, dass LINE-1-RT durch eine Sars-CoV-2-Infektion häufiger produziert wird. Das ist evtl nicht unplausibel, Kann mir schon vorstellen, dass solche transponierbaren Elemente bei Infektionen und anderen Stressoren mobiler werden.

Allerdings sind das alles bisher Versuche in Zellkulturen und vor allem mit modifizierten Zellen, die darauf zugeschnitten wurden, viel RT zu produzieren. Das hat aber nichts mit Realbedingungen zu tun.

Inwieweit die "gemischten" RNAs aus den Literaturdaten real sind oder einfach Messartefakte sind, die bei solchen hochsensiblen Experimenten öfter auftauchen, müsste man gucken. Man darf nicht jeden schrägen Befund gleich für bare Münze nehmen. Reale Ergebnisse sind nie "sauber".

In der Summe ist das Genom-Einbau-Paper bisher nur eine weitere, meiner Meinung nach spekulative, Vorabveröffentlichung über #Covid19, von denen es viel zu viele gibt. Ich bin da sehr skeptisch und würde da noch ein, zwei bessere Papers abwarten, bevor ich das ernst nehme.

Die Ergebnisse aus Zellkulturen beschreiben Bedingungen, die in der Realität nicht auftauchen. Die Befunde aus Datenbanken könnten auch einfach Artefakte von Experimenten sein, die sie rausgefiltert und zusammengetragen haben. In der Summe alles noch nicht überzeugend.