Notre site #COVIDici permet de visualiser l’épidémie de #COVID19 par région et département, ainsi que de visualiser les tendances sur 2 semaines basé sur notre modèle épidémiologique.
Merci à @Occitanie et à @IFB_Bioinfo pour leur aide !
cloudapps.france-bioinformatique.fr/covidici/
1/N #Thread
Merci à @Occitanie et à @IFB_Bioinfo pour leur aide !
cloudapps.france-bioinformatique.fr/covidici/
1/N #Thread
Sur #COVIDici, la courbe n’est pas un bête lissage des données mais issue d’un modèle mécanistique.
Il est donc normal qu’à des endroits les prévisions soient loin des données. Cela permet d'avancer en cherchant pourquoi cet endroit est différent.
medrxiv.org/content/10.110…
2/N
Il est donc normal qu’à des endroits les prévisions soient loin des données. Cela permet d'avancer en cherchant pourquoi cet endroit est différent.
medrxiv.org/content/10.110…
2/N
Le modèle se base sur les admissions quotidiennes en #réanimation. La prévision sur ce chiffre est donc la plus robuste.
Des informations sur la proportion de létalité, l’intervalle sériel, les temps de séjour en réanimation sont ajoutées au modèle.
data.gouv.fr/fr/datasets/do…
3/N
Des informations sur la proportion de létalité, l’intervalle sériel, les temps de séjour en réanimation sont ajoutées au modèle.
data.gouv.fr/fr/datasets/do…
3/N
#COVIDici indique aussi l’incidence et la prévalence pour le nombre d’infections.
Attention, du fait des inconnues concernant la proportion d’asymptomatique, ces valeurs sont à prendre avec précautions.
On voit que a priori toutes les infections ne sont pas dépistées.
4/N
Attention, du fait des inconnues concernant la proportion d’asymptomatique, ces valeurs sont à prendre avec précautions.
On voit que a priori toutes les infections ne sont pas dépistées.
4/N
Sur #COVIDici, vous pouvez visualiser le nombre de personnes vaccinées par département, région et nationalement.
La #couverture_vaccinale sera bientôt intégrée au modèle prévisionnel (mais pour le moment elle ne joue pas vraiment).
data.gouv.fr/fr/datasets/do…
5/N
La #couverture_vaccinale sera bientôt intégrée au modèle prévisionnel (mais pour le moment elle ne joue pas vraiment).
data.gouv.fr/fr/datasets/do…
5/N
#COVIDici montre le nombre de reproduction R(t).
Si R(t)>1, l’épidémie est en croissance exponentielle.
Pour une estimation plus heuristique et actuelle, voire notre site #Rt2 aussi hébergé par l'@IFB_Bioinfo maintenant.
cloudapps.france-bioinformatique.fr/covid19-rt2/
6/N
Si R(t)>1, l’épidémie est en croissance exponentielle.
Pour une estimation plus heuristique et actuelle, voire notre site #Rt2 aussi hébergé par l'@IFB_Bioinfo maintenant.
cloudapps.france-bioinformatique.fr/covid19-rt2/
6/N
La tendance dans les prochaines semaines de #COVIDici extrapole sur le R(t) des 12 (tendance courte) ou 21 (tendance longue) derniers jours.
Avec la tendance courte, vous détectez des changements plus rapidement mais s'ils sont temporaires la prévision sera erronée.
7/N
Avec la tendance courte, vous détectez des changements plus rapidement mais s'ils sont temporaires la prévision sera erronée.
7/N
#COVIDici aide à comprendre l'épidémie et la modélisation. Celle-ci dépend des hypothèses et des données.
Les modèles ne sont qu'une aide à la prise de décision, qui doit inclure d'autres dimensions. Mais les ignorer c’est conduire les yeux bandés.
8/N @threadreaderapp unroll
Les modèles ne sont qu'une aide à la prise de décision, qui doit inclure d'autres dimensions. Mais les ignorer c’est conduire les yeux bandés.
8/N @threadreaderapp unroll
• • •
Missing some Tweet in this thread? You can try to
force a refresh
