Per chi volesse approfondire i temi trattati nel servizio di #PresaDiretta di ieri sera, ho raccolto in questo thread le fonti e i documenti principali citati in trasmissione. 🧵1/
Cominciamo dalla missione dell'#OMS a #Wuhan, all'inizio di quest'anno. Qui trovate il rapporto finale che considera "estremamente improbabile" l'incidente di laboratorio. 2/ who.int/publications/i…
Merita una citazione anche la commissione di indagine @TheLancet messa in piedi da Jeffrey Sachs, che l'ha poi sciolta per problemi relativi ai conflitti di interesse dei suoi partecipanti (in primis quelli di @PeterDaszak che la presiedeva) 6/ archive.md/JDm4u
Ed ecco invece i nomi scelti dall'#OMS per il suo nuovo gruppo #SAGO, che indagherà sulle origini delle epidemie (Covid e non solo). 7/ science.org/content/articl…
Capitolo #mercato del pesce di #Huanan. Le autorità cinesi avevano negato che si vendessero #animali selvatici vivi, ma qualche mese fa è uscito questo articolo. Gli animali c'erano, ma la #Cina non vuole dire quali, quanti e quando erano in vendita. 8/ nature.com/articles/s4159…
A proposito di mercato, in questo articolo firmato da @MichaelWorobey@arambaut et al si mettono in discussione i genomi intermedi tra i due lineage A e B, e si suggerisce che ci siano stati due #spillover distinti. Studio in attesa di peer review. 9/ virological.org/t/evidence-aga…
Qui invece il paper di @jbloom_lab che sostiene di aver scoperto sequenze di SARS-CoV-2 più antiche rispetto a quelle trovate al mercato. 10/ academic.oup.com/mbe/advance-ar…
Se volete farvi un giro (virtuale) al mercato di Huanan, date un'occhiata a questa fantastica mappa interattiva realizzata da @babarlelephant. 11/
Questo invece è un paper del 2016 in cui i ricercatori del #WIV dichiarano di aver lavorato con coronavirus simili alla SARS in BSL2. 13/ journals.asm.org/doi/epub/10.11…
Scoprire che il #WIV lavorava con standard di #biosicurezza così bassi ha stupito alcuni ricercatori. "Io non lavorerei in BSL2 con virus simili alla SARS - dice Ralph #Baric in questa intervista a @techreview - ma ogni Paese ha le sue regole". 14/ archive.md/w4lQ2
In ogni caso, a ottobre 2020 la #Cina ha approvato una nuova legge sulla biosicurezza, che tra le altre cose vieta di vendere al mercato animali di laboratorio (articolo 77). 15/ npc.gov.cn/npc/c30834/202…
Torniamo negli Stati Uniti con la famosa mail scritta a #Fauci da Kristian #Andersen il 1° febbraio 2020, prima che quest'ultimo cambiasse radicalmente idea: "The genome is inconsistent with expectations from evolutionary theory". 16/
Qui una cronaca di quei giorni concitati, tratta dal libro di @JeremyFarrar. All'epoca, Edward Holmes era convinto all'80% che il virus fosse stato ingegnerizzato in laboratorio. 17/ unherd.com/2021/07/how-sc…
E chiudiamo con i progetti di @EcoHealthNYC. Questo è il famoso #DEFUSE proposto alla DARPA, poi non finanziato, in cui proponevano di vaccinare i pipistrelli e di inserire nei coronavirus siti di taglio per la #furina. A scoprirlo il gruppo #DRASTIC. 18/ drasticresearch.org/2021/09/21/the…
A questo proposito segnalo un interessante thread di @stuartjdneil, certamente non un sostenitore del #lableak, che come tanti è rimasto colpito dall'idea di inserire il furin cleavage site. 19/
Questo invece il progetto effettivamente finanziato da @NIH, con gli esperimenti controversi sui topi "umanizzati" che per alcuni sono a tutti gli effetti gain of function. 20/ theintercept.com/2021/09/06/new…
Anthony #Fauci ha sempre negato di aver finanziato esperimenti di gain of function a Wuhan. In questo video il famosissimo dibattito con il senatore repubblicano @RandPaul 21/
Pochi giorni fa però, la stessa NIH ha contestato a @EcoHealthNYC di non averla informata quando una delle #chimere testate aveva mostrato un'aumentata replicazione virale, evento che avrebbe richiesto una seconda valutazione da parte dell'agenzia. 22/
Persino @angie_rasmussen, che li aveva sempre sostenuti, è rimasta sconcertata dallo scoprire che Ecohealth non ha rispettato le regole previste dai finanziatori. 23/
One last thread on the origins of #SARSCoV2 before the upcoming publication of the US intelligence report. First of all, there are two things that might be even more important than the origin itself: research ethics and scientific debate. 1/
Since the beginning, some scientists working in Chinese institutions haven't been fully transparent. The history of #RaTG13 and the issues with its sequencing data, the miners pneumonia, the missing database, the pangolin CoV data. Hiding info, playing with words. Bad science. 2/
The second thing that I didn't like was the suppression of an open dialogue between scientists, which lasted for several months. Now it's easier for scientists to freely talk about the different scenarios, but do you remember how difficult it was one year ago? 3/
THREAD - What happened at the Huanan #seafood market?
