Thread by @RWittenbrink

Wie geht es weiter mit der Entwicklung von #SARSCoV2?

Eine Fragestellung mit der sich @ArisKatzourakis et al. in diesem neuen Artikel auseinandersetzen:

nature.com/articles/s4157…

„Was die Epidemiologie des Erregers anbelangt, so ist es wichtig zu bedenken,…🧵

#COVID19 #Corona

https://twitter.com/ArisKatzourakis/status/1643550583117213696

dass der Übergang von einer Pandemie zu einem künftigen endemischen Auftreten von SARS-CoV-2 wahrscheinlich langwierig und unstetig sein wird, und dass endemisches SARS-CoV-2 bei weitem nicht gleichbedeutend ist mit ungefährlichen Infektionen, mildem

COVID-19 oder einer geringen Mortalitäts- und Morbiditätsbelastung der Bevölkerung.“

„SARS-CoV-2 hat weltweit Millionen von Todesfällen und eine erhebliche Morbidität verursacht. Intensive wissenschaftliche Bemühungen, die Biologie von SARS-CoV-2 zu verstehen, haben zu einer

erschreckenden Anzahl von Genomsequenzen geführt. Wir wurden Zeuge von evolutionären Ereignissen, die zuvor meist nur indirekt abgeleitet werden konnten, wie z. B. das Auftreten von Varianten mit unterschiedlichen Phänotypen, z. B. Übertragbarkeit, Schweregrad und Immunevasion.

In dieser Studie werden die Mechanismen untersucht, die die genetische Variation bei SARS-CoV-2 hervorbringen und die Prozesse innerhalb des Wirts und auf Populationsebene, die diesen Ereignissen zugrunde liegen. Wir untersuchen die selektiven Kräfte, die wahrscheinlich die

Entwicklung einer höheren Übertragbarkeit und in einigen Fällen eines höheren Schweregrads während des ersten Jahres der Pandemie vorangetrieben haben, sowie die Rolle der Antigenevolution während des zweiten und dritten Jahres, zusammen mit den Auswirkungen von Immunevasion und

Reinfektionen und den zunehmenden Hinweisen auf die mögliche Bedeutung der Rekombination. Um zu verstehen, wie wichtige Linien, wie z. B. besorgniserregende Varianten (VOC), entstehen, stellen wir die Belege für das Modell der chronischen Infektion, das der Entstehung von VOC

zugrunde liegt, der Möglichkeit gegenüber, dass ein Tierreservoir bei der Entwicklung von SARS-CoV-2 eine Rolle spielt, und kommen zu dem Schluss, dass Ersteres wahrscheinlicher ist. Wir bewerten Unsicherheiten und skizzieren Szenarien für die möglichen zukünftigen

Entwicklungspfade von SARS-CoV-2.“

Mögliche Zukunftsszenarien

„Bis Ende 2021, vor dem Auftauchen von #Omicron, wurden VOCs wie Alpha und Delta hauptsächlich mit einer erhöhten Übertragbarkeit und einem mäßigen Grad an Immunflucht in Verbindung gebracht. Die derzeitigen

Erkenntnisse deuten jedoch darauf hin, dass die Eigenschaften der Immunflucht die Hauptursache für die Verdrängung von Delta durch Omicron waren. Dies bedeutet, dass über längere Zeiträume hinweg, je nach der intrinsischen Übertragbarkeit künftiger Linien und dem Grad der

Kreuzimmunität zwischen ihnen, Szenarien denkbar sind, in denen zwei oder mehr Linien gemeinsam zirkulieren oder in denen eine Linie andere zum Verschwinden bringt. Ein solches Zusammenspiel könnte tiefgreifende Auswirkungen auf die öffentliche Gesundheit haben, abhängig von der

Übertragbarkeit und Virulenz der dominanten Linie und der immunologischen Landschaft, in die antigenisch unterschiedliche Linien eingeführt werden. So ist beispielsweise ein Szenario denkbar, in dem eine schwindende Immunität und eine antigene Besonderheit regelmäßig zu neuen

Infektionswellen führen könnten. Mit den oben erwähnten Vorbehalten können wir uns ein mögliches Best-Case-Szenario für die künftige Evolution von SARS-CoV-2 vorstellen, bei dem es zu einer fortgesetzten Antigendrift innerhalb der Omicron-Linie kommt, so dass die durch eine

Kombination aus Impfung und vorheriger Infektion hervorgerufene Immunität über kurze und mittlere Zeiträume vor einer schweren Erkrankung bei einer erneuten Infektion schützt und breite Immunreaktionen hervorruft, die eine beträchtliche weitere Evolution des Virus abdecken. Im

günstigsten Fall wird sich die Mehrzahl der künftigen, die Fitness verbessernden Mutationen darauf beschränken, der Wirtsimmunität zu entkommen. Ausgehend vom derzeitigen Trend bei den Omicron-Varianten könnten wir eine neue Infektionswelle für alle weiteren ~4 Monate der

Viruszirkulation erwarten, obwohl wir nicht wissen können, ob diese Periodizität beibehalten wird. Zur Veranschaulichung: Wenn wir uns vorstellen, dass die Sterblichkeitsrate bei SARS-CoV-2-Infektionen bei Personen mit vorheriger Immunität ähnlich hoch ist wie bei der saisonalen

