Discover and read the best of Twitter Threads about #R0

Most recents (13)

Le #variant #B117 de #SARSCoV2 détecté outre-Manche fait la une.

Des modèles de fin Déc suggèrent que son R0 est plus de 50 % supérieur aux autres variants.

Cause ou conséquence ? Le variant s’est-il fixé « par hasard » ou de par son avantage ?

On en sait un peu plus.

1/N
Le #variant #B117 a été détecté car 25 % des tests #PCR britanniques ont 3 cibles dans le génome viral et, pour le #B117, 2 sur 3 sont positives. Mais seul le séquençage permet d’être sûr.

Selon @PHE_uk, en Oct, 3 % des tests douteux étaient liés à #B117, en Déc > 95 %

2/N
Les analyses préliminaires de @cmmid_lshtm montrent que ce #variant s’est propagé rapidement dans des régions mais pas dans d’autres.

Les données de mobilité ne semblent pas expliquer ces différences. L'avantage de #B117 serait alors de 50 à 74 %.

cmmid.github.io/topics/covid19…
3/N
Read 11 tweets
Comment pourrait évoluer la #virulence du #SARSCoV2 pour l'homme ?

Quelques éléments de réponse dans ce #thread.

Pour des détails, il y a notre Rapport 12 du mois d'août :
covid-ete.ouvaton.org/Rapport12.html

1/N
La #virulence est le mal qu’un parasite (virus, bactérie,...) fait à son hôte.

Dans le cas du #SARS-CoV-2, on peut la mesurer via le risque d’être hospitalisé ou de décéder. Sachant que cela dépend fortement de l’âge.
thelancet.com/journals/lanin…
2/N
Contrairement à une idée répandue, les parasites n’évoluent pas tous pour rapidement devenir avirulents.

La #tuberculose est restée virulente.

Quand au #VIH, sa virulence semble même avoir #augmenté depuis les années 1980.
thelancet.com/journals/lanhi…
3/N
Read 8 tweets
Will Slovakia avoid „Czech scenario“?
Health minister #marekkrajčí 16.10. first time publicly compared the second wave COVID-19 trends in Slovakia and Czech republic in a chart showing that Slovakia is following the scenario in Czech republic with a delay of 2~3weeks.: Source: https://dennikn.sk/...
Trend chart from few days ago (22.10.) was even worse and clearly showing that Slovakia is repeating the Czech scenario: Image
Somewhere here we should be looking for motivation of the government in Slovakia and prime minister #igormatovič to solve the problem of rising second wave of epidemics and dark vision of collapsing health care by unusual way - #masstesting in combination with limited lockdown.
Read 67 tweets
La valeur du #R0 (nombre de reproduction de base) n'est pas spécifique à un agent infectieux. Elle a deux composantes, l'une biologique et l'autre sociale. Pour plus de détails sur son calcul, voir notre note covid-ete.ouvaton.org/Note_R0.html 1/6 thread
Toutes choses étant égales par ailleurs, plus un virus cause des infections longues, plus il survit longtemps dans l’environnement extérieur, plus les personnes infectées on des virémies élevées, plus le #R0 est élevé. C'est la dimension biologique (ou virologique). 2/6
Mais, pour un même virus, la population où il se propage joue un grand déterminant sur la valeur du #R0. Ainsi, le nombre de contacts par personne par unité de temps ou encore la structure des réseaux d'interactions entre les personnes influent sur le #R0. 3/6
Read 6 tweets
+ de 16.000 nouveaux cas
+ de 1000 clusters actifs
101 dépts en vulnérabilité
Hausse constante des hospitalisations et réas
52 décès en 24h

Soyons réalistes: Des #reconfinement (s) sont désormais inévitables.

Employeurs: Privilégiez le #teletravail !

#RH #Coronavirus #Covid19 Image
Le milieu scolaire et universitaire prend la première place du top des nouveaux clusters.

Qui aurait pu prévoir qu'une telle chose se produise ?

C'est une surprise totale, n'est ce pas @jmblanquer ?

#Coronavirus #Covid19 #Ecole #rentreescolaire2020 #rentreescolaire #cluster Image
@jmblanquer Le r0 reste >1, l'épidémie accélère toujours.

SPF indique une possible sous-estimation des cas et des clusters à cause de la saturation des labos.

Les admissions en réa sont en augmentation exponentielle, et 1/3 des réas ont - de 65 ans.

#Coronavirus #Covid19 #R0 #reanimation Image
Read 4 tweets
On parle beaucoup du développement des #vaccins contre le #SARSCoV2 pour prévenir le #COVID19 mais peu de leur mise en place. Cela relève beaucoup du champ scientifique qu’est la dynamique des populations. 1/8 thread
Certains vaccins peuvent être thérapeutiques mais, le plus souvent, comme pour le #COVID19, ils sont à but prophylactique (pour empêcher l’infection). Vous pouvez alors avoir deux cibles : protéger les personnes les plus à risque ou éteindre l’épidémie. 2/8
5 paramètres entrent en jeu : le nombre de reproduction de l’épidémie #R0, l’efficacité de protection du vaccin (P), la fraction de la population vaccinée ou "couverture vaccinale" (C), le risque individuel à la #vaccination (V) et le risque individuel lié à l’infection (I) 3/8
Read 8 tweets
7379 nouveaux cas en 24h. Nouveau record depuis le 11/5
Le taux de positivité monte à 3,9% (3,8% hier)
Entrées en réanimation en hausse.
2 nouveaux départements en vigilance
Données hôpital toujours buggées, mais plus les décès.

