On parle beaucoup du développement des #vaccins contre le #SARSCoV2 pour prévenir le #COVID19 mais peu de leur mise en place. Cela relève beaucoup du champ scientifique qu’est la dynamique des populations. 1/8 thread
Certains vaccins peuvent être thérapeutiques mais, le plus souvent, comme pour le #COVID19, ils sont à but prophylactique (pour empêcher l’infection). Vous pouvez alors avoir deux cibles : protéger les personnes les plus à risque ou éteindre l’épidémie. 2/8
5 paramètres entrent en jeu : le nombre de reproduction de l’épidémie #R0, l’efficacité de protection du vaccin (P), la fraction de la population vaccinée ou "couverture vaccinale" (C), le risque individuel à la #vaccination (V) et le risque individuel lié à l’infection (I) 3/8
Au niveau populationnel, pour empêcher la propagation de l’épidémie, il faut vacciner une proportion de la population C* égale à 1-P/R0. Donc, avec un #vaccin efficace à 100 %, le #R0 de l’épidémie de #COVID19 étant de 3 environ, il faudrait vacciner 66 % de la population. 4/8
Si on se base sur le nombre de reproduction actuel #Rt de l’ordre de 1,4 alors cette couverture vaccinale tomberait à 23 % mais nécessiterait le maintien des gestes barrières et du port du masque... 5/8
Attention, la formule 1-1/R0 n'inclut l’hétérogénéité spatiale ou individuelle. Ainsi, s’il existe des #superpropagateurs avec un profil facilement identifiable, en vaccinant ces personnes prioritairement on pourrait en théorie abaisser le seuil de couverture vaccinale. 6/8
Au niveau individuel, vous avez intérêt à vous faire vacciner si I > V, sachant que I est difficile à estimer avec précision pour le #COVID19 car il dépend du taux de létalité (à peu près connu) et de votre probabilité de contracter l’infection (variable). 7/8
La #vaccination reste avant tout un acte #solidaire et un des fondements de la vie en #société : en se vaccinant on protège les plus à risque, surtout s'ils ne peuvent même pas se faire vacciner (ceux pour qui et I et V sont élevés). 8/8 @threadreaderapp
unroll
• • •
Missing some Tweet in this thread? You can try to
force a refresh
À partir des chiffres hospitaliers et des décès jusqu’au 17 nov, nous estimons avec #COVIDSIM un Rt national de 0.82 [0.70 - 0.89] avec actuellement entre 180.000 et 380.000 porteuses de l’infection et de 11.800 à 30.700 nouvelles infections par jour. 1/n Thread
Ceci correspond à notre scénario "plus réaliste" mais "optimiste" d'autant que la baisse du nombre de reproduction semble avoir été amorcée avant le début du confinement (effet #couvrefeux et/ou #vacances). 2/n
Si la tendance se poursuit, au 1er Déc la prévalence serait de l’ordre de 178.000, les admissions en réa entre 130 et 300 par jour (contre 350 environ aujourd'hui) et il y aurait environ 13.000 nouvelles infections par jour (entre 5.400 et 23.200). 3/n
Probablement du fait de la baisse des températures, les pays européens augmentent les mesures de restriction contre #Covid_19 (couvre-feux, confinement suggéré, imposé...).
Une grosse différence réside dans le #seuil de déclenchement de ces mesures strictes.
1/n Thread
Pour la variation des mesures de contrôle, il existe une visualisation par @OurWorldInData avec un indice de sévérité de la réponse (même si cet indice reste relativement arbitraire).
Dans certains pays comme l'Angleterre, l'Italie ou la France, le seuil de déclenchement du durcissement semble très élevé. En France, on a attendu que les services de réanimation soient remplis au tiers de patient⋅e⋅s #COVID19.
3/n
27 Juillet, le Conseil Scientifique écrit dans on avis n°8 : "A moyen terme, cet avis envisage ce que pourrait être une reprise de la circulation du virus à un haut niveau à l'automne 2020." solidarites-sante.gouv.fr/actualites/pre…
2/n
Ralentissement encore plus prononcé des temps de doublement de l'épidémie calculés sur les hospitalisations #COVID19 au niveau national au 10 nov. : environ 51 jours sur les 7 derniers jours, contre 21 jours la semaine précédente et 10 jours lors de l'annonce du confinement.
1/10
Rappelons que l'effet du confinement national n'est pas encore visible : les hospitalisations du 3 au 10 novembre reflètent l'état de l'épidémie entre le 16 et 31 octobre environ car il s'écoule entre 10 à 18 entre infection et hospitalisation.
2/10 medrxiv.org/content/10.110…
On voit aussi une hétérogénéité des nombre de reproduction calculés sur les hospitalisations dans les départements au 8 novembre (noir croissance, bleu foncé croissance potentielle, bleu clair décroissance potentielle, détails sur la légende sur covid-ete.ouvaton.org).
3/10
#deuxiemeVague de #COVID19france : il est encore trop tôt pour estimer l'effet du #confinement2, notre modèle COVIDSIM nous permet de simuler 4 scénarios pour les prochaines semaines. 1/n Thread
Au cours de la 1e vague, le #confinement avait réduit le nb de reproduction (R) de 3 à 0,7 (cf nos estimations de l'époque : medrxiv.org/content/10.110…). Compte tenu des différences de restrictions entre les deux confinement, il est peu vraisemblable que le R actuel soit de 0,7. 2/n
Le scénario R = 0,7 (A) constitue donc une borne inférieure nette. En revanche, R = 1 correspond un à un contrôle insuffisant, qui appellerait à un durcissement des restrictions (que nous fixons arbitrairement au 15 novembre avec pour effet de R = 0,9 dès lors) (B). 3/n
Les visons sont, comme beaucoup de mammifères, infectés par le #SARSCoV2 avec des symptômes légers. Les élevages peuvent donc être un réservoir. Et, pour la grippe aviaire, l'homogénéité génétique des animaux d'élevage favorise les souches virulentes. 2/10 adioscorona.org/themes-questio…
Il y a déjà eu des épidémies de #SARSCoV2 dans des élevages de visons aux Pays-Bas en juin qui ont conduit à des abattages massifs à cause des passages à l'homme (on a estimé que 50.000 infections ont été indirectement liées à ces élevages). 3/10 sciencemag.org/news/2020/06/c…