Influenza, können wir mit einer zwei- bis dreimal so hohen jährlichen Belastung wie bei der Influenza rechnen. Dabei wird jede zusätzliche Belastung durch postakute COVID-19-Folgen (#LongCovid) ignoriert. Bei diesem Szenario würden die längerfristigen Auswirkungen des Virus durch

seine Pathogenität bestimmt. Man geht davon aus, dass das Virus, ähnlich wie andere humane Coronaviren, einem regelmäßigeren saisonalen Inzidenzmuster folgen wird. Die sommerlichen Ausbrüche des Jahres 2022 durch von Omicron abgeleitete Linien deuten darauf hin, dass ein

regelmäßiges saisonales Muster möglicherweise nicht bald erreicht wird. Eine wahrscheinliche Alternative zum Best-Case-Szenario besteht darin, dass die Antigenevolution durch das Auftreten einer neuen Variante mit einer völlig anderen Konstellation von Mutationen und

phänotypischen Eigenschaften unterbrochen wird, die es dem Virus ermöglicht, die durch frühere Infektionen oder Impfstoffe aufgebaute Immunität zu umgehen. Dies könnte durch eine beschleunigte Evolution des Virus während der langfristigen Persistenz bei immungeschwächten Personen

geschehen, die zufällig einen basaleren Stamm von #SARSCoV2 aus einer Zeit in sich tragen, in der eine völlig andere Variante im Umlauf war. Ein Beispiel dafür ist, dass sowohl die Stämme, die im Weißwedelhirsch zirkulieren, dem einzigen bekannten neuen Reservoir in der Tierwelt,

als auch eine kryptische Linie, die in städtischen Abwässern161 gefunden wurde, Basalstämme aus der Zeit vor Omicron und sogar vor VOC aufweisen, was die anhaltende Persistenz von Basalstämmen zeigt. Die Unvorhersehbarkeit der Entwicklung der Virulenz könnte bedeuten, dass solche

Stämme virulenter sind als Omicron und vielleicht bei mehr Menschen schwere Krankheiten verursachen. In einem solchen Fall würde die Gesamtauswirkung auf die öffentliche Gesundheit durch das Gleichgewicht zwischen der Schwere der Infektionen und der Kreuzimmunität der

Restbevölkerung bestimmt. Das Auftreten von VOCs und potenziellen zukünftigen antigenisch unterschiedlichen Linien kann als "shift-ähnliche Ereignisse" betrachtet werden, d. h. als unerwartete, signifikante Veränderungen im genetischen Aufbau des Virus und potenziell in seinen

klinisch relevanten Eigenschaften. Typische potenzielle Verursacher von Shifts sind Rekombinationen. Obwohl es derzeit keine Anhaltspunkte dafür gibt, dass die Rekombination an der Entstehung von VOC, einschließlich Omicron beteiligt war, bleibt die Rekombination weiterhin ein…

ein potenzieller Grund zur Sorge. 
Andere potenzielle seltene, folgenreiche evolutionäre Ereignisse, die in der Zukunft auftreten könnten, könnten das Bild radikal verändern, aber ihre Wahrscheinlichkeit ist nicht quantifizierbar. Dazu gehören beispielsweise die Rekombination

zwischen SARS-CoV-2 und einem anderen Virus, die den Phänotyp drastisch verändert, das Übergreifen abweichender Varianten aus Tierreservoiren auf den Menschen, eine völlige Veränderung der Übertragungsweise, wie sie beim transmissiblen Gastroenteritis-Virus, einem Coronavirus der

Tiere, beobachtet wurde, und neue Formen der Impfstoffflucht, die den Schutz vor schwerer Krankheit und Tod rasch untergraben. Um die Auswirkungen der Entwicklung von SARS-CoV-2 auf die menschliche Gesundheit zu erfassen, müssen wir die Überschneidung zwischen Epidemiologie und

Entwicklung des Virus berücksichtigen. Wenn das Virus nicht getilgt wird, wird es wahrscheinlich endemisch werden, ein Prozess, der Jahre bis Jahrzehnte dauern kann. Wir können feststellen, dass eine endemische Persistenz erreicht wurde, wenn das Virus von Jahr zu Jahr

wiederholbare Muster in der Prävalenz aufweist, z. B. regelmäßige saisonale Schwankungen und keine Spitzenwerte außerhalb der Saison. Durch die Untersuchung der Evolution von SARS-CoV-2 seit seinem Auftreten beim Menschen haben wir viel gelernt, und wir können sicherlich

fundierte Vermutungen darüber anstellen, was wahrscheinlich oder unwahrscheinlich als Nächstes passieren wird, aber aufgrund der hochgradig multifaktoriellen und stochastischen Natur des Prozesses wird die künftige Evolutionsbahn des Virus in vielen entscheidenden Details im

Wesentlichen unbekannt bleiben. Was die Epidemiologie des Erregers anbelangt, so ist es wichtig zu bedenken, dass der Übergang von einer Pandemie zu einem künftigen endemischen Auftreten von SARS-CoV-2 wahrscheinlich langwierig und unstetig sein wird, und dass endemisches

#SARSCoV2 bei weitem nicht gleichbedeutend ist mit sicheren Infektionen, mildem #COVID19 oder einer geringen Mortalitäts- und Morbiditätsbelastung der Bevölkerung.“

#Covid_19 #Coronavirus #LongCovid #CovidIsNotOver
#MECFS #CovidIsntOver

nature.com/articles/s4157…