The @WHO report is quite clear on this point: #SARSCoV2 might have jumped from a wild animal sold in this market and maybe other markets in #Wuhan. But what do we know exactly? 1/15
After all this time, the Huanan seafood market still remains the main suspect for a simple reason: most of the early cases had visited at least one market in Wuhan city, and several of them visited the Huanan market. 2/15
According to the report, 10,000 people visited this place every day, making it a perfect setting for an #outbreak. One might argue: what about the cases without market exposure? Good question! 3/15
La prima permette a SARS-COV-2 di legarsi meglio al recettore ACE2, in altre parole i virus con questa mutazione riescono a entrare più facilmente nelle nostre cellule. 1/
Variante inglese 🇬🇧 (B.1.1.7), sudafricana 🇿🇦 (B.1.351) e brasiliana 🇧🇷 (P.1) hanno tutte quante la mutazione N501Y.
Probabilmente, è proprio per questo motivo che queste varianti tendono a essere più contagiose. 2/
La E484K, invece, aiuta il virus a sfuggire agli #anticorpi, pertanto potrebbe ridurre in parte l'efficacia dei #vaccini.
La #varianteinglese non ha questa mutazione (per ora), ma brasiliana e sudafricana sì. Per questo sono così temute! 3/
Question for bioinformaticians! Believe it or not, the first genome of bat virus #RaTG13 had some nucleotides that were supported by zero reads: in other words, the genome didn't match the sequences that were used to assemble it. How is it possible? 1/ #originsofSARSCoV2
Assemblers are computer programs, they do not "invent" nucleotides. So, what happened here? My explanation was that this genome was assembled using other reads, maybe in addition to the ones that were uploaded. 2/
In that case, I expected the authors to upload the missing reads.. Instead they did the opposite: they updated the genome, replacing the nucleotides supported by zero reads with the correct ones. So, the question is: how the heck did they assemble the genome the first time? 3/
Conspiracist, May 2020: "Look, these sequences in database are dated 2017/2018. So you didn't sequence RaTG13 this year, as you wrote in the paper!" 🔬
Average scientist, May 2020: 😴
Shi Zhengli, July 2020: "Yes, actually we got the sequence in 2018."
2/
Conspiracist, May 2020: "Have a look at these Chinese theses we found on the internet: RaTG13 was found in a #mineshaft were people died of #pneumonia!" 😱
Average scientist, May 2020: 😴
Shi Zhengli, June 2020: "Oh yes we found it there, but.. well, the cause was a fungus"
3/
Ora, è vero che a Wuhan facevano chimere a scopi di ricerca, ma questi due virus sono troppo diversi da SARS2 per essere i suoi antenati diretti. 2/
Il nuovo #coronavirus infatti ha una similarità dell'87% con questi due virus, troppo poco per essere il risultato di una loro ricombinazione (il virus più simile a SARS2 è #RaTG13). 3/