Notre analyse de la progression des #variants en France à partir de tests réalisés par le laboratoire CERBA et le @CHU_Montpellier est en preprint et en revue.
La carte régionale de la fréquence estimée des variants au 20 fév (scénario conservateur).
medrxiv.org/content/10.110…
1/N
La carte régionale de la fréquence estimée des variants au 20 fév (scénario conservateur).
medrxiv.org/content/10.110…
1/N
Nous avons analysé les facteurs de risques et, comme @SantePubliqueFr trouvons que la proportion de variants est plus élevée chez les plus jeunes.
Cela a aussi été décrit en Angleterre.
On ne peut pas encore trancher entre des raisons biologiques et épidémiologiques.
2/N
Cela a aussi été décrit en Angleterre.
On ne peut pas encore trancher entre des raisons biologiques et épidémiologiques.
2/N
On retrouve moins les variants dans les tests issus de milieux hospitalier (patients #COVID19).
C’est logique car il y a environ 14 jours entre infection et hospitalisation.
Ignorer l'origine des échantillons, c'est sous-estimer la propagation actuelle des #variants !
3/N
C’est logique car il y a environ 14 jours entre infection et hospitalisation.
Ignorer l'origine des échantillons, c'est sous-estimer la propagation actuelle des #variants !
3/N
Attention : 13 % des échantillons ne sont pas criblés car il y trop peu de matériel.
Or, la #charge_virale des infections par les variants est plus élevée.
Si ces 13 % sont causés par des souches non variantes, on a notre scénario conservateur. Sinon il est pessimiste...
4/N
Or, la #charge_virale des infections par les variants est plus élevée.
Si ces 13 % sont causés par des souches non variantes, on a notre scénario conservateur. Sinon il est pessimiste...
4/N
Nous avons utilisé des techniques de biologie de l’évolution (fit d’une courbe logistique) pour estimer l’avantage de propagation des variants.
Résultat, au 20 fév : de 37 à 55 % pour le scénario pessimiste (ce qui est cohérent avec les autres pays).
5/N
Résultat, au 20 fév : de 37 à 55 % pour le scénario pessimiste (ce qui est cohérent avec les autres pays).
5/N
On trouve aussi bien plus de #variant type #B117 que type #B1153/#P1. Ces derniers auraient aussi un avantage plus limité (entre 19 et 33 %).
Voici les cartes régionales (scénario conservateur). On note que le Grand-Est a plus de #B1153/#P1.
Voici les cartes régionales (scénario conservateur). On note que le Grand-Est a plus de #B1153/#P1.
Donc, dans un scénario pessimiste, les #variants seraient majoritaires depuis la fin de la semaine 6 et on risquerait une forte hausse des #hospitalisations dès la semaine prochaine.
Selon une version moins pessimiste, la hausse serait plus limitée et une semaine plus tard.
6/N
Selon une version moins pessimiste, la hausse serait plus limitée et une semaine plus tard.
6/N
Attention, ces analyses ne concernent "que" 40.000 tests réalisés entre le 26 jan et le 20 fév. avec des régions peu représentées (merci à CERBA et au @CHU_Montpellier).
Malheureusement, nous ne pouvons pas réaliser ces analyses sur l'ensemble des données nationales.
7/N
Malheureusement, nous ne pouvons pas réaliser ces analyses sur l'ensemble des données nationales.
7/N
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