#Coronavirus #RH #Covid19 #RestezPrudents Image
Taux d’incidence Paris en baisse : 111,5/10.000 (114,2 hier)
Taux d’incidence Bouches du Rhône : 158,3 (145,8 hier)

L’Essone passe le seuil d’incidence de 50

Taux France : 45 (42,4 hier)

#RH #Coronavirus #Covid19 #RestezPrudents #JamaisSansMonMasque #France #Paris #Marseille ImageImage
Read 5 tweets
Taux d’incidence Paris repart en hausse : 79,6/10.000 (73,5 hier)
Taux d’incidence Bouches du Rhône : 98,6 (85 hier)

L’Herault passe la barre des 50 cas pour 10.000 habitants

Taux France : 28 (25 hier)

#RH #Coronavirus #Covid19 #RestezPrudents #JamaisSansMonMasque #France ImageImageImage
4771 nouveaux cas (un record depuis le 11 mai)
33 nouveaux clusters (autre record)
Hausse du taux de positivité des tests à 3,3% (3% hier)
2 nouveaux départements en vulnérabilité.
Hausse des entrées en réanimation.

#RH #Coronavirus #Covid19 #RestezPrudents #JamaisSansMonMasque Image
Merci @Le___Doc pour le reste du boulot.

(« Gna gna gna » est un terme medical relatifs à certains délires de type psychotiques twitteriens)

#RH #Coronavirus #Covid19 #RestezPrudents #JamaisSansMonMasque #MasquesObligatoires #Paris #Marseille #France

https://t.co/pwQ1x8ZVfH
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Oggi cercherò di fare chiarezza sul tristemente famoso ERRE CON ZERO, ovvero il tasso di riproduzione di base di una #malattia #infettiva.
Si scrive #R0 e indica quante persone contagia mediamente una persona infetta.
Cambia da virus a #virus e non indica la gravità, ma solo il modo in cui si diffonde
Per il #morbillo per esempio è molto alto. Per il #SarsCov2 è più basso.
Quando R0 = 1 ogni persona ne infetta un’altra.
Quando R0 < 1 ovvero minore di 1 l’epidemia va spegnendosi
Quando R0 > 1 ovvero maggiore di 1 va aumentando
Questo ovviamente non significa che ogni persona realmente ne infetta un’altra e basta. Significa che mediamente l’#epidemia si diffonde così, con una media fra chi sta in casa e non infetta nessuno e chi ha una ricca vita sociale
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107 Infizierte in Folge eines Gottesdienstes in Frankfurt!! spiegel.de/panorama/coron…
Eine eindrückliche Meldung, die gut zum Thema meines verlinkten Threads passt– die sehr heterogene #Ansteckungsrate von #Coronavirus #SARSCoV2 #COVID19! Ein paar Worte dazu jetzt auf deutsch!
1/15
In dem langen, sehr guten (aber englischen) Thread von @kakape und auch in dem dort genannten ausgesprochen interessanten Manuskript (covid.idmod.org/data/Stochasti…) geht es in erster Linie darum, wie ungleichmäßig sich das aktuelle #Coronavirus ausbreitet und was das bedeutet.
2/15
In knappen Worten: der #R0-Wert einer Infektion gibt an, wieviele Personen jeder Infizierte IM MITTEL ansteckt. Die Zahl verändert sich im Lauf einer Epidemie (durch #Maßnahmen aber auch durch zunehmende #Immunität) und heisst dann Rt. Für #SARSCoV2 ist R0 grob 2,5.
3/15
Read 18 tweets
Majority of SARS-CoV-2 transmission seems to come from small proportion of cases & in certain settings...
Targeting measures at high transmission risk contexts coupled with tracing of cases is best chance of keeping transmission low without huge disruption.
1/ Image
Here is an excellent paper in @nature by @jlloydsmith et al., on #superspreading and the effect of individual variation on disease emergence and the over distribution of #R0. nature.com/articles/natur…
2/
And here is an excellent piece in @TheLancet by @AdamJKucharski et al., on #SARSCov2 transmission dynamics, 2dary attack rates, & #superspreading events, suggesting most infections driven by a small no. of people in high risk contexts (superspreading)
thelancet.com/journals/lance…
End
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As said in the article, I am keen to engage in a meaningful and constructive dialogue on #COVID19SWEDEN, based on science... so lets explore some of the science in the points raised. svd.se/brittisk-exper… via
@SvD
1. The role of #asymptomatic and #presymptomatic transmission. As previously Tweeted, there are clear examples of #asymptomatic transmission... including through non-household contact: #communitytransmission nejm.org/doi/10.1056/NE…
2. Here is a pre-print of a review which reports multiple examples: medrxiv.org/content/10.110… (as always, caution with pre-prints, but the take home here is there are several published examples)
Read 10 tweets
1/n
What I've learned about #COVID19:
1. We don't want it. It has a death rate 10 to 20X that of flu. It is on average as bad as the 1918 #H1N1 strain in death rate
2. It is highly infectious. The #R0 is 2 or greater without countermeasures
2/n
3. Humans shed the virus even before they have subjective symptoms and this period can last several days.
4. Most people who have symptoms have fever and dry cough.
3/n
5. Even with a good test, some people have tested falsely negative on first test
6. My fellow Americans are culturally and politically focused less on medical science than on psychological projection in an attempt to avoid fear
Read 9 tweets

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